RAD17 - RAD17

RAD17
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3A1J, 3G65, 3GGR
Identifikátory
Aliasy	RAD17, CCYC, HR24L, RAD17SP, RAD24, RAD17 součást kontrolního bodu upínacího nakladače
Externí ID	OMIM: 603139 MGI: 1333807 HomoloGene: 32117 Genové karty: RAD17
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	69,414,801 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	100,651,051 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba chromatinu; • Aktivita zavaděče DNA;
Buněčná složka	• chromozom, telomerická oblast; • Komplex podobný RadFC RFC; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jádro; • nukleární chromatin;
Biologický proces	• kontrolní bod mitotického buněčného cyklu; • Kontrolní bod replikace DNA; • replikace DNA; • Kontrolní bod poškození DNA; • buněčný cyklus; • regulace fosforylace; • negativní regulace replikace DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • kontrolní bod replikace mitotické DNA; • Oprava DNA; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5884
	19356
	ENSG00000276618; ENSG00000152942
	ENSMUSG00000021635
	O75943
	Q6NXW6
NM_001278622; NM_002873; NM_133338; NM_133339; NM_133340;
	NM_133341; NM_133342; NM_133343; NM_133344
	NM_001044371; NM_001283011; NM_011233
NP_001265551; NP_002864; NP_579916; NP_579917; NP_579918;
	NP_579919; NP_579920; NP_579921; NP_579922
	NP_001037836; NP_001269940; NP_035363
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kontrolní bod buněčného cyklu, protein RAD17 je protein že u lidí je kódován RAD17 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je velmi podobný genovému produktu Schizosaccharomyces pombe rad17, genu kontrolního bodu buněčného cyklu požadovaného pro zastavení buněčného cyklu a opravu poškození DNA v reakci na poškození DNA. Tento protein sdílí silnou podobnost s DNA replikačním faktorem C (RFC) a může tvořit komplex s RFC. Tento protein se váže na chromatin před poškozením DNA a po poškození je fosforylován ATR. Tento protein rekrutuje proteinový komplex kontrolního bodu RAD1-RAD9-HUS1 na chromatin po poškození DNA, což může být nutné pro jeho fosforylaci. Fosforylace tohoto proteinu je nutná pro zastavení G2 buněčného cyklu indukovaného poškozením DNA a je považována za kritickou ranou událost během signalizace kontrolního bodu v buňkách poškozených DNA. Bylo popsáno osm alternativně sestříhaných transkriptových variant tohoto genu, které kódují čtyři odlišné proteiny.^[7]

Interakce

RAD17 bylo prokázáno komunikovat s:

Souvisí s ataxií telangiektázie a Rad3,^[8]^[9]
Ataxia telangiectasia mutovala,^[8]^[9]
HUS1,^[10]^[11]
NHP2L1,^[12]
PÓL,^[13]
Homolog RAD1,^[8]^[10]^[11] a
RAD9A.^[10]^[11]^[14]^[15]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000152942 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276618, ENSG00000152942 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021635 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bao S, Shen X, Shen K, Liu Y, Wang XF (březen 1999). „Savčí Rad24 homologní s kvasinkami Saccharomyces cerevisiae Rad24 a Schizosaccharomyces pombe Rad17 je zapojen do kontrolního bodu poškození DNA“. Růst buněk se liší. 9 (12): 961–7. PMID 9869296.
^ Parker AE, Van de Weyer I, Laus MC, Verhasselt P, Luyten WH (srpen 1998). "Identifikace lidského homologu genu kontrolního bodu Schizosaccharomyces pombe rad17 +". J Biol Chem. 273 (29): 18340–6. doi:10.1074 / jbc.273.29.18340. PMID 9660800.
^ "Entrez Gene: RAD17 homolog RAD17 homolog (S. pombe)".
^ ^A ^b ^C Bao S, Tibbetts RS, Brumbaugh KM, Fang Y, Richardson DA, Ali A, Chen SM, Abraham RT, Wang XF (červen 2001). „Pro genotoxické stresové reakce je nutná fosforylace lidského Rad17 zprostředkovaná ATR / ATM“. Příroda. 411 (6840): 969–74. Bibcode:2001 Natur.411..969B. doi:10.1038/35082110. PMID 11418864. S2CID 4429058.
^ ^A ^b Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (prosinec 1999). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
^ ^A ^b ^C Bermudez VP, Lindsey-Boltz LA, Cesare AJ, Maniwa Y, Griffith JD, Hurwitz J, Sancar A (únor 2003). „Načítání komplexu lidského kontrolního bodu 9-1-1 do DNA kontrolním bodem s upínacím zařízením hRad17-replikační faktor C komplex in vitro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (4): 1633–8. Bibcode:2003PNAS..100.1633B. doi:10.1073 / pnas.0437927100. PMC 149884. PMID 12578958.
^ ^A ^b ^C Rauen M, Burtelow MA, Dufault VM, Karnitz LM (září 2000). „Protein lidského kontrolního bodu hRad17 interaguje s proteiny podobnými PCNA hRad1, hHus1 a hRad9“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. doi:10,1074 / jbc.M005782200. PMID 10884395.
^ Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (prosinec 1999). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. J. Biol. Chem. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.
^ Post SM, Tomkinson AE, Lee EY (říjen 2003). „Lidský kontrolní bod Rad protein je v celém buněčném cyklu asociován s chromatinem, lokalizuje se na místech replikace DNA a interaguje s DNA polymerázou epsilon.“. Nucleic Acids Res. 31 (19): 5568–75. doi:10.1093 / nar / gkg765. PMC 206465. PMID 14500819.
^ Dufault VM, Oestreich AJ, Vroman BT, Karnitz LM (prosinec 2003). "Identifikace a charakterizace RAD9B, paralog genu kontrolního bodu RAD9". Genomika. 82 (6): 644–51. doi:10.1016 / s0888-7543 (03) 00200-3. PMID 14611806.
^ Lindsey-Boltz LA, VP Bermudez, Hurwitz J, Sancar A (září 2001). "Purifikace a charakterizace kontrolního bodu poškození lidské DNA Rad komplexů". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (20): 11236–41. Bibcode:2001PNAS ... 9811236L. doi:10.1073 / pnas.201373498. PMC 58713. PMID 11572977.

Další čtení

Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). „Role pomocných proteinů HIV-1 ve virové patogenezi a interakcích hostitel-patogen“. Cell Res. 15 (11–12): 923–34. doi:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
al-Khodairy F, Carr AM (1992). „DNA opravní mutanti definující dráhy kontrolního bodu G2 v Schizosaccharomyces pombe“. EMBO J.. 11 (4): 1343–50. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05179.x. PMC 556583. PMID 1563350.
Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (1997). „Replikační faktor C interaguje s C-koncovou stranou nukleárního antigenu proliferujících buněk“ (PDF). J. Biol. Chem. 272 (3): 1769–76. doi:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859. S2CID 14454322.
Dean FB, Lian L, O'Donnell M (1999). "cDNA klonování a genové mapování lidských homologů pro Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1 a hus1 a klonování homologů z myší, Caenorhabditis elegans a Drosophila melanogaster". Genomika. 54 (3): 424–36. doi:10.1006 / geno.1998.5587. PMID 9878245.
Bluyssen HA, Naus NC, van Os RI, Jaspers I, Hoeijmakers JH, de Klein A (1999). "Lidské a myší homology kontrolního bodu kontrolního bodu buněčného cyklu Schizosaccharomyces pombe rad17 +". Genomika. 55 (2): 219–28. doi:10.1006 / geno.1998.5642. PMID 9933569.
Li L, Peterson CA, Kanter-Smoler G, Wei YF, Ramagli LS, Sunnerhagen P, Siciliano MJ, Legerski RJ (1999). „hRAD17, strukturní homolog genu kontrolního bodu buněčného cyklu RAD17 Schizosaccharomyces pombe, stimuluje akumulaci p53“. Onkogen. 18 (9): 1689–99. doi:10.1038 / sj.onc.1202469. PMID 10208430.
Bao S, Chang MS, Auclair D, Sun Y, Wang Y, Wong WK, Zhang J, Liu Y, Qian X, Sutherland R, Magi-Galluzi C, Weisberg E, Cheng EY, Hao L, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Loda M, Lo KM, Chen LB (1999). „HRad17, lidský homolog genu rad17 kontrolního bodu Schizosaccharomyces pombe, je nadměrně exprimován v karcinomu tlustého střeva“. Cancer Res. 59 (9): 2023–8. PMID 10232579.
von Deimling F, Scharf JM, Liehr T, Rothe M, Kelter AR, Albers P, Dietrich WF, Kunkel LM, Wernert N, Wirth B (1999). "Lidské a myší geny RAD17: identifikace, lokalizace, genomová struktura a histologický expresní vzor v normálním varlete a seminomu". Hučení. Genet. 105 (1–2): 17–27. doi:10,1007 / s004390051058. PMID 10480350.
Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (2000). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. J. Biol. Chem. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.
Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
Burtelow MA, Kaufmann SH, Karnitz LM (2000). „Retence lidského komplexu kontrolního bodu Rad9 v jaderných komplexech odolných proti extrakci po poškození DNA“. J. Biol. Chem. 275 (34): 26343–8. doi:10,1074 / jbc.M001244200. PMID 10852904.
Rauen M, Burtelow MA, Dufault VM, Karnitz LM (2000). „Protein lidského kontrolního bodu hRad17 interaguje s proteiny podobnými PCNA hRad1, hHus1 a hRad9“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. doi:10,1074 / jbc.M005782200. PMID 10884395.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Bao S, Tibbetts RS, Brumbaugh KM, Fang Y, Richardson DA, Ali A, Chen SM, Abraham RT, Wang XF (2001). „Pro genotoxické stresové reakce je nutná fosforylace lidského Rad17 zprostředkovaná ATR / ATM“. Příroda. 411 (6840): 969–74. Bibcode:2001 Natur.411..969B. doi:10.1038/35082110. PMID 11418864. S2CID 4429058.
Lindsey-Boltz LA, Bermudez VP, Hurwitz J, Sancar A (2001). "Purifikace a charakterizace kontrolního bodu poškození lidské DNA Rad komplexů". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (20): 11236–41. Bibcode:2001PNAS ... 9811236L. doi:10.1073 / pnas.201373498. PMC 58713. PMID 11572977.
Chen MS, Higashikubo R, Laszlo A, Roti Roti J (2001). "Více alternativních sestřihových forem lidského RAD17 a jejich diferenciální reakce na ionizující záření". Gen. 277 (1–2): 145–52. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00692-8. PMID 11602352.
Post S, Weng YC, Cimprich K, Chen LB, Xu Y, Lee EY (2001). „Fosforylace serinů 635 a 645 lidského Rad17 je regulována buněčným cyklem a je nutná pro aktivaci kontrolního bodu G1 / S v reakci na poškození DNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (23): 13102–7. doi:10.1073 / pnas.231364598. PMC 60831. PMID 11687627.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000152942 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276618, ENSG00000152942 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021635 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9869296-5] Bao S, Shen X, Shen K, Liu Y, Wang XF (březen 1999). „Savčí Rad24 homologní s kvasinkami Saccharomyces cerevisiae Rad24 a Schizosaccharomyces pombe Rad17 je zapojen do kontrolního bodu poškození DNA“. Růst buněk se liší. 9 (12): 961–7. PMID 9869296.

[pmid9660800-6] Parker AE, Van de Weyer I, Laus MC, Verhasselt P, Luyten WH (srpen 1998). "Identifikace lidského homologu genu kontrolního bodu Schizosaccharomyces pombe rad17 +". J Biol Chem. 273 (29): 18340–6. doi:10.1074 / jbc.273.29.18340. PMID 9660800.

[entrez-7] "Entrez Gene: RAD17 homolog RAD17 homolog (S. pombe)".

[pmid11418864-8] A ^b ^C Bao S, Tibbetts RS, Brumbaugh KM, Fang Y, Richardson DA, Ali A, Chen SM, Abraham RT, Wang XF (červen 2001). „Pro genotoxické stresové reakce je nutná fosforylace lidského Rad17 zprostředkovaná ATR / ATM“. Příroda. 411 (6840): 969–74. Bibcode:2001 Natur.411..969B. doi:10.1038/35082110. PMID 11418864. S2CID 4429058.

[pmid10608806-9] A ^b Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (prosinec 1999). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.

[pmid12578958-10] A ^b ^C Bermudez VP, Lindsey-Boltz LA, Cesare AJ, Maniwa Y, Griffith JD, Hurwitz J, Sancar A (únor 2003). „Načítání komplexu lidského kontrolního bodu 9-1-1 do DNA kontrolním bodem s upínacím zařízením hRad17-replikační faktor C komplex in vitro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (4): 1633–8. Bibcode:2003PNAS..100.1633B. doi:10.1073 / pnas.0437927100. PMC 149884. PMID 12578958.

[pmid10884395-11] A ^b ^C Rauen M, Burtelow MA, Dufault VM, Karnitz LM (září 2000). „Protein lidského kontrolního bodu hRad17 interaguje s proteiny podobnými PCNA hRad1, hHus1 a hRad9“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29767–71. doi:10,1074 / jbc.M005782200. PMID 10884395.

[pmid10593953-12] Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (prosinec 1999). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. J. Biol. Chem. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.

[pmid14500819-13] Post SM, Tomkinson AE, Lee EY (říjen 2003). „Lidský kontrolní bod Rad protein je v celém buněčném cyklu asociován s chromatinem, lokalizuje se na místech replikace DNA a interaguje s DNA polymerázou epsilon.“. Nucleic Acids Res. 31 (19): 5568–75. doi:10.1093 / nar / gkg765. PMC 206465. PMID 14500819.

[pmid14611806-14] Dufault VM, Oestreich AJ, Vroman BT, Karnitz LM (prosinec 2003). "Identifikace a charakterizace RAD9B, paralog genu kontrolního bodu RAD9". Genomika. 82 (6): 644–51. doi:10.1016 / s0888-7543 (03) 00200-3. PMID 14611806.

[pmid11572977-15] Lindsey-Boltz LA, VP Bermudez, Hurwitz J, Sancar A (září 2001). "Purifikace a charakterizace kontrolního bodu poškození lidské DNA Rad komplexů". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (20): 11236–41. Bibcode:2001PNAS ... 9811236L. doi:10.1073 / pnas.201373498. PMC 58713. PMID 11572977.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]