RBM3 - RBM3

RBM3
Identifikátory
Aliasy	RBM3, IS1-RNPL, RNPL, protein vázající motiv RNA (RNP1, RRM) protein 3, protein vázající motiv RNA
Externí ID	OMIM: 300027 MGI: 3642874 HomoloGene: 31404 Genové karty: RBM3
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	48,581,162 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • mRNA 3'-UTR vazba; • poly (U) RNA vazba; • aktivita represoru překladu; • ribozomální velká podjednotková vazba; • vazba rRNA na malou ribozomální podjednotku;
Buněčná složka	• cytoplazma; • velká ribozomální podjednotka; • dendrit; • buněčná projekce; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • spliceosomální komplex; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Zpracování RNA; • regulace překladu; • pozitivní regulace překladu; • reakce na chlad; • negativní regulace překladu; • pozitivní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5935
	100043257
	ENSG00000102317
	n / a
	P98179
	n / a
	NM_001017430; NM_001017431; NM_006743
	n / a
	NP_006734
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Předpokládaný protein vázající RNA 3 je protein že u lidí je kódován RBM3 gen.^[4]^[5]

Funkce

Tento gen je členem glycin obohacuje rodinu proteinů vázajících RNA a kóduje protein s jednou doménou rozpoznávajícího motiv RNA (RRM). Exprese tohoto genu je vyvolána chladovým šokem a nízkým napětím kyslíku. A pseudogen existuje na chromozomu 1. Alternativní transkripční sestřihové varianty, kódující různé izoformy, byly charakterizovány.^[5]

RBM3 je za studena indukovaný protein vázající RNA a podílí se na biogenezi mRNAapoptotický účinky.^[6] Podle protilátka - na základě profilování a transkriptomika Při analýze je protein RBM3 přítomen ve všech analyzovaných lidských tkáních^[7] a na základě konfokální mikroskopie lokalizováno hlavně do nukleoplazma.^[8]

Klinický význam

RBM3 je protoonkogen která je spojena s progresí nádoru a metastázami a je potenciální rakovinou biomarker.^[6] Na základě údajů o přežití pacientů jsou vysoké hladiny proteinu RBM3 v nádorových buňkách příznivé prognostický biomarker v kolorektální karcinom.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102317 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Derry JM, Kerns JA, Francke U (prosinec 1995). "RBM3, nový lidský gen v Xp11.23 s domnělou doménou vázající RNA". Lidská molekulární genetika. 4 (12): 2307–11. doi:10,1093 / hmg / 4,12,2307. PMID 8634703.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RBM3 RNA vazebný motiv (RNP1, RRM) protein 3".
^ ^A ^b Zhou RB, Lu XL, Zhang CY, Yin DC (březen 2017). "RNA vázající motivový protein 3: potenciální biomarker u rakoviny a terapeutický cíl v neuroprotekci". Cílový cíl. 8 (13): 22235–22250. doi:10,18632 / oncotarget.14755. PMC 5400660. PMID 28118608.
^ "Tkáňový výraz RBM3 - shrnutí". Atlas lidského proteinu.
^ "Atlas buněk - RBM3". Atlas lidského proteinu.
^ "Exprese RBM3 u rakoviny - shrnutí". Atlas lidského proteinu.

Další čtení

Danno S, Nishiyama H, Higashitsuji H, Yokoi H, Xue JH, Itoh K, Matsuda T, Fujita J (červenec 1997). „Zvýšená hladina transkriptu RBM3, člena rodiny proteinů vázajících RNA bohatou na glycin, v lidských buňkách v reakci na chladový stres“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 236 (3): 804–7. doi:10.1006 / bbrc.1997.7059. PMID 9245737.
Chappell SA, Mauro VP (září 2003). „Vnitřní místo vstupu ribozomu (IRES) obsažené v mRNA proteinu vázajícího RNA 3 (Rbm3) je složeno z funkčně odlišných prvků“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (36): 33793–800. doi:10,1074 / jbc.M303495200. PMID 12824175.
Wellmann S, Bührer C, Moderegger E, Zelmer A, Kirschner R, Koehne P, Fujita J, Seeger K (duben 2004). „Kyslíkem regulovaná exprese proteinů RBM3 a CIRP vázajících RNA mechanismem nezávislým na HIF-1“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 9): 1785–94. doi:10.1242 / jcs.01026. PMID 15075239.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (květen 2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Analytická chemie. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Dellis S, Strickland KC, McCrary WJ, Patel A, Stocum E, Wright CF (listopad 2004). "Interakce proteinů mezi faktory pozdní transkripce viru vakcínie". Virologie. 329 (2): 328–36. doi:10.1016 / j.virol.2004.08.017. hdl:10161/15063. PMID 15518812.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Ong SE, Mittler G, Mann M (listopad 2004). "Identifikace a kvantifikace methylačních míst in vivo těžkým methyl SILAC". Přírodní metody. 1 (2): 119–26. doi:10.1038 / nmeth715. PMID 15782174.
Martínez-Arribas F, Agudo D, Pollán M, Gómez-Esquer F, Díaz-Gil G, Lucas R, Schneider J (duben 2006). „Pozitivní korelace mezi expresí genů RBM chromozomu X (RBMX, RBM3, RBM10) a proapoptotickým genem Bax u lidské rakoviny prsu“. Journal of Cellular Biochemistry. 97 (6): 1275–82. doi:10.1002 / jcb.20725. PMID 16552754.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102317 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8634703-4] Derry JM, Kerns JA, Francke U (prosinec 1995). "RBM3, nový lidský gen v Xp11.23 s domnělou doménou vázající RNA". Lidská molekulární genetika. 4 (12): 2307–11. doi:10,1093 / hmg / 4,12,2307. PMID 8634703.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: RBM3 RNA vazebný motiv (RNP1, RRM) protein 3".

[Zhou_2017-6] A ^b Zhou RB, Lu XL, Zhang CY, Yin DC (březen 2017). "RNA vázající motivový protein 3: potenciální biomarker u rakoviny a terapeutický cíl v neuroprotekci". Cílový cíl. 8 (13): 22235–22250. doi:10,18632 / oncotarget.14755. PMC 5400660. PMID 28118608.

[7] "Tkáňový výraz RBM3 - shrnutí". Atlas lidského proteinu.

[8] "Atlas buněk - RBM3". Atlas lidského proteinu.

[9] "Exprese RBM3 u rakoviny - shrnutí". Atlas lidského proteinu.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]