Picrophilus torridus - Picrophilus torridus - Wikipedia
| Picrophilus torridus | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | P. torridus |
| Binomické jméno | |
| Picrophilus torridus Schleper et al. 1996 | |
Picrophilus torridus je druh Archaea popsáno v roce 1996.[1] Picrophilus torridus byl nalezen v půdě poblíž a teplé jaro v Hokkaido, Japonsko. The pH půdy bylo méně než 0,5.[2] P. torridus má také jeden z nejmenších genomů nalezených mezi organismy, které jsou volně žijící a jsou neparazitické a mají vysokou hustotu kódování, což znamená, že většina jeho genů jsou kódující oblasti a poskytují pokyny pro tvorbu proteinů. Současný výzkum naznačuje dva nepřátelské podmínky (vysoké teploty a nízké pH), které zvýhodňuje P. torridus vyvinuli selektivní tlak na malý a kompaktní genom, u kterého je menší pravděpodobnost poškození drsným prostředím.[3][4]
Reference
- ^ Schleper; Pühler; Klenk & Zillig (červenec 1996). „Picrophilus oshimae a Picrophilus tomdus fam. Nov., Gen. Nov., Sp. Nov., Dva druhy hyperacidofilní, termofilní, heterotrofní, aerobní archy“ (PDF). International Journal of Systematic Bacteriology. Mezinárodní unie mikrobiologických společností. 46 (3): 814–816. doi:10.1099/00207713-46-3-814. ISSN 1466-5034. OCLC 807119723. Archivovány od originál (PDF) dne 15. června 2015. Citováno 31. října 2013.
- ^ Siddiqui; Thomas, eds. (2008). „Thermoacidophiles and their Protein Adaptace to Low pH and High Temperature“. Adaptace proteinů u extremofilů. Vydavatelé Nova. ISBN 9781604560190. Citováno 31. října 2013.
- ^ Angelov, A .; Liebl, W. (2006-10-20). „Pohledy na extrémní termoacidofilii založené na genomové analýze Picrophilus torridus a dalších termoacidofilních archaeí“. Journal of Biotechnology. Aspekty výzkumu prokaryotického genomu. 126 (1): 3–10. doi:10.1016 / j.jbiotec.2006.02.017. ISSN 0168-1656. PMID 16621083.
- ^ Schepers, B .; Thiemann, V .; Antranikian, G. (červen 2006). „Charakterizace nové glukoamylázy z Thermoacidophilic ArchaeonPicrophilus torridus Heterologně vyjádřeno v E. coli“. Inženýrství v biologických vědách. 6 (3): 311–317. doi:10.1002 / elsc.200620131. ISSN 1618-0240. S2CID 85128507.
Další čtení
- Arora, Jasmine; Goswami, Kasturi; Saha, Swati (leden 2014). „Charakterizace iniciátoru replikace Orc1 / Cdc6 z Archaeon Picrophilus torridus“. Journal of Bacteriology. 196 (2): 276–286. doi:10.1128 / JB.01020-13. PMC 3911243. PMID 24187082.
- Frick, Eduard; Spatzal, Thomas; Gerhardt, Stefan; Andreas, Krämer; Oliver, Einsle; Wolfgang, Hüttel (13. dubna 2014). "Strukturální a funkční charakterizace 4-hydroxyfenylpyruvát dioxygenázy z termoacidofilního archaeonu Picrophilus torridus". Extremophiles. 18 (4): 641–651. doi:10.1007 / s00792-014-0645-x. ISSN 1433-4909. PMID 24794033. S2CID 13898874.
- Rajput, Rinky; Verma, Ved Vrat; Chaudhary, Vishal; Gupta, Rani (leden 2013). „Hydrolytická gama-glutamyl transpeptidáza z termo-acidofilního archaeonu Picrophilus torridus: vazebná kapesní mutageneze a transpeptidace“. Extremophiles. 17 (1): 29–41. doi:10.1007 / s00792-012-0490-8. PMID 23104165. S2CID 17563963.
- Reher, Matthias; Fuhrer, Tobias; Bott, Michael; Schonheit, Peter (5. prosince 2009). „Nefosforylační Entner-Doudoroffova cesta v termoacidofilní Euryarchaeon Picrophilus torridus zahrnuje novou aldolázu specifickou pro 2-keto-3-deoxyglukonát“. Journal of Bacteriology. 192 (23): 964–974. doi:10.1128 / JB.01281-09. PMC 2812977. PMID 20023024.
- Thurmer, Andrea; Voigt, Birgit; Angelov, Angel; Albrecht, Dirk; Hecker, Michael; Liebl, Wolfgang (prosinec 2011). „Proteomická analýza extrémně termoacidofilního archaeonu Picrophilus torridus při hodnotách pH a teploty blízkých jeho hranici růstu“. Proteomika. 11 (23): 4559–4568. doi:10.1002 / pmic.201000829. PMID 22114103. S2CID 25035919.