Polynucleobacter - Polynucleobacter

Polynucleobacter
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Betaproteobakterie
Objednat:
Burkholderiales
Rodina:
Burkholderiaceae
Rod:
Polynucleobacter
Heckmann & Schmidt 1987,
opravit. Hahn a kol. 2009,
opravit. Hahn a kol. 2016
Zadejte druh
Polynucleobacter nezbytarius
Druh

P. acidiphobus Hahn et al. 2011
P. aenigmaticus Hahn et al. 2017
P. asymbiotus Hahn et al. 2016
P. campilacus Hahn et al. 2018
P. cosmopolitanus Hahn et al. 2010
P. difficilis Hahn et al. 2012
P. duraquae Hahn et al. 2016
P. hirudinilacicola Hahn et al. 2018
P. meluiroseus Pitt et al. 2018
P. nezbytarius Heckm. & Sch. 1987
P. paneuropaeus Hoetzi. et al. 2019
P. rarus Hahn et al. 2011
P. sinensis Hahn et al. 2016
P. sphagniphilus Hahn et al. 2017
P. victoriensis Hahn et al. 2017
P. wuianus Hahn et al. 2017
P. yangtzensis Hahn et al. 2016

Polynucleobacter je rod Proteobakterie, původně založili Heckmann a Schmidt (1987)[1] výlučně přístav povinně endosymbionty z náčelníci patřící do rodu Euplotes.

V poslední době několik nových Polynucleobacter druhy byly popsány,[2][3][4][5][6][7][8][9], což vše představuje volný život (tj. není spojen s hostitelem) planktonika sladkovodní bakterie. Tedy rod Polynucleobacter v současné době zahrnuje jeden druh obsahující obligátní endosymbionty nálevníků a devět druhů představujících volně žijící planktonické kmeny. The kmeny typu planktonických druhů bylo izolováno ze sladkovodních systémů umístěných v Arménie, Rakousko, Čína, Francie, Německo, Norsko, Uganda a Spojené státy. V současné době rod obsahuje 17 druhů.

Volný život Poynucleobacter bakterie představují důležité členy bakterioplankton ve sladkovodních systémech, jako jsou jezera, rybníky a potoky.[10]

Genomika

Dva genom projekty jsou dokončeny P. nezbytarius kmeny: jeden projekt na povinně volném kmeni izolovaném z kyselého sladkovodního rybníka,[11] a jeden projekt na obligátní endosymbiont náčelníka Euplotes aediculatus.[12]

Analýzy sekvencí genomu vedly k objevu konzervované RNA motiv.

Reference

  1. ^ Heckmann, K. a H. J. Schmidt (1987) Polynucleobacter nezbytarius gen. nov., sp. nov., povinně endosymbiotikum bakterie žijící v cytoplazmě Euplotes aediculatus. Int. J. Syst. Bacteriol. 37: 456-457. (doi: 10.1099 / 00207713-37-4-456)
  2. ^ Hahn, M.W., E. Lang, U. Brandt, H. Lünsdorf, Q. L. Wu a E. Stackebrandt (2010) Polynucleobacter cosmopolitanus sp. listopadu, volně žijící planktonní bakterie obývající sladkovodní jezera a řeky. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60: 166-173. (doi: 10.1099 / ijs.0.010595-0)
  3. ^ Hahn, M.W., E. Lang, U. Brandt a C. Spröer (2011) Polynucleobacter acidiphobus sp. nov., zástupce hojné skupiny planktonních sladkovodních bakterií. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 788-794. (doi: 10.1099 / ijs.0.023929-0)
  4. ^ Hahn, M.W., E. Lang, M. Tarao a U. Brandt (2011) Polynucleobacter rarus sp. nov., volně žijící planktonní bakterie izolovaná z kyselého jezera. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 781-787 (doi: 10.1099 / ijs.0.017350-0)
  5. ^ Hahn, M.W., A. Minasyan, E. Lang, U.Koll a C. Spröer (2012) Polynucleobacter difficilis sp. nov., planktonická sladkovodní bakterie přidružená k subkustru B1 rodu Polynucleobacter. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 62: 376-383. (doi: 10.1099 / ijs.0.031393-0)
  6. ^ Hahn, M.W., J. Schmidt, A. Pitt, S.J. Taipale a E. Lang (2016) Reklasifikace čtyř Polynucleobacter nezbytarius kmeny jako zástupci Polynucleobacter asymbiotus Hřeben. listopad., Polynucleobacter duraquae sp. listopad., Polynucleobacter yangtzensis sp. listopad. a Polynucleobacter sinensis sp. listopadu a upravený popis Polynucleobacter nezbytarius. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 2883-2892. (doi: 10.1099 / ijsem.0.001073)
  7. ^ Hahn, M.W., L.R. Huymann, U. Koll, J. Schmidt, E. Lang, M. Hoetzinger (2017) Polynucleobacter wuianus sp. listopadu, volně žijící sladkovodní bakterie přidružená k kryptickému druhovému komplexu PnecC. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67: 379-385. (doi: 10.1099 / ijsem.0.001637)
  8. ^ Pitt A., Schmidt J., Lang E., Whitman W.B., Woyke T., Hahn M. W. (2018). Polynucleobacter meluiroseus sp. nov., bakterie izolovaná z jezera nacházejícího se v horách středomořského ostrova Korsika. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68: 1975-1985 [1]
  9. ^ Hoetzinger M., Schmidt J., Pitt A., Koll U., Lang E., Hahn M.W. (2019) Polynucleobacter paneuropaeus sp. listopadu., charakterizované šesti kmeny izolovanými ze sladkovodních jezer nacházejících se v 3000 km severojižním průřezu napříč Evropou. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69:203-213. (doi: 10,1099 / ijsem.0.003130)
  10. ^ Jezberová, J., J. Jezbera, U. Brandt, E.S. Lindström, S. Langenheder a M. W. Hahn (2010). Všudypřítomnost Polynucleobacter nezbytarius ssp. asymbiotus na lentických sladkovodních stanovištích heterogenních 2 000 km2 plocha. Environ. Microbiol. 12: 658-669.
  11. ^ ZLATÁ KARTA: Gc00537 Projekt genomu: Polynucleobacter nezbytarius subsp. asymbiotus QLW-P1DMWA-1, GOLD - on-line databáze genomů
  12. ^ ZLATÁ KARTA: Gc00757 Projekt genomu: Polynucleobacter nezbytarius subsp. nezbytnost STIR1, GOLD - Genomes OnLine Database

externí odkazy