Pyrobaculum asR3 malá RNA - Pyrobaculum asR3 small RNA

xxx sRNA
RF02793.svg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence Pyrobaculum asRNA3
Identifikátory
RfamRF02793
Další údaje
DoményArchaea
JÍTGO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000077,SO: 0000370
PDB strukturPDBe

asR3 je archeal malá RNA identifikováno v sedmi Pyrobaculum druh. Rodově specifická povaha může naznačovat, že by to mohla být nedávná, stabilní adaptace.[1] asR3 se váže na 3'-konec tpi gen (triose-fosfát-isomerse ).[2] Tpi mRNA má konzervovaný strukturní prvek umístěný blízko stop kodonu. Vazba asR3 může být schopna konkurovat tvorbě struktury prvku tpi, což může modulovat funkci tohoto vysoce konzervativního prvku.[1]

Reference

  1. ^ A b Bernick DL, Dennis PP, Lui LM, Lowe TM (2012). „Rozmanitost antisense a dalších nekódujících RNA v Archaei odhalena srovnávací sekvencí malých RNA u čtyř druhů pyrobacula“. Hranice v mikrobiologii. 3: 231. doi:10.3389 / fmicb.2012.00231. PMC  3388794. PMID  22783241.
  2. ^ Alber T, Banner DW, Bloomer AC, Petsko GA, Phillips D, Rivers PS, Wilson IA (červen 1981). „O trojrozměrné struktuře a katalytickém mechanismu triosa fosfát izomerázy“. Filozofické transakce Královské společnosti v Londýně. Série B, Biologické vědy. 293 (1063): 159–171. doi:10.1098 / rstb.1981.0069. PMID  6115415.

Viz také

Další archaeal sRNA: