RAPGEF5 - RAPGEF5

RAPGEF5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1WGY
Identifikátory
Aliasy	RAPGEF5, GFR, MR-GEF, REPAC, Rap guaninový nukleotidový výměnný faktor 5
Externí ID	OMIM: 609527 MGI: 2444365 HomoloGene: 56563 Genové karty: RAPGEF5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	22,357,154 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	117,759,737 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita faktoru výměny ras guanyl-nukleotidů; • Vazba na protein závislá na GTP; • Aktivita výměnného faktoru guanyl-nukleotidů; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso;
Biologický proces	• malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • vývoj nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9771
	217944
	ENSG00000136237
	ENSMUSG00000041992
	Q92565
	Q8C0Q9
	NM_012294; NM_001367600; NM_001367601; NM_001367602; NM_001367603
	NM_175930; NM_001373989
	NP_036426; NP_001354529; NP_001354530; NP_001354531; NP_001354532
	NP_787126; NP_001360918
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor výměny guaninového nukleotidu 5 je protein že u lidí je kódován RAPGEF5 gen.^[5]^[6]^[7]

Členové RAS podčeleď (vidět HRAS; MIM 190020) ze dne GTPasy funkce v signální transdukce protože GTP / GDP-regulované přepínače, které cyklují mezi neaktivními HDP- a aktivními státy vázanými na GTP. Faktory výměny guaninových nukleotidů (GEF), jako je RAPGEF5, slouží jako aktivátory RAS podporou akvizice GTP k udržení aktivního stavu vázaného na GTP a jsou klíčovým spojením mezi nimi buněčné povrchové receptory a aktivace RAS (Rebhun et al., 2000). [dodáno společností OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136237 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041992 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (květen 1997). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VI. Kódující sekvence 80 nových genů (KIAA0201-KIAA0280) odvozené analýzou cDNA klonů z buněčné linie KG-1 a mozku". DNA Res. 3 (5): 321–9, 341–54. doi:10.1093 / dnares / 3.5.321. PMID 9039502.
^ Ichiba T, Hoshi Y, Eto Y, Tajima N, Kuraishi Y (říjen 1999). "Charakterizace GFR, nového guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rap1". FEBS Lett. 457 (1): 85–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01012-1. PMID 10486569. S2CID 20296877.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAPGEF5 Rap guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 5“.

Další čtení

de Rooij J, Rehmann H, van Triest M a kol. (2000). „Mechanismus regulace rodiny Epac RapGEF závislých na cAMP“. J. Biol. Chem. 275 (27): 20829–36. doi:10,1074 / jbc.M001113200. PMID 10777494.
Rebhun JF, Castro AF, Quilliam LA (2001). "Identifikace guaninových nukleotidových výměnných faktorů (GEF) pro GTPázu Rap1. Regulace MR-GEF interakcí M-Ras-GTP". J. Biol. Chem. 275 (45): 34901–8. doi:10,1074 / jbc.M005327200. PMID 10934204.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Dupuy AG, L'Hoste S, Cherfils J, et al. (2005). „Nové dominantní negativní mutanty Rap1 interferují selektivně s C3G a Epac“. Onkogen. 24 (28): 4509–20. doi:10.1038 / sj.onc.1208647. PMID 15856025.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136237 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041992 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9039502-5] Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (květen 1997). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VI. Kódující sekvence 80 nových genů (KIAA0201-KIAA0280) odvozené analýzou cDNA klonů z buněčné linie KG-1 a mozku". DNA Res. 3 (5): 321–9, 341–54. doi:10.1093 / dnares / 3.5.321. PMID 9039502.

[pmid10486569-6] Ichiba T, Hoshi Y, Eto Y, Tajima N, Kuraishi Y (říjen 1999). "Charakterizace GFR, nového guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rap1". FEBS Lett. 457 (1): 85–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01012-1. PMID 10486569. S2CID 20296877.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RAPGEF5 Rap guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]