RARS (gen) - RARS (gene)

RARS1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4Q2T, 4Q2X, 4Q2Y, 4R3Z, 4ZAJ
Identifikátory
Aliasy	RARS1, ArgRS, DALRD1, HLD9, arginyl-tRNA syntetáza, arginyl-tRNA syntetáza 1, RARS
Externí ID	OMIM: 107820 MGI: 1914297 HomoloGene: 68281 Genové karty: RARS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	168,519,301 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	35,834,506 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita aminoacyl-tRNA ligázy; • vazba nukleotidů; • vazba tRNA; • vazba argininu; • ligázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • kadherinová vazba; • aktivita arginin-tRNA ligázy;
Buněčná složka	• membrána; • nukleoplazma; • mitochondrie; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytoplazma; • multienzymový komplex aminoacyl-tRNA syntetázy; • cytosol;
Biologický proces	• biosyntéza bílkovin; • Aminoacylace tRNA pro translaci proteinu; • aminoacylace arginyl-tRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5917
	104458
	ENSG00000113643
	ENSMUSG00000018848
	P54136
	Q9D0I9
	NM_002887
	NM_025936
	NP_002878
	NP_080212
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Arginyl-tRNA syntetáza, cytoplazmatická je enzym že u lidí je kódován RARS gen.^[5]^[6]

Aminoacyl-tRNA syntetázy katalyzují aminoacylaci tRNA svými příbuznými aminokyselinami. Vzhledem k jejich ústřední úloze při spojování aminokyselin s nukleotidovými triplety obsaženými v tRNA jsou aminoacyl-tRNA syntetázy považovány za první proteiny, které se objevily v evoluci. Arginyl-tRNA syntetáza patří do rodiny aminoacyl-tRNA syntetázy třídy I.^[6]

Genetika

Mutace v RARS způsobují hypomyelinizace.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že RARS (gen) komunikovat s QARS.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113643 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018848 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Girjes AA, Hobson K, Chen P, Lavin MF (říjen 1995). "Klonování a charakterizace cDNA kódující lidskou arginyl-tRNA syntetázu". Gen. 164 (2): 347–50. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00502-W. PMID 7590355.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RARS arginyl-tRNA syntetáza“.
^ Wolf NI, Salomons GS, Rodenburg RJ, Pouwels PJ, Schieving JH, Derks TG, Fock JM, Rump P, van Beek DM, van der Knaap MS, Waisfisz Q (červenec 2014). "Mutace v RARS způsobují hypomyelinaci". Annals of Neurology. 76 (1): 134–9. doi:10,1002 / ana.24167. PMID 24777941. S2CID 27717491.
^ Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.

Další čtení

McCune SA, Yu PL, Nance WE (1977). „Genetická studie aktivity erytrocytů arginin-tRNA syntetázy u člověka“. Acta Geneticae Medicae et Gemellologiae. 26 (1): 21–7. doi:10.1017 / S0001566000010151. PMID 562050.
Norcum MT (srpen 1991). „Strukturní analýza komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy s vysokou molekulovou hmotností. Účinky neutrálních solí a detergentů“. The Journal of Biological Chemistry. 266 (23): 15398–405. PMID 1651330.
Wang HY, Pan F (1985). "Kinetický mechanismus arginyl-tRNA syntetázy z lidské placenty". International Journal of Biochemistry. 16 (12): 1379–85. doi:10.1016 / 0020-711X (84) 90244-1. PMID 6530022.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Rho SB, Lee JS, Jeong EJ, Kim KS, Kim YG, Kim S (květen 1998). „Multifunkční opakovaný motiv je přítomen v lidské bifunkční tRNA syntetáze“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (18): 11267–73. doi:10.1074 / jbc.273.18.11267. PMID 9556618.
Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (leden 1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. Journal of Molecular Biology. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.
Park SG, Jung KH, Lee JS, Jo YJ, Motegi H, Kim S, Shiba K (červen 1999). „Prekurzor pro-apoptotického cytokinu moduluje aminoacylační aktivitu tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (24): 16673–6. doi:10.1074 / jbc.274.24.16673. PMID 10358004.
Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.
Kang J, Kim T, Ko YG, Rho SB, Park SG, Kim MJ, Kwon HJ, Kim S (říjen 2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. PMID 10913161.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Ling C, Yao YN, Zheng YG, Wei H, Wang L, Wu XF, Wang ED (říjen 2005). „C-koncová připojená doména lidské cytosolické leucyl-tRNA syntetázy je nepostradatelná při její interakci s arginyl-tRNA syntetázou v komplexu multi-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (41): 34755–63. doi:10,1074 / jbc.M413511200. PMID 16055448.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Bottoni A, Vignali C, Piccin D, Tagliati F, Luchin A, Zatelli MC, Uberti EC (srpen 2007). "Proteazomy a RARS modulují sekreci AIMP1 / EMAP II v lidských rakovinných buněčných liniích". Journal of Cellular Physiology. 212 (2): 293–7. doi:10,1002 / jcp.21083. PMID 17443684. S2CID 27371659.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P54136 (Lidský arginin - tRNA ligáza, cytoplazmatická) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113643 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018848 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7590355-5] Girjes AA, Hobson K, Chen P, Lavin MF (říjen 1995). "Klonování a charakterizace cDNA kódující lidskou arginyl-tRNA syntetázu". Gen. 164 (2): 347–50. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00502-W. PMID 7590355.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RARS arginyl-tRNA syntetáza“.

[7] Wolf NI, Salomons GS, Rodenburg RJ, Pouwels PJ, Schieving JH, Derks TG, Fock JM, Rump P, van Beek DM, van der Knaap MS, Waisfisz Q (červenec 2014). "Mutace v RARS způsobují hypomyelinaci". Annals of Neurology. 76 (1): 134–9. doi:10,1002 / ana.24167. PMID 24777941. S2CID 27717491.

[pmid10801842-8] Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]