RNF5 - RNF5 - Wikipedia

RNF5
Identifikátory
Aliasy	RNF5, RING5, RMA1, protein prstového prstu 5
Externí ID	OMIM: 602677 MGI: 1860076 HomoloGene: 56004 Genové karty: RNF5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,180,793 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu konjugujícího s proteinem podobným ubikvitinu; • aktivita transferázy; • identická vazba na protein; • vazba iontů zinku; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • mitochondriální membrány; • membrána; • mitochondrie; • Komplex retrotranslokace Derlin-1; • endoplazmatické retikulum; • membrána endoplazmatického retikula; • oddělení kontroly kvality endoplazmatického retikula;
Biologický proces	• reakce na bakterii; • ubikvitinace spojená s proteinem K63; • Špatně složený proteinový katabolický proces spojený s ER; • buněčný proteinový katabolický proces; • regulace sestavování autofagozomu; • ubikvitinace spojená s proteinem K48; • destabilizace bílkovin; • ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace autofagie; • transmembránová doprava; • ořezávání manózy endoplazmatickým retikulem; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • Cesta ERAD; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6048
	54197
ENSG00000227277; ENSG00000223767; ENSG00000228907; ENSG00000183574; ENSG00000204308;
	ENSG00000225452; ENSG00000228405
	ENSMUSG00000015478
	Q99942
	O35445
	NM_006913
	NM_019403
	NP_008844
	NP_062276
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza RNF5 je enzym že u lidí je kódován RNF5 gen.^[4]^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem obsahuje a Prsteník, což je motiv, o kterém je známo, že se účastní interakcí protein-protein. Tento protein je vázán na membránu ubikvitin ligáza. Může regulovat pohyblivost buněk cílením paxillin ubikvitinace a změna distribuce a lokalizace paxilinu v cytoplazmě a buňce fokální adheze.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000183574, ENSG00000204308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000227277, ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kyushiki H, Kuga Y, Suzuki M, Takahashi E, Horie M (duben 1998). „Klonování, exprese a mapování nového genu pro prst RING (RNF5), lidského homologu domnělého genu pro zinkový prst z Caenorhabditis elegans“. Cytogenetika a genetika buněk. 79 (1–2): 114–7. doi:10.1159/000134695. PMID 9533025.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RNF5 protein prstového proteinu 5“.

Další čtení

Kendall E, Sargent CA, Campbell RD (prosinec 1990). „Hlavní lidský histokompatibilní komplex obsahuje novou shluk genů mezi lokusy HLA-D a komplementem C4“. Výzkum nukleových kyselin. 18 (24): 7251–7. doi:10.1093 / nar / 18.24.7251. PMC 332860. PMID 2259622.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Barritt DS, Pearn MT, Zisch AH, Lee SS, Javier RT, Pasquale EB, Stallcup WB (srpen 2000). „Protein MUPP1 s více doménami PDZ je cytoplazmatický ligand pro membránový proteoglykan NG2.“. Journal of Cellular Biochemistry. 79 (2): 213–24. doi:10.1002 / 1097-4644 (20001101) 79: 2 <213 :: AID-JCB50> 3.0.CO; 2-G. PMC 3501957. PMID 10967549.
Matsuda N, Suzuki T, Tanaka K, Nakano A (květen 2001). „Rma1, nový typ prstového proteinu RING konzervovaného z Arabidopsis na člověka, je ubikvitin ligáza vázaná na membránu“. Journal of Cell Science. 114 (Pt 10): 1949–1957. PMID 11329381.
Pouly S, Prat A, Blain M, Olivier A, Antel J (říjen 2001). "NG2 imunoreaktivita na endoteliálních buňkách lidského mozku". Acta Neuropathologica. 102 (4): 313–20. doi:10,1007 / s004010000350. PMID 11603805. S2CID 1353236.
Didier C, Broday L, Bhoumik A, izraelský S, Takahashi S, Nakayama K, Thomas SM, Turner CE, Henderson S, Sabe H, Ronai Z (srpen 2003). „RNF5, protein prstenů RING, který reguluje buněčnou pohyblivost zaměřením na ubikvitinaci paxillinu a změněnou lokalizaci“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (15): 5331–45. doi:10.1128 / MCB.23.15.5331-5345.2003. PMC 165736. PMID 12861019.
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (prosinec 2003). „Analýza oblasti genově hustého hlavního histokompatibilního komplexu třídy III a její srovnání s myší“. Výzkum genomu. 13 (12): 2621–36. doi:10,1101 / gr. 1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Liu AM, Wong YH (prosinec 2004). „G16 zprostředkovaná aktivace nukleárního faktoru kappaB receptorem adenosinu A1 zahrnuje c-Src, proteinovou kinázu C a ERK signalizaci“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (51): 53196–204. doi:10,1074 / jbc.M410196200. PMID 15485865.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (březen 2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Zhang Y, Higashide W, Dai S, Sherman DM, Zhou D (listopad 2005). "Rozpoznání a ubikvitinace efektoru SopA Salmonella typu III ligandem ubikvitin E3, HsRMA1". The Journal of Biological Chemistry. 280 (46): 38682–8. doi:10,1074 / jbc.M506309200. PMID 16176924.
Younger JM, Chen L, Ren HY, Rosser MF, Turnbull EL, Fan CY, Patterson C, Cyr DM (August 2006). "Sekvenční kontrolní body kontroly kvality třídí nesprávně poskládaný transmembránový regulátor vodivosti cystické fibrózy". Buňka. 126 (3): 571–82. doi:10.1016 / j.cell.2006.06.041. PMID 16901789. S2CID 51698.
Bromberg KD, Kluger HM, Delaunay A, Abbas S, DiVito KA, Krajewski S, Ronai Z (září 2007). „Zvýšená exprese E3 ubikvitinové ligázy RNF5 je spojena se sníženým přežitím u rakoviny prsu“. Výzkum rakoviny. 67 (17): 8172–9. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-0045. PMC 2962863. PMID 17804730.
Fujita Y, Khateb A, Li Y, Tinoco R, Zhang T, Bar-Yoseph H, Tam MA, Chowers Y, Sabo E, Gerassy-Vainberg S, Starosvetsky E, James B, Brown K, Shen-Orr SS, Bradley LM , Tessier PA, Ronai ZA (září 2018). „Regulace stability S100A8 pomocí RNF5 v buňkách střevního epitelu určuje zánět střev a závažnost kolitidy“. Zprávy buněk. 24 (12): 3296–3311.e6. doi:10.1016 / j.celrep.2018.08.057. PMC 6185744. PMID 30232010.

externí odkazy

RNF5 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000183574, ENSG00000204308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000227277, ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, ENSG00000228907, - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9533025-4] Kyushiki H, Kuga Y, Suzuki M, Takahashi E, Horie M (duben 1998). „Klonování, exprese a mapování nového genu pro prst RING (RNF5), lidského homologu domnělého genu pro zinkový prst z Caenorhabditis elegans“. Cytogenetika a genetika buněk. 79 (1–2): 114–7. doi:10.1159/000134695. PMID 9533025.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RNF5 protein prstového proteinu 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]