RBM12 - RBM12

RBM12

Protein RBM12 PDB 1wel.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1 WEL, 2CPY, 2DNN, 2EK1, 2EK6

Identifikátory

RBM12, HRIHFB2091, SWAN, protein vázající motiv RNA 12, SCZD19

Externí ID

OMIM: 607179 MGI: 1922960 HomoloGene: 34993 Genové karty: RBM12

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 20 (lidský)^[1]

Kapela	20q11.22	Start	35,648,925 bp^[1]
Kapela	20q11.22	Konec	35,664,956 bp^[1]

Druh

Člověk

Myš


10137


75710


ENSG00000244462


ENSMUSG00000089824


Q9NTZ6


Q8R4X3

RefSeq (mRNA)


NM_152838 NM_001198838 NM_001198840 NM_006047


NM_029397 NM_170598

RefSeq (protein)


NP_001185767 NP_001185769 NP_006038 NP_690051


NP_083673 NP_733486

Místo (UCSC)

Chr 20: 35,65 - 35,66 Mb

n / a

PubMed Vyhledávání

^[2]

^[3]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Protein vázající RNA 12 je protein že u lidí je kódován RBM12 gen.^[4]^[5]

Tento gen kóduje protein, který obsahuje několik RNA -vázací motivy, potenciál transmembránové domény, a prolin - bohaté regiony. Tento gen a gen pro copine I překrytí v místě mapy 20q11.21. Alternativní sestřih v 5 'UTR má za následek dvě varianty přepisu. Obě varianty kódují stejný protein.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000244462 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Stover C, Gradl G, Jentsch I, Speicher MR, Wieser R, Schwaeble W (červenec 2001). "cDNA klonování, přiřazení chromozomů a genomová struktura lidského genu kódujícího nový člen rodiny RBM". Cytogenet Cell Genet. 92 (3–4): 225–30. doi:10.1159/000056908. PMID 11435693. S2CID 20555964.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RBM12 RNA vázající motivový protein 12".

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Kofler M, Motzny K, Freund C (2006). „Proteomika domény GYF odhaluje interakční místa ve známých a nových cílových proteinech“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (11): 1797–811. doi:10,1074 / mcp.M500129-MCP200. PMID 16120600.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
Ueki N, Oda T, Kondo M a kol. (1999). "Selekční systém pro geny kódující proteiny zaměřené na jadernou energii". Nat. Biotechnol. 16 (13): 1338–42. doi:10.1038/4315. PMID 9853615. S2CID 20001769.

externí odkazy

RBM12 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
RBM12 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Galerie PDB
1wel: Struktura řešení domény vázající RNA v NP_006038 2cpy: struktura struktury vazebné domény 3 RNA v proteinu vázajícího RNA 12 2cqp: Struktura řešení vazebné domény RNA proteinu vázajícího RNA 12 2dnn: Struktura řešení vazebné domény RNA v proteinu vázajícím RNA 12

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.