Plunc - Plunc

BPIFA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4KEG, 4KGH, 4KGO, 4N4X, 5I7K, 5I7J, 5I7L
Identifikátory
Aliasy	BPIFA1, LUNX, NASG, PLUNC, SPLUNC1, SPURT, bA49G10.5, BPI fold obsahující rodinu A člena 1
Externí ID	OMIM: 607412 MGI: 1338036 HomoloGene: 7895 Genové karty: BPIFA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	33,243,311 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	154,149,219 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba lipidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• negativní regulace tvorby jednodruhového biofilmu v hostitelském organismu nebo na něm; • mnohobuněčná homeostáza ve vodě; • obranná reakce na bakterii; • regulace transmembránového transportu sodíkových iontů; • antibakteriální humorální odpověď; • proces imunitního systému; • vrozený imunitní systém; • antimikrobiální humorální odpověď; • regulace povrchového napětí kapaliny; • imunitní odpověď v lymfoidní tkáni spojené s nosohltanem; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51297
	18843
	ENSG00000198183
	ENSMUSG00000027483
	Q9NP55
	P97361
	NM_001243193; NM_016583; NM_130852
	NM_011126
	NP_001230122; NP_057667; NP_570913
	NP_035256
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Klonový protein patra, plic a nosního epitelu^[5] (PLUNC) je gen kódování a sekreční protein. Nazývá se také sekreční protein v horních dýchacích cestách (SPURT). U lidí je kódován BPIFA1 gen, dříve nazývaný PLUNC.^[6]^[7]

Funkce

Tento gen je lidským homologem myšího plunku a stejně jako myší gen je specificky exprimován v dýchacích cestách a nazofaryngeální regionech. Plunc inhibuje epitelový sodíkový kanál (ENaC),^[8] a má také antimikrobiální funkce.^[9] Proto se předpokládá, že plunc hraje roli v vrozená imunitní obrana v dýchacích cestách. Schopnost PLUNC regulovat ENaC je citlivá na pH a v kyselině selhává cystická fibróza dýchacích cest.^[10] Předpokládá se tedy, že vadná funkce PLUNC1 přispívá k rozvoji plicní patologie u pacientů s cystickou fibrózou.

Může také sloužit jako potenciální molekulární marker pro detekci mikrometastáza v nemalobuněčný karcinom plic.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198183 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027483 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ghafouri, B. (2003). "PLUNC (patro, plíce a nosní epiteliální klon) proteiny v lidské nosní laváži". Biochem Soc Trans. 31 (4): 810–4. doi:10.1042 / bst0310810. PMID 12887311.
^ Bingle CD, Bingle L (říjen 2000). "Charakterizace lidského genu plunc, genového produktu s horními dýchacími cestami a nazofaryngeálním omezeným expresním vzorem". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1493 (3): 363–7. doi:10.1016 / S0167-4781 (00) 00196-2. PMID 11018263.
^ Iwao K, Watanabe T, Fujiwara Y, Takami K, Kodama K, Higashiyama M, Yokouchi H, Ozaki K, Monden M, Tanigami A (únor 2001). „Izolace nového lidského plicně specifického genu, LUNX, potenciální molekulární marker pro detekci mikrometastázy u nemalobuněčného karcinomu plic“. International Journal of Cancer. 91 (4): 433–7. doi:10.1002 / 1097-0215 (200002) 9999: 9999 <:: AID-IJC1059> 3.0.CO; 2-B. PMID 11251963.
^ Garcia-Caballero A, Rasmussen JE, Gaillard E, Watson MJ, Olsen JC, Donaldson SH, Stutts MJ, Tarran R (červenec 2009). "SPLUNC1 reguluje objem kapaliny na povrchu dýchacích cest tím, že chrání ENaC před proteolytickým štěpením". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (27): 11412–7. Bibcode:2009PNAS..10611412G. doi:10.1073 / pnas.0903609106. PMC 2708735. PMID 19541605.
^ 6
^ Garland AL, Walton WG, Coakley RD, Tan CD, Gilmore RC, Hobbs CA, Tripathy A, Clunes LA, Bencharit S, Stutts MJ, Betts L, Redinbo MR, Tarran R (říjen 2013). „Molekulární základ pro dehydrataci sliznice závislou na pH v dýchacích cestách s cystickou fibrózou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (40): 15973–8. Bibcode:2013PNAS..11015973G. doi:10.1073 / pnas.1311999110. PMC 3791714. PMID 24043776.
^ „Entrez Gene: PLUNC“.

Další čtení

Zhang B, Nie X, Xiao B, Xiang J, Shen S, Gong J, Zhou M, Zhu S, Zhou J, Qian J, Lu H, He X, Li X, Hu G, Li G (září 2003). „Identifikace genů specifických pro tkáň v epiteliální tkáni nosohltanu a diferenčně exprimovaných genů v karcinomu nosohltanu potlačením subtraktivní hybridizace a mikropolí cDNA“. Geny, chromozomy a rakovina. 38 (1): 80–90. doi:10,1002 / gcc.10247. PMID 12874788. S2CID 24805514.
Garcia-Caballero A, Rasmussen JE, Gaillard E, Watson MJ, Olsen JC, Donaldson SH, Stutts MJ, Tarran R (červenec 2009). "SPLUNC1 reguluje objem kapaliny na povrchu dýchacích cest tím, že chrání ENaC před proteolytickým štěpením". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (27): 11412–7. Bibcode:2009PNAS..10611412G. doi:10.1073 / pnas.0903609106. PMC 2708735. PMID 19541605.
Zhang BC, Zhu SG, Xiang JJ, Zhou M, Nie XM, Xiao BY, Li XL, Li GY (květen 2003). „[Analýza sestřihových variant v NASG 3'UTR, down-regulovaná v nazofaryngeálním karcinomu a její exprese ve více rakovinných tkáních]“. AI Zheng = Aizheng = Čínský žurnál o rakovině. 22 (5): 477–80. PMID 12753706.
Dagle JM, Lepp NT, Cooper ME, Schaa KL, Kelsey KJ, Orr KL, Caprau D, Zimmerman CR, Steffen KM, Johnson KJ, Marazita ML, Murray JC (duben 2009). „Stanovení genetické predispozice k ductus arteriosus u předčasně narozených dětí“. Pediatrie. 123 (4): 1116–23. doi:10.1542 / peds.2008-0313. PMC 2734952. PMID 19336370.
Bryborn M, Halldén C, Säll T, Cardell LO (únor 2010). „CLC - nový gen náchylnosti k alergické rýmě?“. Alergie. 65 (2): 220–8. doi:10.1111 / j.1398-9995.2009.02141.x. PMID 19650845. S2CID 29636426.
Cheng M, Chen Y, Yu X, Tian Z, Wei H (2008). „Diagnostická užitečnost mRNA LunX v periferní krvi a pleurální tekutině u pacientů s primárním nemalobuněčným karcinomem plic“. Rakovina BMC. 8: 156. doi:10.1186/1471-2407-8-156. PMC 2424066. PMID 18513434.
Zhou HD, Li GY, Yang YX, Li XL, Sheng SR, Zhang WL, Zhao J (duben 2006). „Intracelulární lokalizace proteinu SPLUNC1 s nanobakteriemi v buňkách epitelu HNE1 karcinomu nosohltanu závisela na proteinové doméně zvyšující baktericidní permeabilitu“. Molekulární imunologie. 43 (11): 1864–71. doi:10.1016 / j.molimm.2005.10.021. PMID 16364440.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Zhou HD, Fan SQ, Zhao J, Huang DH, Zhou M, Liu HY, Zeng ZY, Yang YX, Huang H, Li XL, Shen SR, Li GY (březen 2006). "Tkáňová distribuce sekrečního proteinu, SPLUNC1, v lidském plodu". Histochemie a buněčná biologie. 125 (3): 315–24. doi:10.1007 / s00418-005-0070-4. PMID 16195890. S2CID 20600762.
Sentani K, Oue N, Sakamoto N, Arihiro K, Aoyagi K, Sasaki H, Yasui W (duben 2008). "Profilování genové exprese pomocí microarray a SAGE identifikuje PLUNC jako marker pro hepatoidní adenokarcinom žaludku". Moderní patologie. 21 (4): 464–75. doi:10.1038 / modpathol.3801050. PMID 18204429.
Bingle CD, Gorr SU (listopad 2004). „Ochrana hostitele v orálním epitelu a epitelu dýchacích cest: chromozom 20 přispívá k nové rodině proteinů“. International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 36 (11): 2144–52. doi:10.1016 / j.biocel.2004.05.002. PMID 15313462.
Campos MA, Abreu AR, Nlend MC, Cobas MA, Conner GE, Whitney PL (únor 2004). "Čištění a charakterizace PLUNC z lidských tracheobronchiálních sekretů". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 30 (2): 184–92. doi:10.1165 / rcmb.2003-0142OC. PMID 12920053.
He Y, Ding YQ, Huang ZX, Yao KT (červen 2007). „[Sdružení polymorfismů jednonukleotidové kódující oblasti v genu PLUNC s karcinomem nosohltanu]“. Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 87 (22): 1553–5. PMID 17785110.
Wang WB, Cui YG, Yao SY (únor 2008). "[Zpráva RNA exprese genů LUNX, CK19 a CEA v NSCLC s mikrometastázou v lymfatických uzlinách]". Zhonghua Zhong Liu Za Zhi [Chinese Journal of Oncology]. 30 (2): 121–4. PMID 18646695.
Bartlett JA, Hicks BJ, Schlomann JM, Ramachandran S, Nauseef WM, McCray PB (květen 2008). „PLUNC je vylučovaný produkt granulí neutrofilů“. Journal of Leukocyte Biology. 83 (5): 1201–6. doi:10.1189 / jlb.0507302. PMID 18245229. S2CID 19196781.
Zhou HD, Li XL, Li GY, Zhou M, Liu HY, Yang YX, Deng T, Ma J, Sheng SR (únor 2008). "Vliv proteinu SPLUNC1 na Pseudomonas aeruginosa a virus Epstein-Barr". Molekulární a buněčná biochemie. 309 (1–2): 191–7. doi:10.1007 / s11010-007-9659-3. PMID 18049866. S2CID 23343796.
Ghafouri B, Kihlström E, Tagesson C, Lindahl M (červen 2004). „PLUNC v tekutině pro výplach lidského nosu: několik izoforem, které se vážou na lipopolysacharid“. Biochimica et Biophysica Acta. 1699 (1–2): 57–63. doi:10.1016 / j.bbapap.2004.01.001. PMID 15158712.
Bingle L, Barnes FA, Cross SS, Rassl D, Wallace WA, Campos MA, Bingle CD (2007). „Diferenciální epiteliální exprese domnělé vrozené imunitní molekuly SPLUNC1 při cystické fibróze“. Respirační výzkum. 8: 79. doi:10.1186/1465-9921-8-79. PMC 2203987. PMID 17988392.

externí odkazy

PLUNC + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198183 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027483 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Ghafouri, B. (2003). "PLUNC (patro, plíce a nosní epiteliální klon) proteiny v lidské nosní laváži". Biochem Soc Trans. 31 (4): 810–4. doi:10.1042 / bst0310810. PMID 12887311.

[pmid11018263-6] Bingle CD, Bingle L (říjen 2000). "Charakterizace lidského genu plunc, genového produktu s horními dýchacími cestami a nazofaryngeálním omezeným expresním vzorem". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1493 (3): 363–7. doi:10.1016 / S0167-4781 (00) 00196-2. PMID 11018263.

[pmid11251963-7] Iwao K, Watanabe T, Fujiwara Y, Takami K, Kodama K, Higashiyama M, Yokouchi H, Ozaki K, Monden M, Tanigami A (únor 2001). „Izolace nového lidského plicně specifického genu, LUNX, potenciální molekulární marker pro detekci mikrometastázy u nemalobuněčného karcinomu plic“. International Journal of Cancer. 91 (4): 433–7. doi:10.1002 / 1097-0215 (200002) 9999: 9999 <:: AID-IJC1059> 3.0.CO; 2-B. PMID 11251963.

[GarciaCaballero2009-8] Garcia-Caballero A, Rasmussen JE, Gaillard E, Watson MJ, Olsen JC, Donaldson SH, Stutts MJ, Tarran R (červenec 2009). "SPLUNC1 reguluje objem kapaliny na povrchu dýchacích cest tím, že chrání ENaC před proteolytickým štěpením". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (27): 11412–7. Bibcode:2009PNAS..10611412G. doi:10.1073 / pnas.0903609106. PMC 2708735. PMID 19541605.

[9] 6

[Garland2013-10] Garland AL, Walton WG, Coakley RD, Tan CD, Gilmore RC, Hobbs CA, Tripathy A, Clunes LA, Bencharit S, Stutts MJ, Betts L, Redinbo MR, Tarran R (říjen 2013). „Molekulární základ pro dehydrataci sliznice závislou na pH v dýchacích cestách s cystickou fibrózou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (40): 15973–8. Bibcode:2013PNAS..11015973G. doi:10.1073 / pnas.1311999110. PMC 3791714. PMID 24043776.

[entrez-11] „Entrez Gene: PLUNC“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]