RAB11FIP2 - RAB11FIP2

RAB11FIP2

Protein RAB11FIP2 PDB 2gzd.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2 GZD, 2 GZH, 2K6S, 3TSO, 4C4P

Identifikátory

RAB11FIP2, Rab11-FIP2, nRip11, RAB11 rodina interagující protein 2

Externí ID

OMIM: 608599 MGI: 1922248 HomoloGene: 8937 Genové karty: RAB11FIP2

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 10 (lidský)^[1]

Kapela	10q26.11	Start	118,004,916 bp^[1]
Kapela	10q26.11	Konec	118,046,941 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 19 (myš)^[2]

Kapela	19 \| 19 D3	Start	59,902,884 bp^[2]
Kapela	19 \| 19 D3	Konec	59,943,654 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba protein kinázy • aktivita homodimerizace proteinu • identická vazba na protein • Vazba Rab GTPázy
Buněčná složka	• membrána • endozom • recyklace endosomové membrány • buněčná membrána • cytoplazmatická vezikulární membrána • nukleoplazma • intracelulární membránou vázaná organela • fagocytární pohár • buněčná projekce
Biologický proces	• transport bílkovin • regulovaná exocytóza • homeostáza ledvinové vody • stanovení polarity buněk • sekrece inzulínu zapojená do buněčné odpovědi na stimul glukózy • pozitivní regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu • fagocytóza • Signální dráha mýtného podobného receptoru 4 závislá na TRAM • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


22841


74998


ENSG00000107560


ENSMUSG00000040022


Q7L804


G3XA57

RefSeq (mRNA)


NM_014904 NM_001330167


NM_001033172 NM_001164367

RefSeq (protein)


NP_001317096 NP_055719


NP_001028344 NP_001157839

Místo (UCSC)

Chr 10: 118 - 118,05 Mb

Chr 19: 59,9 - 59,94 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Protein interagující s rodinou Rab11 2 je protein že u lidí je kódován RAB11FIP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

RAB11FIP2 bylo prokázáno komunikovat s MYO5B,^[8] RAB11A^[5]^[9]^[10] a RAB25.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000107560 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040022 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Lindsay AJ, McCaffrey MW (červenec 2002). „Rab11-FIP2 funguje při recyklaci transferinu a asociuje se s endozomálními membránami prostřednictvím své COOH-terminální domény“. J Biol Chem. 277 (30): 27193–9. doi:10,1074 / jbc.M200757200. PMID 11994279.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červenec 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
^ "Entrez Gene: RAB11FIP2 RAB11 rodina interagující protein 2 (třída I)".
^ Hales, Chadwick M; Vaerman Jean-Pierre; Goldenring James R (prosinec 2002). „Rodina Rab11 interagující s proteinem 2 se asociuje s Myosinem Vb a reguluje recyklaci plazmatické membrány“. J. Biol. Chem. 277 (52): 50415–21. doi:10,1074 / jbc.M209270200. ISSN 0021-9258. PMID 12393859.
^ ^A ^b Hales, CM; Griner R; Hobdy-Henderson K C; Dorn M C; Hardy D; Kumar R; Navarre J; Chan E K; Lapierre LA; Goldenring J R (říjen 2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". J. Biol. Chem. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. ISSN 0021-9258. PMID 11495908.
^ ^A ^b Prekeris, R; Davies J. M.; Scheller R H (říjen 2001). "Identifikace nové vazebné domény Rab11 / 25 přítomné v proteinech Eferin a Rip". J. Biol. Chem. 276 (42): 38966–70. doi:10,1074 / jbc.M106133200. ISSN 0021-9258. PMID 11481332.

Další čtení

Prekeris R, Davies JM, Scheller RH (2001). "Identifikace nové vazebné domény Rab11 / 25 přítomné v proteinech Eferin a Rip". J. Biol. Chem. 276 (42): 38966–70. doi:10,1074 / jbc.M106133200. PMID 11481332.
Hales CM, Griner R, Hobdy-Henderson KC a kol. (2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". J. Biol. Chem. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. PMID 11495908.
Wallace DM, Lindsay AJ, Hendrick AG, McCaffrey MW (2002). „Nová rodina proteinů Rab11-FIP / Rip / RCP vykazuje rozsáhlé homo- a heterointeragující schopnosti“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 292 (4): 909–15. doi:10.1006 / bbrc.2002.6736. PMID 11944901.
Cullis DN, Philip B, Baleja JD, Feig LA (2003). „Rab11-FIP2, adaptační protein spojující buněčné komponenty podílející se na internalizaci a recyklaci receptorů epidermálního růstového faktoru“. J. Biol. Chem. 277 (51): 49158–66. doi:10,1074 / jbc.M206316200. PMID 12364336.
Hales CM, Vaerman JP, Goldenring JR (2003). „Rodina Rab11 interagující s proteinem 2 se asociuje s Myosinem Vb a reguluje recyklaci plazmatické membrány“. J. Biol. Chem. 277 (52): 50415–21. doi:10,1074 / jbc.M209270200. PMID 12393859.
Wallace DM, Lindsay AJ, Hendrick AG, McCaffrey MW (2003). „Rab11-FIP4 interaguje s Rab11 způsobem závislým na GTP a jeho nadměrná exprese kondenzuje Rab11 pozitivní kompartment v HeLa buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (5): 770–9. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02720-1. PMID 12470645.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Fan GH, Lapierre LA, Goldenring JR a kol. (2005). „Pro interakci s CXCR2 a chemotaxi zprostředkovanou receptory jsou vyžadovány proteiny 2 interakce Rab11 a Myosin Vb“. Mol. Biol. Buňka. 15 (5): 2456–69. doi:10,1091 / mbc.E03-09-0706. PMC 404037. PMID 15004234.
Junutula JR, Schonteich E, Wilson GM a kol. (2004). "Molekulární charakterizace interakcí Rab11 s členy rodiny proteinů interagujících s Rab11". J. Biol. Chem. 279 (32): 33430–7. doi:10,1074 / jbc.M404633200. PMID 15173169.
Lindsay AJ, McCaffrey MW (2005). „Domény C2 rodiny interakčních proteinů Rab11 třídy I se zaměřují na recyklaci vezikul do plazmatické membrány“. J. Cell Sci. 117 (Pt 19): 4365–75. doi:10,1242 / jcs.01280. PMID 15304524.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Naslavsky N, Rahajeng J, Sharma M a kol. (2006). „Interakce mezi proteiny EHD a Rab11-FIP2: role pro EHD3 v časném endosomálním transportu“. Mol. Biol. Buňka. 17 (1): 163–77. doi:10,1091 / mbc.E05-05-0466. PMC 1345656. PMID 16251358.
Ducharme NA, Hales CM, Lapierre LA a kol. (2006). „MARK2 / EMK1 / Par-1Bα Fosforylace proteinu 2 interagujícího s rodinou Rab11 je nezbytná pro včasné stanovení polarity v ledvinových buňkách Madin-Darbyho psů“. Mol. Biol. Buňka. 17 (8): 3625–37. doi:10,1091 / mbc.E05-08-0736. PMC 1525241. PMID 16775013.
Ducharme NA, Williams JA, Oztan A a kol. (2007). „Rab11-FIP2 reguluje diferencovatelné kroky transcytózy“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 293 (3): C1059–72. doi:10.1152 / ajpcell.00078.2007. PMID 17626244. S2CID 34368157.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q7L804 (Protein 2 rodiny Rab11 interagující) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.