Rabaptin - Rabaptin

Rabaptin
1TU3.pdb.png
Krystalografická struktura z C-terminál Rabaptin 5 homodimer domény (zbarvený oranžově a purpurově ve středu obrázku) v komplexu se dvěma nezávislými molekulami GTPáza doména RAB5A (duhová barva, N-konec = modrá, C-konec = červená).[1]
Identifikátory
SymbolRabaptin
PfamPF03528
InterProIPR003914

Rabaptin je klíčový protein podílející se na regenerace zraněných axony.

Regenerace zraněných axony na neuromuskulární spojení je regulován extracelulárními proteinovými faktory, které podporují neurit růst. Nový faktor růstu neuritů z kuřat denervovaný kosterní sval byl klonován a charakterizován. Ukázalo se, že protein, nazývaný neurocrescin (rabaptin), je vylučován způsobem závislým na aktivitě.[2]

Rabaptin je 100 kDa svinutá cívka protein, který interaguje s GTP formou malého GTPáza Rab5 (viz RAB5A, RAB5B, RAB5C ) silný regulátor endocytového transportu.[3] Je hlavně cytosolický, ale zlomek se lokalizuje s Rab5 brzy endozomy. Rab5 rekrutuje rabaptin-5 purifikovat časné endosomy způsobem závislým na GTP, což prokazuje funkční podobnosti s ostatními členy Rasova rodina. Imunodepléce rabaptinu-5 z cytosolu silně inhibuje časný endozom závislý na Rab5 fúze membrány. Rabaptin-5 je tedy Rabovým efektorem požadovaným pro dokování a fúzi membrány.

Rab5 přispívá k časné fúzi endozomů, která funguje prostřednictvím koordinace dalších efektorových proteinů, jak je uvedeno výše. Rabaptinové komponenty mohou sloužit k řízení aktivity SNARE, které jsou životně důležité při membránové fúzi.[4]

Struktura

Krystalová struktura GTPáza doména RAB5A v komplexu s C-terminální doménou Rabaptin 5 bylo stanoveno.[1] Tyto dva proteiny tvoří symetrický ternární komplex RAB5A-Rabaptin5 s rovnoběžkou svinutá cívka Homodimer Rabaptin5 ve středu komplexu se dvěma molekulami Rabaptinu5, jednou na každé straně (viz obrázek vpravo).

Lidské proteiny

RABEP1; RABEP2;

Reference

  1. ^ A b PDB: 1tu3​; Zhu G, Zhai P, Liu J, Terzyan S, Li G, Zhang XC (říjen 2004). "Strukturní základ interakce Rab5-Rabaptin5 v endocytóze". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (10): 975–83. doi:10.1038 / nsmb832. PMID  15378032. S2CID  2680733.
  2. ^ Nishimune H, Uyeda A, Nogawa M, Fujimori K, Taguchi T (1997). „Neurocrescin: nový faktor růstu neuritů vylučovaný svalem po denervaci“. NeuroReport. 8 (16): 3649–3654. doi:10.1097/00001756-199711100-00045. PMID  9427343. S2CID  40104264.
  3. ^ Zerial M, Stenmark H, Vitale G, Ullrich O (1995). „Rabaptin-5 je přímým efektorem malé GTPázy Rab5 při fúzi endocytové membrány“. Buňka. 83 (3): 423–432. doi:10.1016/0092-8674(95)90120-5. PMID  8521472. S2CID  18768939.
  4. ^ Deneka M, Neeft M, Popa I, van Oort M, Sprong H, Oorschot V, Klumperman J, Schu P, van der Sluijs P (červen 2003). „Rabaptin-5alfa / rabaptin-4 slouží jako spojovací článek mezi rab4 a gama (1) -adaptinem v membránové recyklaci z endosomů“. EMBO J.. 22 (11): 2645–57. doi:10.1093 / emboj / cdg257. PMC  156754. PMID  12773381.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR003914