RAB38 - RAB38

RAB38
Identifikátory
Aliasy	RAB38, NY-MEL-1, rrGTPbp, člen onkogenní rodiny RAS
Externí ID	OMIM: 606281 MGI: 1919683 HomoloGene: 21353 Genové karty: RAB38
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	88,175,443 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	88,491,572 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Komplexní vazba adaptéru AP-2; • vazba nukleotidů; • Vazba komplexu BLOC-2; • Vazba GTP; • Vazba na protein závislá na GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Komplexní vazba adaptéru AP-3; • Komplexní vazba adaptéru AP-1; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • váček; • membrána fagocytických váčků; • Golgiho aparát; • membrána; • melanosom; • buněčná membrána; • časný endosom; • fagocytární váček; • endoplazmatické retikulum; • časný lumen endosomu; • cytoplazmatický váček; • lysozom; • mitochondrie; • Kontaktní místo membrány ER-mitochondrie; • cytosol; • melanosomová membrána; • trans-Golgiho síť;
Biologický proces	• lokalizace proteinu na membránu; • organizace hustých granulí krevních destiček; • organizace organel; • okyselení fagozomu; • transport endosomu do melanosomu; • transport bílkovin; • sestava melanosomu; • organizace mitochondrií; • transport zprostředkovaný vezikuly; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • posttranslační modifikace; • pozitivní regulace procesu biosyntézy fosfatidylcholinu; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23682
	72433
	ENSG00000123892
	ENSMUSG00000030559
	P57729
	Q8QZZ8
	NM_022337
	NM_028238
	NP_071732; NP_071732.1
	NP_082514
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-38 je protein že u lidí je kódován RAB38 gen.^[5]^[6]

V melanocytických buňkách může být exprese genu RAB38 regulována pomocí MITF.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123892 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030559 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jager D, Stockert E, Jager E, Gure AO, Scanlan MJ, Knuth A, Old LJ, Chen YT (srpen 2000). "Sérologické klonování melanocytového rab guanosinového proteinu vázajícího 5'-trifosfát a proteinu kondenzace chromozomů z melanomové komplementární DNA knihovny". Cancer Res. 60 (13): 3584–91. PMID 10910072.
^ „Entrez Gene: RAB38 RAB38, člen onkogenní rodiny RAS“.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

Další čtení

Chi A, Valencia JC, Hu ZZ a kol. (2007). "Proteomická a bioinformatická charakterizace biogeneze a funkce melanosomů". J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. doi:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Suzuki T, Miyamura Y, Inagaki K, Tomita Y (2004). "Charakterizace lidských genů RAB38 a RAB7: vyloučení nových hlavních patologických lokusů pro japonskou OCA". J. Dermatol. Sci. 32 (2): 131–6. doi:10.1016 / S0923-1811 (03) 00071-9. PMID 12850305.
Basrur V, Yang F, Kushimoto T a kol. (2003). "Proteomická analýza časných melanosomů: identifikace nových melanosomálních proteinů". J. Proteome Res. 2 (1): 69–79. doi:10.1021 / pr025562r. PMID 12643545.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Osanai K, Iguchi M, Takahashi K a kol. (2001). "Exprese a lokalizace románového malého malého proteinu G (Rab38) v plicní kryse". Dopoledne. J. Pathol. 158 (5): 1665–75. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64122-3. PMC 1891947. PMID 11337364.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123892 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030559 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10910072-5] Jager D, Stockert E, Jager E, Gure AO, Scanlan MJ, Knuth A, Old LJ, Chen YT (srpen 2000). "Sérologické klonování melanocytového rab guanosinového proteinu vázajícího 5'-trifosfát a proteinu kondenzace chromozomů z melanomové komplementární DNA knihovny". Cancer Res. 60 (13): 3584–91. PMID 10910072.

[entrez-6] „Entrez Gene: RAB38 RAB38, člen onkogenní rodiny RAS“.

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]