Pseudokináza - Pseudokinase

Pseudokinázy jsou katalyticky nedostatečné pseudoenzym[1] varianty proteinové kinázy které jsou zastoupeny ve všech kinomy napříč královstvími života. Pseudokinázy mají fyziologické (signální transdukce ) a patofyziologické funkce.[2][3][4][5][6][7][8]

Dějiny

Fráze pseudokináza byla poprvé vytvořena v roce 2002.[9] Následně byly dále zařazeny do různých „tříd“.[10][8][11][12][13] U člověka se nachází několik rodin obsahujících pseudokinázu kinom, včetně Tribokových pseudokináz, které jsou na rozhraní mezi kinázou a ubikvitin E3 ligáza signalizace.[14][15][16] Lidské pseudokinázy (a jejich pseudofosfatáza bratranci) se účastní celé řady nemocí,[17][18] což jim dalo potenciál drogové cíle a antitargets ).[19][20][21][22] Pseudokinázy jsou tvořeny evoluční směsí eukaryotické proteinové kinázy (ePK) a nesouvisející s ePK pseudoenzym proteiny (např. FAM20A, který váže ATP[23] a je pseudokináza kvůli konzervované glutamát na glutamin vyměňte spirálu alfa-C.[24] FAM20A je zapojen do periodontální onemocnění, a slouží ke kontrole katalytické aktivity FAM20C, důležitá fyziologická kasein kináza, která kontroluje fosforylace bílkovin v Golgiho aparát které jsou určeny k sekreci,[25] jako je mléčný protein kasein. Komplexní evoluční analýza potvrzuje, že pseudokinázy se seskupují do více podrodin, a ty se nacházejí v anotovaných kinom organismů napříč královstvími života, včetně prokaryot, archea a všech eukaryotických linií s anotací proteom; tato data lze prohledávat v ProKino (http://vulcan.cs.uga.edu/prokino/about/browser ). [26]

Viz také

Reference

  1. ^ Murphy JM, Farhan H, Eyers PA (duben 2017). „Bio-Zombie: vzestup pseudoenzymů v biologii“. Transakce s biochemickou společností. 45 (2): 537–544. doi:10.1042 / BST20160400. PMID  28408493.
  2. ^ Jacobsen AV, Murphy JM (červen 2017). „Tajný život kináz: poznatky o nekatalytických signálních funkcích pseudokináz“. Transakce s biochemickou společností. 45 (3): 665–681. doi:10.1042 / BST20160331. PMID  28620028.
  3. ^ Murphy JM, Zhang Q, Young SN, Reese ML, Bailey FP, Eyers PA, Ungureanu D, Hammaren H, Silvennoinen O, Varghese LN, Chen K, Tripaydonis A, Jura N, Fukuda K, Qin J, Nimchuk Z, Mudgett MB , Elowe S, Gee CL, Liu L, Daly RJ, Manning G, Babon JJ, Lucet IS (leden 2014). „Robustní metodika pro subklasifikaci pseudokináz na základě jejich vlastností vázajících nukleotidy“. The Biochemical Journal. 457 (2): 323–34. doi:10.1042 / BJ20131174. PMC  5679212. PMID  24107129.
  4. ^ Kannan N, Taylor SS (duben 2008). „Přehodnocení pseudokináz“. Buňka. 133 (2): 204–5. doi:10.1016 / j.cell.2008.04.005. PMC  6226312. PMID  18423189.
  5. ^ Mukherjee K, Sharma M, Urlaub H, GP Bourenkova, Jahn R, Südhof TC, Wahl MC (duben 2008). „CASK funguje jako neurexin kináza nezávislá na Mg2 +“. Buňka. 133 (2): 328–39. doi:10.1016 / j.cell.2008.02.036. PMC  3640377. PMID  18423203.
  6. ^ Bailey FP, Byrne DP, Oruganty K, Eyers CE, Novotny CJ, Shokat KM, Kannan N, Eyers PA (duben 2015). „Pseudokináza Tribbles 2 (TRB2) se váže na ATP a autofosforyluje způsobem nezávislým na kovu“. The Biochemical Journal. 467 (1): 47–62. doi:10.1042 / BJ20141441. PMC  4844368. PMID  25583260.
  7. ^ Shi F, Telesco SE, Liu Y, Radhakrishnan R, Lemmon MA (duben 2010). „ErbB3 / HER3 intracelulární doména je schopná vázat ATP a katalyzovat autofosforylaci“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (17): 7692–7. Bibcode:2010PNAS..107 7692S. doi:10.1073 / pnas.1002753107. PMC  2867849. PMID  20351256.
  8. ^ A b Zeqiraj E, Filippi BM, Deak M, Alessi DR, van Aalten DM (prosinec 2009). „Struktura komplexu LKB1-STRAD-MO25 odhaluje alosterický mechanismus aktivace kinázy“. Věda. 326 (5960): 1707–11. Bibcode:2009Sci ... 326.1707Z. doi:10.1126 / science.1178377. PMC  3518268. PMID  19892943.
  9. ^ Manning G, Whyte DB, Martinez R, Hunter T, Sudarsanam S (prosinec 2002). "Doplněk proteinové kinázy lidského genomu". Věda. 298 (5600): 1912–34. Bibcode:2002Sci ... 298.1912M. doi:10.1126 / science.1075762. PMID  12471243.
  10. ^ Boudeau J, Miranda-Saavedra D, Barton GJ, Alessi DR (září 2006). "Vznikající role pseudokináz". Trendy v buněčné biologii. 16 (9): 443–52. doi:10.1016 / j.tcb.2006.07.003. PMID  16879967.
  11. ^ Zeqiraj E, van Aalten DM (prosinec 2010). „Pseudokinázy - zbytky evoluce nebo klíčové alosterické regulátory?“. Aktuální názor na strukturní biologii. 20 (6): 772–81. doi:10.1016 / j.sbi.2010.10.001. PMC  3014569. PMID  21074407.
  12. ^ Scheeff ED, Eswaran J, Bunkoczi G, Knapp S, Manning G (leden 2009). „Struktura pseudokinázy VRK3 odhaluje degradované katalytické místo, vysoce konzervovaný záhyb kinázy a domnělé regulační vazebné místo“. Struktura. 17 (1): 128–38. doi:10.1016 / j.str.2008.10.018. PMC  2639636. PMID  19141289.
  13. ^ Eyers PA, Murphy JM (srpen 2013). „Úsvit mrtvých: proteinové pseudokinázy signalizují nová dobrodružství v buněčné biologii“. Transakce s biochemickou společností. 41 (4): 969–74. doi:10.1042 / BST20130115. PMID  23863165.
  14. ^ Eyers PA, Keeshan K, Kannan N (duben 2017). „Tribbles in the 21st Century: The Evolution Roles of Tribbles Pseudokinases in Biology and Disease“. Trendy v buněčné biologii. 27 (4): 284–298. doi:10.1016 / j.tcb.2016.11.002. PMC  5382568. PMID  27908682.
  15. ^ Foulkes DM, Byrne DP, Yeung W, Shrestha S, Bailey FP, Ferries S, Eyers CE, Keeshan K, Wells C, Drewry DH, Zuercher WJ, Kannan N, Eyers PA (září 2018). „Kovalentní inhibitory proteinových kináz rodiny EGFR indukují degradaci pseudokinázy lidských Tribbles 2 (TRIB2) v rakovinných buňkách“. Vědecká signalizace. 11 (549). doi:10.1126 / scisignal.aat7951. PMC  6553640. PMID  30254057.
  16. ^ Jamieson SA, Ruan Z, Burgess AE, Curry JR, McMillan HD, Brewster JL, Dunbier AK, Axtman AD, Kannan N, Mace PD (září 2018). "Vazba substrátu alostericky uvolňuje autoinhibici pseudokinázy TRIB1". Vědecká signalizace. 11 (549). doi:10.1126 / scisignal.aau0597. PMC  6553639. PMID  30254053.
  17. ^ Reiterer V, Eyers PA, Farhan H (září 2014). "Den mrtvých: pseudokinázy a pseudofosfatázy ve fyziologii a nemoci". Trendy v buněčné biologii. 24 (9): 489–505. doi:10.1016 / j.tcb.2014.03.008. PMID  24818526.
  18. ^ Chen MJ, Dixon JE, Manning G (duben 2017). "Genomika a vývoj proteinových fosfatáz". Vědecká signalizace. 10 (474): eaag1796. doi:10.1126 / scisignal.aag1796. PMID  28400531.
  19. ^ Byrne DP, Foulkes DM, Eyers PA (leden 2017). „Pseudokinázy: aktuální informace o jejich funkcích a hodnocení jako nové lékové cíle“. Budoucí léčivá chemie. 9 (2): 245–265. doi:10.4155 / fmc-2016-0207. PMID  28097887.
  20. ^ Bailey FP, Byrne DP, McSkimming D, Kannan N, Eyers PA (leden 2015). „Chystáte se na mizinu: zaměřit se na pseudokinom lidské rakoviny“. The Biochemical Journal. 465 (2): 195–211. doi:10.1042 / BJ20141060. PMID  25559089.
  21. ^ Cowan-Jacob SW, Jahnke W, Knapp S (duben 2014). "Nové přístupy k cílení na kinázy: alosterická inhibice, alosterická aktivace a pseudokinázy". Budoucí léčivá chemie. 6 (5): 541–61. doi:10,4155 / fmc.13.216. PMID  24649957.
  22. ^ Foulkes DM, Byrne DP, Bailey FP, Eyers PA (říjen 2015). „Tribbles pseudokinase: new targets for Chemical Biology and Drug Discovery?“. Transakce s biochemickou společností. 43 (5): 1095–103. doi:10.1042 / BST20150109. PMID  26517930.
  23. ^ Cui J, Zhu Q, Zhang H, Cianfrocco MA, Leschziner AE, Dixon JE, Xiao J (duben 2017). „Struktura Fam20A odhaluje pseudokinázu s jedinečným disulfidovým vzorem a invertovanou vazbou ATP“. eLife. 6. doi:10,7554 / eLife.23990. PMC  5413348. PMID  28432788.
  24. ^ Cui J, Xiao J, Tagliabracci VS, Wen J, Rahdar M, Dixon JE (březen 2015). "Komplex sekreční kinázy reguluje fosforylaci extracelulárních proteinů". eLife. 4: e06120. doi:10,7554 / eLife.06120. PMC  4421793. PMID  25789606.
  25. ^ Tagliabracci VS, Wiley SE, Guo X, Kinch LN, Durrant E, Wen J, Xiao J, Cui J, Nguyen KB, Engel JL, Coon JJ, Grishin N, Pinna LA, Pagliarini DJ, Dixon JE (červen 2015). „Jedna kináza generuje většinu vylučovaného fosfoproteomu“. Buňka. 161 (7): 1619–32. doi:10.1016 / j.cell.2015.05.028. PMC  4963185. PMID  26091039.
  26. ^ Kwon A, Scott S, Taujale R, Yeung W, Kochut KJ, Eyers PA, Kannan N (duben 2019). „Sledování původu a vývoje pseudokináz napříč stromem života“. Vědecká signalizace. 12 (578). doi:10.1126 / scisignal.aav3810. PMC  6997932. PMID  31015289.

Další čtení

externí odkazy