RUFY1 - RUFY1

RUFY1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2RQM, 2RW8
Identifikátory
Aliasy	RUFY1, RABIP4, ZFYVE12, RUN a FYVE doména obsahující 1
Externí ID	OMIM: 610327 MGI: 2429762 HomoloGene: 23522 Genové karty: RUFY1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	179,610,012 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	50,431,125 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba lipidů; • Vazba domény SH3; • Vazba domény SH2;
Buněčná složka	• intracelulární membránou vázaná organela; • membrána; • cytoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna; • časná endosomová membrána; • endosom; • buněčné jádro;
Biologický proces	• transport bílkovin; • endocytóza; • proces biosyntézy fosfatidylinositolu; • regulace endocytózy; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	80230
	216724
	ENSG00000284260; ENSG00000176783
	ENSMUSG00000020375
	Q96T51
	Q8BIJ7
	NM_001040451; NM_001040452; NM_025158
	NM_172557
	NP_001035541; NP_001035542; NP_079434
	NP_766145
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující doménu RUN a FYVE 1 je protein že u lidí je kódován RUFY1 gen.^[5]^[6] Je pojmenována po BĚH a FYVE domény, které obsahuje.

Interakce

Bylo prokázáno, že RUFY1 komunikovat s BMX.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000176783 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000284260, ENSG00000176783 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020375 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Yang J, Kim O, Wu J, Qiu Y (srpen 2002). "Interakce mezi tyrosinkinázou Etk a proteinem RUFY1 obsahujícím doménu RUN a FYVE. Možná role ETK při regulaci obchodování vezikul". J. Biol. Chem. 277 (33): 30219–26. doi:10,1074 / jbc.M111933200. PMID 11877430.
^ „Entrez Gene: RUFY1 RUN a FYVE doména obsahující 1“.

Další čtení

Cormont M, Mari M, Galmiche A, Hofman P, Le Marchand-Brustel Y (2001). „Protein obsahující FYVE-prst, Rabip4, je Rab4 efektor zapojený do raného endozomálního přenosu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (4): 1637–42. doi:10.1073 / pnas.031586998. PMC 29309. PMID 11172003.
Fouraux MA, Deneka M, Ivan V, van der Heijden A, Raymackers J, van Suylekom D, van Venrooij WJ, van der Sluijs P, Pruijn GJ (2004). „Rabip4 'je efektor rab5 a rab4 a reguluje transport přes časné endosomy“. Mol. Biol. Buňka. 15 (2): 611–24. doi:10,1091 / mbc.E03-05-0343. PMC 329268. PMID 14617813.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000176783 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000284260, ENSG00000176783 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020375 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11877430-5] A ^b Yang J, Kim O, Wu J, Qiu Y (srpen 2002). "Interakce mezi tyrosinkinázou Etk a proteinem RUFY1 obsahujícím doménu RUN a FYVE. Možná role ETK při regulaci obchodování vezikul". J. Biol. Chem. 277 (33): 30219–26. doi:10,1074 / jbc.M111933200. PMID 11877430.

[entrez-6] „Entrez Gene: RUFY1 RUN a FYVE doména obsahující 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]