RNF38 - RNF38

RNF38
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X4J, 4V3K, 4V3L
Identifikátory
Aliasy	RNF38, protein z prstů 38
Externí ID	OMIM: 612488 MGI: 1920719 HomoloGene: 32550 Genové karty: RNF38
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	36,487,548 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	44,233,789 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• spermie bičík; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• vývoj mužských pohlavních žláz; • ubikvitinace bílkovin; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	152006
	73469
	ENSG00000137075
	ENSMUSG00000035696
	Q9H0F5
	Q8BI21
NM_022781; NM_194328; NM_194329; NM_194330; NM_194331;
	NM_194332
NM_001038993; NM_175201; NM_001355181; NM_001379574; NM_001379575;
	NM_001379576; NM_001379577; NM_001379578; NM_001379579; NM_001379580; NM_001379581
	NP_073618; NP_919309; NP_919310; NP_919311; NP_919313
NP_001034082; NP_780410; NP_001342110; NP_001366503; NP_001366504;
	NP_001366505; NP_001366506; NP_001366507; NP_001366508; NP_001366509; NP_001366510
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Prstýnkový prstový protein 38 je protein že u lidí je kódován RNF38 gen.^[5]

Tento gen kóduje protein s motivem coiled-coil a motivem RING-H2 (C3H2C2) na svém karboxy-konci. Motiv RING je doména vázající zinek nacházející se ve velké sadě proteinů hrajících roli v různých buněčných procesech včetně onkogeneze, vývoje, signální transdukce a apoptózy. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty kódující různé izoformy.^[5]

Viz také

Prst doména prsten

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137075 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035696 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RNF38 protein prstového proteinu 38“.

Další čtení

Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415 – D418. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–2144. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–374. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Eisenberg I, Hochner H, Levi T a kol. (2002). "Klonování a charakterizace nového lidského genu RNF38 kódujícího konzervativní putativní protein s prstenovou doménou RING". Biochem. Biophys. Res. Commun. 294 (5): 1169–1176. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00584-3. PMID 12074600.
Xu XR, Huang J, Xu ZG a kol. (2002). „Pohled na hepatocelulární karcinogenezi na úrovni transkriptomů porovnáním profilů genové exprese hepatocelulárního karcinomu s profily odpovídajících nerakovinných jater“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (26): 15089–15094. doi:10.1073 / pnas.241522398. PMC 64988. PMID 11752456.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–435. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–1795. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.

externí odkazy

RNF38 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137075 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035696 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RNF38 protein prstového proteinu 38“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]