NHP2L1 - NHP2L1

SNU13
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E7K, 2JNB, 2OZB, 3SIU, 3SIV, 3JCR
Identifikátory
Aliasy	SNU13, 15,5K, FA-1, FA1, NHPX, OTK27, SNRNP15-5, SPAG12, SSFA1, NHP2L1, SNU13 homolog, malý nukleární ribonukleoprotein (U4 / U6.U5), malý nukleární ribonukleoprotein 13
Externí ID	OMIM: 601304 MGI: 893586 HomoloGene: 3672 Genové karty: SNU13
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	41,690,504 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba snoRNA na U3; • Vazba ATPázy; • U4 snRNA vazba; • Vazba U4atac snRNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba snoRNA; • Vazba RNA; • box C / D snoRNA vazba;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • procesní malá podjednotka; • Komplex U4 / U6 x U5 tri-snRNP; • jádro; • hustá fibrilární složka; • cytosolická velká ribozomální podjednotka; • prekatalytický spliceosom; • komplex C / D snoRNP; • U4atac snRNP; • makromolekulární komplex; • Prekatalytický spliceosom typu U2; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Zpracování mRNA; • ribozomální biogeneze; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Sestřih RNA; • zrání LSU-rRNA; • zrání SSU-rRNA; • biosyntéza bílkovin; • zpracování rRNA; • jediné hnojení; • sestava snoRNP krabice C / D;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4809
	20826
	ENSG00000100138
	ENSMUSG00000063480
	P55769
	Q9D0T1
	NM_001003796; NM_005008
	NM_011482
	NP_001003796; NP_004999
	NP_035612
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný NHP2 1 je protein že u lidí je kódován NHP2L1 gen.^[4]^[5]

Funkce

Původně pojmenovaný kvůli své sekvenční podobnosti s Saccharomyces cerevisiae NHP2 (nehistonový protein 2), se tento protein jeví jako vysoce konzervovaný jaderný protein, který je součástí [U4 / U6.U5] tri-snRNP. Váže se na 5 'kmenovou smyčku U4 snRNA. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že NHP2L1 komunikovat s RAD17.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100138 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Saito H, Fujiwara T, Shin S, Okui K, Nakamura Y (leden 1997). „Klonování a mapování lidské nové cDNA (NHP2L1), která kóduje protein vysoce homologní s kvasinkovým jaderným proteinem NHP2“. Cytogenetika a genetika buněk. 72 (2–3): 191–3. doi:10.1159/000134186. PMID 8978773.
^ ^A ^b "Entrez Gene: NHP2L1 NHP2 nehistonový chromozomový protein 2 jako 1 (S. cerevisiae)".
^ Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (prosinec 1999). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.

Další čtení

Nottrott S, Hartmuth K, Fabrizio P, Urlaub H, Vidovic I, Ficner R, Lührmann R (listopad 1999). „Funkční interakce nového 15,5kD [U4 / U6.U5] proteinu tri-snRNP s 5 'kmenovou smyčkou U4 snRNA“. Časopis EMBO. 18 (21): 6119–33. doi:10.1093 / emboj / 18.21.6119. PMC 1171676. PMID 10545122.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (prosinec 1999). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.
Vidovic I, Nottrott S, Hartmuth K, Lührmann R, Ficner R (prosinec 2000). "Krystalová struktura spliceosomálního 15,5kD proteinu navázaného na fragment UR snRNA". Molekulární buňka. 6 (6): 1331–42. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00131-3. PMID 11163207.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (leden 2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Aktuální biologie. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298.
Leung AK, Lamond AI (květen 2002). „In vivo analýza NHPX odhaluje novou nukleolární lokalizační cestu zahrnující přechodnou akumulaci ve spojovacích skvrnách“. The Journal of Cell Biology. 157 (4): 615–29. doi:10.1083 / jcb.200201120. PMC 2173864. PMID 12011111.
Watkins NJ, Dickmanns A, Lührmann R (prosinec 2002). „Konzervovaný kmen II motivu C / D boxu je nezbytný pro nukleolární lokalizaci a je vyžadován spolu s proteinem 15.5K pro hierarchické sestavení box C / D snoRNP“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (23): 8342–52. doi:10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002. PMC 134055. PMID 12417735.
Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (listopad 2002). "Funkční proteomická analýza lidského nukleolu". Molekulární biologie buňky. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100138 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8978773-4] Saito H, Fujiwara T, Shin S, Okui K, Nakamura Y (leden 1997). „Klonování a mapování lidské nové cDNA (NHP2L1), která kóduje protein vysoce homologní s kvasinkovým jaderným proteinem NHP2“. Cytogenetika a genetika buněk. 72 (2–3): 191–3. doi:10.1159/000134186. PMID 8978773.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: NHP2L1 NHP2 nehistonový chromozomový protein 2 jako 1 (S. cerevisiae)".

[pmid10593953-6] Chang MS, Sasaki H, Campbell MS, Kraeft SK, Sutherland R, Yang CY, Liu Y, Auclair D, Hao L, Sonoda H, Ferland LH, Chen LB (prosinec 1999). „HRad17 kolokalizuje s NHP2L1 v jádře a redistribuuje se po UV záření“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (51): 36544–9. doi:10.1074 / jbc.274.51.36544. PMID 10593953.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]