Vazebné místo primeru - Primer binding site

Vazebné místo pro primer HIV (PBS)
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence HIV_PBS
Identifikátory
Symbol	HIV_PBS
Rfam	RF00375
Další údaje
RNA typ	Cis-reg
Domény	Eukaryota; Viry
TAK	SO: 0000233
PDB struktur	PDBe

A vazebné místo primeru je kraj a nukleotid sekvence kde RNA nebo DNA jednovláknové primer váže začít replikace. Vazebné místo primeru je na jednom ze dvou komplementární prameny dvouvláknové nukleotid polymer ve vlákně, které má být kopírováno, nebo je v jednořetězcové nukleotidové polymerní sekvenci.^[1]

A PCR vazebné místo primeru je místo, kde a polymerázová řetězová reakce (PCR) primer váže k primární duplikaci komplementu k existující sekvenci DNA nebo RNA.

The HIV vazebné místo primeru je strukturované RNA element v genomech retroviry ke kterému tRNA váže k zahájení reverzní transkripce. U HIV je tRNA tRNA (3) (Lys)^[2] i když může používat jiné tRNA.^[3] Skládá se z 18 nukleotidy a následuje Region U5 z 5'-dlouhé opakování terminálu (LTR) retroviru.^[4]

Reference

^ Berg, Jeremy M .; Tymoczko, John L. & Stryer, Lubert. (c. 2002). „Replikace DNA obou řetězců probíhá rychle z konkrétních počátečních stránek“. Biochemie. New York: W. H. Freeman and Co.
^ Beerens, N; Groot F; Berkhout B (2001). „Zahájení reverzní transkripce HIV-1 je regulováno signálem aktivace primeru“. J Biol Chem. 276 (33): 31, 247–31, 256. doi:10,1074 / jbc.M102441200. PMID 11384976.
^ Das, AT; Klaver B; Berkhout B (1995). „Snížená replikace mutantů viru lidské imunodeficience typu 1, které používají primery reverzní transkripce jiné než přírodní tRNA (3) (Lys)“. J Virol. 69 (5): 3, 090–3, 097. PMC 189010. PMID 7707537.
^ Damgaard CK, Andersen ES, Knudsen B, Gorodkin J, Kjems J (2004). "Interakce RNA v 5 'oblasti genomu HIV-1". J Mol Biol. 336 (2): 369–379. doi:10.1016 / j.jmb.2003.12.010. PMID 14757051.

externí odkazy

Stránka pro vazebné místo pro primer HIV (PBS) na Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Berg, Jeremy M .; Tymoczko, John L. & Stryer, Lubert. (c. 2002). „Replikace DNA obou řetězců probíhá rychle z konkrétních počátečních stránek“. Biochemie. New York: W. H. Freeman and Co.

[2] Beerens, N; Groot F; Berkhout B (2001). „Zahájení reverzní transkripce HIV-1 je regulováno signálem aktivace primeru“. J Biol Chem. 276 (33): 31, 247–31, 256. doi:10,1074 / jbc.M102441200. PMID 11384976.

[3] Das, AT; Klaver B; Berkhout B (1995). „Snížená replikace mutantů viru lidské imunodeficience typu 1, které používají primery reverzní transkripce jiné než přírodní tRNA (3) (Lys)“. J Virol. 69 (5): 3, 090–3, 097. PMC 189010. PMID 7707537.

[pmid14757051-4] Damgaard CK, Andersen ES, Knudsen B, Gorodkin J, Kjems J (2004). "Interakce RNA v 5 'oblasti genomu HIV-1". J Mol Biol. 336 (2): 369–379. doi:10.1016 / j.jmb.2003.12.010. PMID 14757051.

[1]

[2]

[3]

[4]