RBBP6 - RBBP6 - Wikipedia

RBBP6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2C7H, 2YSA, 2YUR, 3ZTG
Identifikátory
Aliasy	RBBP6, MY038, P2P-R, PACT, RBQ-1, SNAMA, protein vázající retinoblastom 6, protein vázající RB 6, ubikvitin ligáza
Externí ID	OMIM: 600938 MGI: 894835 HomoloGene: 136812 Genové karty: RBBP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	24,572,863 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	123,002,557 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba iontů zinku; • vazba nukleové kyseliny; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy; • Vazba RNA; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• jádro; • organizační centrum mikrotubulů; • buněčné jádro; • chromozóm; • cytoplazma; • cytoskelet; • cytosol; • centrosome; • jaderná skvrna; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• v embryonálním vývoji dělohy; • vývoj embryonálních orgánů; • regulace replikace DNA; • replikace DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • ubikvitinace bílkovin; • růst mnohobuněčných organismů; • vývoj somitů; • Zpracování mRNA; • polyubikvitinace bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5930
	19647
	ENSG00000122257
	ENSMUSG00000030779
	Q7Z6E9
	P97868
	NM_006910; NM_018703; NM_032626
	NM_011247; NM_175023
	NP_008841; NP_061173; NP_116015
	NP_035377; NP_778188
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající retinoblastom 6 je protein že u lidí je kódován RBBP6 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein potlačující nádor retinoblastomu (pRB) se váže s mnoha dalšími proteiny. U různých lidských rakovin pRB potlačuje buněčnou proliferaci a je inaktivován. Fosforylace závislá na buněčném cyklu reguluje aktivitu pRB. Tento gen kóduje protein, který se váže na podfosforylovaný, ale ne fosforylovaný pRB. Pro tento gen bylo nalezeno několik alternativně sestřižených variant transkriptu, které kódují různé izoformy.^[7]

Interakce

RBBP6 bylo prokázáno komunikovat s Y box vázající protein 1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122257 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030779 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sakai Y, Saijo M, Coelho K, Kishino T, Niikawa N, Taya Y (listopad 1995). "sekvence cDNA a chromozomální lokalizace nového lidského proteinu, RBQ-1 (RBBP6), který se váže na produkt genu pro retinoblastom". Genomika. 30 (1): 98–101. doi:10.1006 / geno.1995.0017. PMID 8595913.
^ Pugh DJ, Ab E, Faro A, Lutya PT, Hoffmann E, Rees DJ (únor 2006). „DWNN, nová doména podobná ubikvitinu, implikuje RBBP6 při zpracování mRNA a drah podobných ubikvitinu“. BMC strukturní biologie. 6: 1. doi:10.1186/1472-6807-6-1. PMC 1360078. PMID 16396680.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RBBP6 retinoblastoma binding protein 6“.
^ Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Rees DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (prosinec 2008). „RBBP6 interaguje s multifunkčním proteinem YB-1 prostřednictvím své prstové domény RING, což vede k ubikvitinaci a proteosomální degradaci YB-1“. Journal of Molecular Biology. 384 (4): 908–16. doi:10.1016 / j.jmb.2008.09.060. PMID 18851979.

Další čtení

Simons A, Melamed-Bessudo C, Wolkowicz R, Sperling J, Sperling R, Eisenbach L, Rotter V (leden 1997). „PACT: klonování a charakterizace buněčného proteinu vázajícího p53, který interaguje s Rb“. Onkogen. 14 (2): 145–55. doi:10.1038 / sj.onc.1200825. PMID 9010216.
Gao S, Witte MM, Scott RE (květen 2002). „Protein P2P-R se lokalizuje do jádra mezifázových buněk a na periferii chromozomů v mitotických buňkách, které vykazují maximální imunoreaktivitu P2P-R“. Journal of Cellular Physiology. 191 (2): 145–54. doi:10.1002 / jcp.10084. PMID 12064457. S2CID 25240477.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Yoshitake Y, Nakatsura T, Monji M, Senju S, Matsuyoshi H, Tsukamoto H, Hosaka S, Komori H, Fukuma D, Ikuta Y, Katagiri T, Furukawa Y, Ito H, Shinohara M, Nakamura Y, Nishimura Y (říjen 2004 ). „Protein související s proliferačním potenciálem, ideální antigen rakoviny jícnu pro imunoterapii, identifikovaný pomocí doplňkové analýzy DNA microarray“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (19): 6437–48. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0841. PMID 15475430.
Scott RE, White-Grindley E, Ruley HE, Chesler EJ, Williams RW (červenec 2005). „Exprese P2P-R je geneticky korelována se složkami translačního aparátu a s PUM2, translačním represorem, který se asociuje s mRNA P2P-R“. Journal of Cellular Physiology. 204 (1): 99–105. doi:10.1002 / jcp.20263. PMID 15617101. S2CID 24888360.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (říjen 2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Přírodní biotechnologie. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122257 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030779 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8595913-5] Sakai Y, Saijo M, Coelho K, Kishino T, Niikawa N, Taya Y (listopad 1995). "sekvence cDNA a chromozomální lokalizace nového lidského proteinu, RBQ-1 (RBBP6), který se váže na produkt genu pro retinoblastom". Genomika. 30 (1): 98–101. doi:10.1006 / geno.1995.0017. PMID 8595913.

[pmid16396680-6] Pugh DJ, Ab E, Faro A, Lutya PT, Hoffmann E, Rees DJ (únor 2006). „DWNN, nová doména podobná ubikvitinu, implikuje RBBP6 při zpracování mRNA a drah podobných ubikvitinu“. BMC strukturní biologie. 6: 1. doi:10.1186/1472-6807-6-1. PMC 1360078. PMID 16396680.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RBBP6 retinoblastoma binding protein 6“.

[pmid18851979-8] Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Rees DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (prosinec 2008). „RBBP6 interaguje s multifunkčním proteinem YB-1 prostřednictvím své prstové domény RING, což vede k ubikvitinaci a proteosomální degradaci YB-1“. Journal of Molecular Biology. 384 (4): 908–16. doi:10.1016 / j.jmb.2008.09.060. PMID 18851979.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]