RABGEF1 - RABGEF1
Směnný faktor HDP / GTP Rab5 je protein že u lidí je kódován RABGEF1 gen.[5][6][7]
RABGEF1 tvoří komplex s rabaptin-5 (RABPT5; MIM 603616), který je vyžadován pro endocytární membrána fúze a slouží jako specifika guaninový nukleotidový výměnný faktor pro RAB5 (RAB5A; MIM 179512) (Horiuchi et al., 1997) [dodáváno společností OMIM].[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154710 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025340 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Mattera R, Arighi CN, Lodge R, Zerial M, Bonifacino JS (prosinec 2002). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. EMBO J.. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. PMC 140067. PMID 12505986.
- ^ Nimmrich I, Erdmann S, Melchers U, Finke U, Hentsch S, Moyer MP, Hoffmann I, Muller O (prosinec 2000). "Sedm genů, které jsou rozdílně transkribovány v buněčných liniích kolorektálního nádoru". Cancer Lett. 160 (1): 37–43. doi:10.1016 / S0304-3835 (00) 00553-X. PMID 11098082.
- ^ A b „Entrez Gene: RABGEF1 RAB guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 1“.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Horiuchi H, Lippé R, McBride HM a kol. (1997). "Nový Rab5 GDP / GTP výměnný faktor komplexovaný s Rabaptin-5 spojuje výměnu nukleotidů s efektorovým náborem a funkcí". Buňka. 90 (6): 1149–59. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80380-3. PMID 9323142. S2CID 13972726.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Lippé R, Miaczynska M, Rybin V a kol. (2001). „Funkční synergie mezi Rab5 efektorem Rabaptin-5 a směnným faktorem Rabex-5, pokud jsou fyzicky spojeny v komplexu“. Mol. Biol. Buňka. 12 (7): 2219–28. doi:10,1091 / mbc. 12.7.2219. PMC 55678. PMID 11452015.
- de Renzis S, Sönnichsen B, Zerial M (2002). „Divalentní Rabovy efektory regulují subkompartmentovou organizaci a třídění časných endosomů“. Nat. Cell Biol. 4 (2): 124–33. doi:10.1038 / ncb744. PMID 11788822. S2CID 6596498.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
- Delprato A, Merithew E, Lambright DG (2004). "Struktura, směnné determinanty a celoškolní rab specificita tandemového spirálového svazku a domén Vps9 Rabex-5". Buňka. 118 (5): 607–17. doi:10.1016 / j.cell.2004.08.009. PMID 15339665. S2CID 9638315.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Penengo L, Mapelli M, Murachelli AG a kol. (2006). "Krystalová struktura vazebných domén ubikvitinu rabexu-5 odhaluje dva způsoby interakce s ubikvitinem". Buňka. 124 (6): 1183–95. doi:10.1016 / j.cell.2006.02.020. PMID 16499958. S2CID 2639312.
- Kalesnikoff J, Rios EJ, Chen CC a kol. (2007). „Role domén RabGEF1 / Rabex-5 při regulaci povrchové exprese Fc epsilon RI a odezev závislých na Fc epsilon RI v žírných buňkách“. Krev. 109 (12): 5308–17. doi:10.1182 / krev-2007-01-067363. PMC 1890836. PMID 17341663.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- Delprato A, Lambright DG (2007). "Strukturální základ pro aktivaci Rab GTPázy pomocí faktorů výměny domény VPS9". Nat. Struct. Mol. Biol. 14 (5): 406–12. doi:10.1038 / nsmb1232. PMC 2254184. PMID 17450153.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |