RFC5 - RFC5

RFC5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1LFS
Identifikátory
Aliasy	RFC5, RFC36, replikační faktor C podjednotka 5
Externí ID	OMIM: 600407 MGI: 1919401 HomoloGene: 6730 Genové karty: RFC5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	118,033,130 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba DNA; • GO: 0043142 aktivita jednořetězcové DNA helikázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba enzymu; • Aktivita zavaděče DNA;
Buněčná složka	• Komplex faktoru C replikace DNA; • Komplex podobný Ctf18 RFC; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• oprava nukleotidovou excizí, vyplnění mezery DNA; • bezchybná syntéza překladu; • syntéza překladu náchylná k chybám; • pozitivní regulace aktivity DNA polymerázy řízené DNA; • syntéza překladů; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • replikace DNA; • Oprava DNA; • údržba telomer prostřednictvím semi-konzervativní replikace; • Replikace DNA závislá na DNA; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5985
	72151
	ENSG00000111445
	ENSMUSG00000029363
	P40937
	Q9D0F6
NM_001130112; NM_001130113; NM_001206801; NM_007370; NM_181578;
	NM_001346815
	NM_028128
NP_001123584; NP_001123585; NP_001193730; NP_001333744; NP_031396;
	NP_853556
	NP_082404
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Replikační faktor C podjednotka 5 je protein že u lidí je kódován RFC5 gen.^[4]^[5]

Funkce

Prodloužení připraven Šablony DNA od Delta DNA polymerázy a DNA polymeráza epsilon vyžaduje doplňkové proteiny proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) a replikační faktor C. (RFC). RFC, také nazývaný aktivátor 1, je proteinový komplex skládající se z pěti odlišných podjednotek 140, 40, 38, 37 a 36 kD. Tento gen kóduje 36 kD podjednotku. Tato podjednotka může interagovat s C-terminál oblast PCNA. Tvoří jádrový komplex s podjednotkami 38 a 40 kDa. Jádrový komplex vlastní ATPáza závislá na DNA aktivita, u které bylo zjištěno, že je stimulována PCNA v systému in vitro. Alternativně sestříhané Byly hlášeny varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[5]

Interakce

RFC5 bylo prokázáno komunikovat s:

BRD4,^[6]
CHTF18,^[7]
PCNA,^[8]^[9]^[10]
RFC2,^[8]^[11] a
RFC4.^[8]^[11]^[12]^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111445 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Okumura K, Nogami M, Taguchi H, Dean FB, Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J, Shiratori A, Murakami Y, Ozawa K (leden 1995). „Přiřazení genů podjednotky 36,5-kDa (RFC5), 37-kDa (RFC4), 38-kDa (RFC3) a 40-kDa (RFC2) lidského replikačního faktoru C do pásem chromozomů 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 a 7q11.23 ". Genomika. 25 (1): 274–8. doi:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RFC5 replication factor C (activator 1) 5, 36.5kDa“.
^ Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (září 2002). „Savčí bromodoménový protein, brd4, interaguje s replikačním faktorem C a inhibuje postup do S fáze“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (18): 6509–20. doi:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049.
^ Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (září 2003). „Alternativní komplex Ctf18-Dcc1-Ctf8-replikační faktor C požadovaný pro kohezi sesterských chromatid naloží proliferující buněčný jaderný antigen na DNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (18): 10237–42. doi:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.
^ ^A ^b ^C Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J. (červenec 1997). „Komplex skládající se z podjednotek lidského replikačního faktoru C p40, p37 a p36 je DNA-dependentní ATPáza a meziprodukt při sestavování holoenzymu.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (30): 18974–81. doi:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
^ Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (leden 1997). „Replikační faktor C interaguje s C-koncovou stranou nukleárního antigenu proliferujících buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (3): 1769–76. doi:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
^ ^A ^b Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (září 1998). „Hydrolýza ATP katalyzovaná lidským replikačním faktorem C vyžaduje účast více podjednotek“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (20): 11607–12. doi:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Ellison V, Stillman B (březen 1998). „Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace subkomplexu RFC s aktivitou ATPázy závislou na DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5979–87. doi:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

Další čtení

O'Donnell M, Onrust R, Dean FB, Chen M, Hurwitz J (leden 1993). "Homologie v doplňkových proteinech replikativních polymeráz - E. coli k lidem". Výzkum nukleových kyselin. 21 (1): 1–3. doi:10.1093 / nar / 21.1.1. PMC 309057. PMID 8441605.
Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (červen 1996). „Rekonstituce lidského replikačního faktoru C z jeho pěti podjednotek in vitro“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (13): 6521–6. doi:10.1073 / pnas.93.13.6521. PMC 39056. PMID 8692848.
Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (leden 1997). „Replikační faktor C interaguje s C-koncovou stranou nukleárního antigenu proliferujících buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (3): 1769–76. doi:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (duben 1997). „Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (4): 1817–23. doi:10.1128 / mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J. (červenec 1997). „Komplex skládající se z podjednotek lidského replikačního faktoru C p40, p37 a p36 je DNA-dependentní ATPáza a meziprodukt při sestavování holoenzymu.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (30): 18974–81. doi:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (prosinec 1997). „Identifikace replikace DNA a proteinů buněčného cyklu, které interagují s PCNA“. Výzkum nukleových kyselin. 25 (24): 5041–6. doi:10.1093 / nar / 25.24.5041. PMC 147130. PMID 9396813.
Ellison V, Stillman B (březen 1998). „Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace subkomplexu RFC s aktivitou ATPázy závislou na DNA“ (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5979–87. doi:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738. S2CID 17647091.
Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (září 1998). „Hydrolýza ATP katalyzovaná lidským replikačním faktorem C vyžaduje účast více podjednotek“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (20): 11607–12. doi:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.
Zhang G, Gibbs E, Kelman Z, O'Donnell M, Hurwitz J (březen 1999). „Studie interakcí mezi lidským replikačním faktorem C a jaderným antigenem proliferujících buněk člověka“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (5): 1869–74. doi:10.1073 / pnas.96.5.1869. PMC 26703. PMID 10051561.
Lindsey-Boltz LA, Bermudez VP, Hurwitz J, Sancar A (září 2001). "Purifikace a charakterizace kontrolního bodu poškození lidské DNA Rad komplexů". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (20): 11236–41. doi:10.1073 / pnas.201373498. PMC 58713. PMID 11572977.
Griffith JD, Lindsey-Boltz LA, Sancar A (květen 2002). „Struktury lidského komplexu Rad17-replikačního faktoru C a kontrolního bodu Rad 9-1-1 vizualizované glycerolovým postřikem / mikroskopií nízkého napětí“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (18): 15233–6. doi:10.1074 / jbc.C200129200. PMID 11907025.
Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (září 2002). „Savčí bromodoménový protein, brd4, interaguje s replikačním faktorem C a inhibuje postup do S fáze“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (18): 6509–20. doi:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049.
Venclovas C, Colvin ME, Thelen MP (říjen 2002). „Analýza interakcí založená na molekulárním modelování v procesu načítání pomocí svorek závislých na RFC“. Věda o bílkovinách. 11 (10): 2403–16. doi:10.1110 / ps.0214302. PMC 2373712. PMID 12237462.
Merkle CJ, Karnitz LM, Henry-Sánchez JT, Chen J (srpen 2003). "Klonování a charakterizace hCTF18, hCTF8 a hDCC1. Lidské homology komplexu Saccharomyces cerevisiae zapojené do vytváření sesterské chromatidy". The Journal of Biological Chemistry. 278 (32): 30051–6. doi:10,1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.
Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (září 2003). „Alternativní komplex Ctf18-Dcc1-Ctf8-replikační faktor C požadovaný pro kohezi sesterských chromatid naloží proliferující buněčný jaderný antigen na DNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (18): 10237–42. doi:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.
Zou L, Liu D, Elledge SJ (listopad 2003). „Nábor a aktivace komplexů Rad17 zprostředkovaný replikačním proteinem A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (24): 13827–32. doi:10.1073 / pnas.2336100100. PMC 283506. PMID 14605214.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111445 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7774928-4] Okumura K, Nogami M, Taguchi H, Dean FB, Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J, Shiratori A, Murakami Y, Ozawa K (leden 1995). „Přiřazení genů podjednotky 36,5-kDa (RFC5), 37-kDa (RFC4), 38-kDa (RFC3) a 40-kDa (RFC2) lidského replikačního faktoru C do pásem chromozomů 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 a 7q11.23 ". Genomika. 25 (1): 274–8. doi:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RFC5 replication factor C (activator 1) 5, 36.5kDa“.

[pmid12192049-6] Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (září 2002). „Savčí bromodoménový protein, brd4, interaguje s replikačním faktorem C a inhibuje postup do S fáze“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (18): 6509–20. doi:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049.

[pmid12930902-7] Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (září 2003). „Alternativní komplex Ctf18-Dcc1-Ctf8-replikační faktor C požadovaný pro kohezi sesterských chromatid naloží proliferující buněčný jaderný antigen na DNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (18): 10237–42. doi:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.

[pmid9228079-8] A ^b ^C Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J. (červenec 1997). „Komplex skládající se z podjednotek lidského replikačního faktoru C p40, p37 a p36 je DNA-dependentní ATPáza a meziprodukt při sestavování holoenzymu.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (30): 18974–81. doi:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.

[pmid8999859-9] Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (leden 1997). „Replikační faktor C interaguje s C-koncovou stranou nukleárního antigenu proliferujících buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (3): 1769–76. doi:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.

[pmid12171929-10] Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

[pmid9751713-11] A ^b Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (září 1998). „Hydrolýza ATP katalyzovaná lidským replikačním faktorem C vyžaduje účast více podjednotek“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (20): 11607–12. doi:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.

[pmid16189514-12] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid9488738-13] Ellison V, Stillman B (březen 1998). „Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace subkomplexu RFC s aktivitou ATPázy závislou na DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5979–87. doi:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]