QARS - QARS - Wikipedia

QARS1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4R3Z, 4YE9, 4YE6, 4YE8
Identifikátory
Aliasy	QARS1, GLNRS, MSCCA, PRO2195, glutaminyl-tRNA syntetáza, glutaminyl-tRNA syntetáza 1, QARS
Externí ID	OMIM: 603727 HomoloGene: 3704 Genové karty: QARS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	49,105,130 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita aminoacyl-tRNA ligázy; • vazba nukleotidů; • ligázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • aktivita inhibitoru proteinkinázy; • vazba protein kinázy; • aktivita glutamin-tRNA ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondriální matice; • multienzymový komplex aminoacyl-tRNA syntetázy; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• vývoj mozku; • glutaminyl-tRNA aminoacylace; • aminoacylace tRNA; • biosyntéza bílkovin; • Aminoacylace tRNA pro translaci proteinu; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • negativní regulace stresem aktivované kaskády MAPK; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace apoptotické signální dráhy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5859
	n / a
	ENSG00000172053
	n / a
	P47897
	n / a
	NM_001272073; NM_005051
	n / a
	NP_001259002; NP_005042
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Glutaminyl-tRNA syntetáza je enzym že u lidí je kódován QARS gen.^[3]^[4]^[5]

Funkce

Aminoacyl-tRNA syntetázy katalyzovat aminoacylaci tRNA jejich příbuznou aminokyselinou. Vzhledem k jejich ústřední úloze při spojování aminokyselin s nukleotidovými triplety obsaženými v tRNA jsou aminoacyl-tRNA syntetázy považovány za první proteiny, které se objevily v evoluci. v metazoans V multienzymovém komplexu je sdruženo 9 aminoacyl-tRNA syntetáz specifických pro glutamin (gln), kyselinu glutamovou (glu) a 7 dalších aminokyselin. Ačkoli je přítomná v eukaryotech, glutaminyl-tRNA syntetáza (QARS) chybí u mnoha prokaryot, mitochondrií a chloroplastů, ve kterých je Gln-tRNA (Gln) tvořena transamidací misacylované Glu-tRNA (Gln). Glutaminyl-tRNA syntetáza patří do rodiny aminoacyl-tRNA syntetázy třídy I.^[5] Téměř všechny eukaryotické GlnRS enzymy mají a YqeY doména na N-konec, což ovlivňuje afinita pro tRNA; u některých bakteriálních druhů, jako je např Deinococcus radiodurans, YqeY je přítomen jako C-terminální doména s podobnou funkcí.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že QARS komunikovat s RARS.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172053 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lamour V, Quevillon S, Diriong S, N'Guyen VC, Lipinski M, Mirande M (srpen 1994). „Vývoj rodiny syntetázy Glx-tRNA: glutaminylový enzym jako případ horizontálního přenosu genů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (18): 8670–4. Bibcode:1994PNAS ... 91.8670L. doi:10.1073 / pnas.91.18.8670. PMC 44668. PMID 8078941.
^ Durkin ME, Jäger AC, Khurana TS, Nielsen FC, Albrechtsen R, Wewer UM (červenec 1999). „Charakterizace lokusu lidského lamininového beta2 řetězce (LAMB2): vazba na gen obsahující nezpracovaný přepisovaný pseudogen podobný LAMB2 (LAMB2L) a na gen kódující glutaminyl tRNA syntetázu (QARS)“. Cytogenetika a genetika buněk. 84 (3–4): 173–8. doi:10.1159/000015249. PMID 10393422. S2CID 36315977.
^ ^A ^b „Entrez Gene: QARS glutaminyl-tRNA syntetáza“.
^ Hadd A, Perona JJ (říjen 2014). „Koevoluce determinant specificity v eukaryotických glutamyl- a glutaminyl-tRNA syntetázách“. Journal of Molecular Biology. 426 (21): 3619–33. doi:10.1016 / j.jmb.2014.08.006. PMID 25149203.
^ Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.

Další čtení

Norcum MT (srpen 1991). „Strukturní analýza komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy s vysokou molekulovou hmotností. Účinky neutrálních solí a detergentů“. The Journal of Biological Chemistry. 266 (23): 15398–405. PMID 1651330.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (leden 1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. Journal of Molecular Biology. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.
Ko YG, Kang YS, Kim EK, Park SG, Kim S (květen 2000). „Nukleolární lokalizace lidské methionyl-tRNA syntetázy a její role při syntéze ribozomální RNA“. The Journal of Cell Biology. 149 (3): 567–74. doi:10.1083 / jcb.149.3.567. PMC 2174846. PMID 10791971.
Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.
Kang J, Kim T, Ko YG, Rho SB, Park SG, Kim MJ, Kwon HJ, Kim S (říjen 2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. PMID 10913161.
Ko YG, Kim EY, Kim T, Park H, Park HS, Choi EJ, Kim S (únor 2001). „Glutamin-dependentní antiapoptotická interakce lidské glutaminyl-tRNA syntetázy s kinázou 1 regulující signál apoptózy“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (8): 6030–6. doi:10,1074 / jbc.M006189200. PMID 11096076.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172053 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8078941-3] Lamour V, Quevillon S, Diriong S, N'Guyen VC, Lipinski M, Mirande M (srpen 1994). „Vývoj rodiny syntetázy Glx-tRNA: glutaminylový enzym jako případ horizontálního přenosu genů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (18): 8670–4. Bibcode:1994PNAS ... 91.8670L. doi:10.1073 / pnas.91.18.8670. PMC 44668. PMID 8078941.

[pmid10393422-4] Durkin ME, Jäger AC, Khurana TS, Nielsen FC, Albrechtsen R, Wewer UM (červenec 1999). „Charakterizace lokusu lidského lamininového beta2 řetězce (LAMB2): vazba na gen obsahující nezpracovaný přepisovaný pseudogen podobný LAMB2 (LAMB2L) a na gen kódující glutaminyl tRNA syntetázu (QARS)“. Cytogenetika a genetika buněk. 84 (3–4): 173–8. doi:10.1159/000015249. PMID 10393422. S2CID 36315977.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: QARS glutaminyl-tRNA syntetáza“.

[hadd-6] Hadd A, Perona JJ (říjen 2014). „Koevoluce determinant specificity v eukaryotických glutamyl- a glutaminyl-tRNA syntetázách“. Journal of Molecular Biology. 426 (21): 3619–33. doi:10.1016 / j.jmb.2014.08.006. PMID 25149203.

[pmid10801842-7] Kim T, Park SG, Kim JE, Seol W, Ko YG, Kim S (červenec 2000). „Katalytický peptid lidské glutaminyl-tRNA syntetázy je nezbytný pro jeho sestavení do komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21768–72. doi:10,1074 / jbc.M002404200. PMID 10801842.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]