REXO2 - REXO2 - Wikipedia

REXO2
Identifikátory
Aliasy	REXO2, REX2, RFN, SFN, CGI-114, RNA exonukleáza 2
Externí ID	OMIM: 607149 MGI: 1888981 HomoloGene: 6447 Genové karty: REXO2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	114,450,279 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	48,480,623 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita nukleázy; • aktivita exonukleázy; • aktivita hydrolázy; • Aktivita 3'-5 'exonukleázy; • vazba nukleové kyseliny; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondriální matice; • mitochondriální mezimembránový prostor; • jádro; • buněčné jádro; • ohnisková adheze; • mitochondrie;
Biologický proces	• metabolický proces složený z nukleobáze; • nukleotidový metabolický proces; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25996
	104444
	ENSG00000076043
	ENSMUSG00000032026
	Q9Y3B8
	Q9D8S4
	NM_015523
	NM_024233; NM_001357501; NM_001357503; NM_001357505
	NP_056338
	NP_077195; NP_001344430; NP_001344432; NP_001344434
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

REX2, homolog RNA exonukleázy 2 (S. cerevisiae), také známý jako REXO2, je enzym který je u lidí kódován REXO2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Nukleázy jsou složky metabolismu DNA a RNA, které vykonávají funkce při opravě, replikaci a rekombinaci DNA a při zpracování a degradaci RNA. SFN je homolog společnosti Orn, a 3-prime-to-5-prime exoribonukleáza z E-coli který napadá volnou 3-primární hydroxylovou skupinu na jednovláknové RNA a uvolňuje 5-primární mono-nukleotidy postupně.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076043 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032026 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: REXO2 REX2, homolog RNA exonukleázy 2 (S. cerevisiae)“.
^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (květen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
^ Nguyen LH, Erzberger JP, Root J, Wilson DM (srpen 2000). „Lidský homolog Escherichia coli Orn degraduje malé jednovláknové RNA a DNA oligomery“. J. Biol. Chem. 275 (34): 25900–6. doi:10,1074 / jbc.M002672200. PMID 10851236.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Nguyen LH, Erzberger JP, Root J, Wilson DM (2000). „Lidský homolog Escherichia coli Orn degraduje malé jednovláknové RNA a DNA oligomery“. J. Biol. Chem. 275 (34): 25900–6. doi:10,1074 / jbc.M002672200. PMID 10851236.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Ito S, Kita K, Zhai L a kol. (2006). „Zapojení nukleázy lidského malého fragmentu do rezistence lidských buněk proti buněčné smrti indukované UV-C“. Photochem. Fotobiol. 80 (2): 281–5. doi:10.1562 / 2004-01-21-RA-051. PMID 15362935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076043 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032026 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: REXO2 REX2, homolog RNA exonukleázy 2 (S. cerevisiae)“.

[pmid10810093-6] Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (květen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.

[pmid10851236-7] Nguyen LH, Erzberger JP, Root J, Wilson DM (srpen 2000). „Lidský homolog Escherichia coli Orn degraduje malé jednovláknové RNA a DNA oligomery“. J. Biol. Chem. 275 (34): 25900–6. doi:10,1074 / jbc.M002672200. PMID 10851236.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]