RANBP3 - RANBP3

RANBP3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CRF, 2Y8F, 2Y8G
Identifikátory
Aliasy	RANBP3, RAN vazebný protein 3
Externí ID	OMIM: 603327 MGI: 1919060 HomoloGene: 136516 Genové karty: RANBP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	5,978,142 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	56,711,764 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba R-SMAD; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Proběhla vazba GTPázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma; • centrosome; • jaderný pór;
Biologický proces	• transport bílkovin; • intracelulární transport; • Export RNA z jádra; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • import bílkovin do jádra; • GO: 0043146 organizace vřetena; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • pozitivní regulace separace mitotických centrosomů; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • export bílkovin z jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8498
	71810
	ENSG00000031823
	ENSMUSG00000002372
	Q9H6Z4
	Q9CT10
	NM_001300865; NM_003624; NM_007320; NM_007321; NM_007322
	NM_001252466; NM_001252467; NM_027933
	NP_001287794; NP_003615; NP_015559; NP_015561
	NP_001239395; NP_001239396; NP_082209
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ran vázající protein 3 je protein že u lidí je kódován RANBP3 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje protein s doménou RanBD1, který se nachází jak v jádře, tak v cytoplazmě. Tento protein hraje roli v jaderném exportu jako součást heteromerního komplexu. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

RANBP3 bylo prokázáno komunikovat s RCC1^[5]^[7] a XPO1.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000031823 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002372 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Mueller L, Cordes VC, Bischoff FR, Ponstingl H (červenec 1998). "Human RanBP3, skupina jaderných proteinů vázajících RanGTP". FEBS Lett. 427 (3): 330–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00459-1. PMID 9637251. S2CID 28405923.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RANBP3 RAN binding protein 3“.
^ Nemergut, Michael E; Lindsay Mark E; Brownawell Amy M; Macara Ian G (květen 2002). „Ran-binding protein 3 links Crm1 to the Ran guanine nucleotide exchange factor“. J. Biol. Chem. 277 (20): 17385–8. doi:10,1074 / jbc.C100620200. ISSN 0021-9258. PMID 11932251.
^ Lindsay, ME; Holaska J M; Welch K; Velikonoční B M; Macara I G (červen 2001). „Ran-binding protein 3 je kofaktorem pro export jaderného proteinu zprostředkovaného Crm1“. J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. doi:10.1083 / jcb.153.7.1391. ISSN 0021-9525. PMC 2150735. PMID 11425870.
^ Lindsay, Mark E; Plafker Kendra; Smith Alicia E; Clurman Bruce E; Macara Ian G (srpen 2002). „Npap60 / Nup50 je tristabilní přepínač, který stimuluje import jaderných proteinů zprostředkovaných importin-alfa: beta“. Buňka. 110 (3): 349–60. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X. ISSN 0092-8674. PMID 12176322. S2CID 15515037.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lindsay ME, Holaska JM, Welch K a kol. (2001). „Ran-binding protein 3 je kofaktorem pro export jaderného proteinu zprostředkovaného Crm1“. J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. doi:10.1083 / jcb.153.7.1391. PMC 2150735. PMID 11425870.
Englmeier L, Fornerod M, Bischoff FR, et al. (2002). „RanBP3 ovlivňuje interakce mezi CRM1 a jeho substráty pro export jaderných proteinů“. EMBO Rep. 2 (10): 926–32. doi:10.1093 / embo-reports / kve200. PMC 1084078. PMID 11571268.
Nemergut ME, Lindsay ME, Brownawell AM, Macara IG (2002). „Ran-binding protein 3 links Crm1 to the Ran guanine nucleotide exchange factor“. J. Biol. Chem. 277 (20): 17385–8. doi:10,1074 / jbc.C100620200. PMID 11932251.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hakata Y, Yamada M, Shida H (2003). „Multifunkční doména v lidském CRM1 (exportin 1) zprostředkovává vazbu RanBP3 a multimerizaci proteinu Rex proteinu lidské T-buněčné leukémie typu 1“. Mol. Buňka. Biol. 23 (23): 8751–61. doi:10.1128 / MCB.23.23.8751-8761.2003. PMC 262658. PMID 14612415.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Grimwood J, Gordon LA, Olsen A a kol. (2004). „Sekvence DNA a biologie lidského chromozomu 19“. Příroda. 428 (6982): 529–35. Bibcode:2004 Natur.428..529G. doi:10.1038 / nature02399. PMID 15057824.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000031823 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002372 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9637251-5] A ^b Mueller L, Cordes VC, Bischoff FR, Ponstingl H (červenec 1998). "Human RanBP3, skupina jaderných proteinů vázajících RanGTP". FEBS Lett. 427 (3): 330–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00459-1. PMID 9637251. S2CID 28405923.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RANBP3 RAN binding protein 3“.

[pmid11932251-7] Nemergut, Michael E; Lindsay Mark E; Brownawell Amy M; Macara Ian G (květen 2002). „Ran-binding protein 3 links Crm1 to the Ran guanine nucleotide exchange factor“. J. Biol. Chem. 277 (20): 17385–8. doi:10,1074 / jbc.C100620200. ISSN 0021-9258. PMID 11932251.

[pmid11425870-8] Lindsay, ME; Holaska J M; Welch K; Velikonoční B M; Macara I G (červen 2001). „Ran-binding protein 3 je kofaktorem pro export jaderného proteinu zprostředkovaného Crm1“. J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. doi:10.1083 / jcb.153.7.1391. ISSN 0021-9525. PMC 2150735. PMID 11425870.

[pmid12176322-9] Lindsay, Mark E; Plafker Kendra; Smith Alicia E; Clurman Bruce E; Macara Ian G (srpen 2002). „Npap60 / Nup50 je tristabilní přepínač, který stimuluje import jaderných proteinů zprostředkovaných importin-alfa: beta“. Buňka. 110 (3): 349–60. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X. ISSN 0092-8674. PMID 12176322. S2CID 15515037.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]