Peter Koopman - Peter Koopman - Wikipedia

Peter Anthony Koopman FAA (narozen 3. prosince 1959) je australský biolog, nejlépe známý svou rolí při objevování a studiu savčího genu Y-chromozomálního pohlaví určujícího pohlaví Sry.[1][2][3][4]

raný život a vzdělávání

Peter Anthony Koopman se narodil 3. prosince 1959 v Geelong, Victoria, nizozemským rodičům přistěhovalců a vyrůstali v pobřežním městě Torquay. Navštěvoval Oberon High School v Geelongu, kde byl školním kapitánem. Studoval vědu na University of Melbourne v letech 1977 až 1979 se specializací na genetiku a byl rezidentem Janet Clarke Hall. Provedl výzkum BSc Honors ve Výzkumném ústavu pro vrozené vady (nyní Murdochův dětský výzkumný ústav ) v Královské dětské nemocnici v Melbourne pod dohledem Richard (Dick) Bavlna a promoval s vyznamenáním první třídy.

V práci s Cottonem se jeho PhD zaměřil na diferenciaci kmenových buněk in vitro. Během této doby také studoval japonštinu, výtvarné umění a nizozemský jazyk a literaturu a v roce 1985 získal titul BA na University of Melbourne.

Získal titul doktor věd (DSc) z University of Queensland v červenci 2018.

Kariéra a výzkum

Objev Sry a genetika determinace pohlaví

V roce 1988 byl Koopman přijat do Národního institutu pro lékařský výzkum v Radě pro lékařský výzkum v Mill Hill v Londýně, kde pracoval nejprve s Anne McLaren a poté se připojil k týmu vedenému Robinem Lovell-Badgeem, aby hledal gen určující chromozomální pohlaví Y. Koopman prokázal, že aktivita myších homologů existujícího kandidáta, ZFY, nebyla v souladu s rolí v určení pohlaví.[5] Tým Lovell-Badge ve spolupráci s Peterem Goodfellowem a kolegy z Imperial Cancer Research Fund v Londýně objevil nový kandidátský gen, Sry.[1][6] Koopman a kolegové injikovali Sryho do oplodněných XX myších vajec, které se ve výsledku vyvinuly jako muži, což prokázalo roli Sry při určování mužského pohlaví.[3] Objev je považován za jeden z hlavních úspěchů v molekulární genetice ve 20. století.

Velká část následného výzkumu Koopmana se zaměřila na pochopení toho, jak Sry působí, aby řídila tvorbu varlat v embryu a spouštěla ​​mužský vývoj. Tato práce zahrnovala identifikaci a / nebo studium velkého počtu dalších genů zapojených do vývoje varlat nebo vaječníků.[7]

Geny Sox

Založení vlastní výzkumné skupiny[8] na univerzitě v Queenslandu v Brisbane v Austrálii v roce 1992 se Koopman rozhodl objevit nové členy rostoucí rodiny genů souvisejících s geny Sry - „Sox“.[9][10] Mezi první objevy patřila Sox9,[11] klíčový regulátor vývoje skeletu a varlat, který nese mutace u lidí s poruchou skeletu kampomelická dysplázie a související obrácení pohlaví XY.[12]

Koopmanova skupina také objevila Sox18,[13][14] přepínací gen, který řídí tvorbu lymfatických cév,[15] a je vadný u lidí s hypotrichóza-lymfedém-telangiektázie syndrom.[16] Vzhledem k úloze lymfatických cév v nádorových metastázách se Sox18 vyvíjí jako potenciální lékový cíl pro anti-metastatickou léčbu rakoviny.[17]

Koopman zjistil, že lidské a myší genomy obsahují 20 Soxových genů,[18] a navrhl systém pojmenování genů Sox, který se dodnes používá.[19]

Sex zárodečných buněk

Koopmanova raná práce s Anne McLaren vyvolala zájem o regulaci zárodečné buňky během vývoje plodu - buňky, z nichž se později stanou spermie nebo oocyty.[20] Jeho skupina zjistila, že vitamin A je metabolit kyselina retinová stimuluje zárodečné buňky ke vstupu redukční dělení buněk, kritický krok při tvorbě gamet.[21] Rovněž prokázali, že vývojová signální molekula Nodal a jeho receptor Cripto reguluje mužské zárodečné buňky pluripotence ve fetální pohlavní žláze,[22] otevírá cestu nové neinvazivní diagnostice a cíleným dalším terapiím rakoviny varlat.[23]

Intersex advokacie

S rostoucím zájmem o lidské variace vývoje pohlaví (alternativně známé jako DSD, rozdíly nebo poruchy pohlavního vývoje, rozdíly v pohlavních charakteristikách nebo intersex ), Koopman začal spolupracovat s příslušnými klinickými lékaři a intersexuálními advokačními a podpůrnými skupinami. Aby uspokojil potřebu nezaujatých informací týkajících se příčin, typů, dopadů DSD a možností pro postižené lidi, napsal Koopman webová stránka, publikovaný pod záštitou Australana Národní rada pro zdraví a lékařský výzkum Výzkumný program v oblasti lidských DSD. Pokračuje ve spolupráci s australskou pediatrickou endokrinní skupinou a řadou advokačních skupin s cílem zlepšit dialog a zvládání těchto stavů.[24]

Integrita výzkumu

Od roku 2012 do roku 2017 působil Koopman jako výkonný ředitel pro integritu výzkumu na University of Queensland, kde poskytoval akademický dozor nad integritou výzkumu a řídil obvinění ze zneužití výzkumu.

Rovnost a rozmanitost

Koopman je spolupředsedou referenční skupiny pro akciové a rozmanitosti na Australian Academy of Science[25] a je členkou pracovního výboru pro ženy ve zdravotnictví NHMRC Australia,[26] a podílí se na vývoji Dekadického plánu pro ženy v STEM[27] zadala australská vláda.

Ocenění a vyznamenání

1981: Vyznamenání First Class, Department of Genetics, The University of Melbourne

1992: Cena AMP za biomedicínský výzkum, Australská společnost pro lékařský výzkum

1992: Australian Research Fellowship, Australian Research Council

1998: medaile Julian Wells, Lorne Genome Conference Inc.[28]

2002: Australian Professorial Fellowship, Australian Research Council[29]

2003: Amersham-Pharmacia Biotech Medal, Australská společnost pro biochemii a molekulární biologii[30]

2005: President's Medal, Australia and New Zealand Society for Cell and Developmental Biology[31]

2007: Australian Professorial Fellowship, Australian Research Council[32]

2007: Cena za vynikající výzkum, GSK Australia[33]

2008: pracovník Australské akademie věd (FAA)[34]

2009: Lembergova medaile, Australská společnost pro biochemii a molekulární biologii[35]

Další úspěchy

Koopman inicioval Australian Developmental Biology Workshop (2001-), Australian Sex Summit (2004-) a International Workshop on Sox Transcription Factors (2005-). Byl organizátorem semináře Cold Spring Harbor (USA) o molekulární embryologii myší (1995-1998) a předsedou Gordon Research Conference on Germinal Stem Cell Biology (2017).

Koopman proškolil 34 postdoktorandských výzkumných pracovníků a 28 doktorandů. Publikoval více než 280 výzkumných prací, které byly citovány více než 19 000krát.[36]

Reference

  1. ^ A b Gubbay, John; Collignon, Jérôme; Koopman, Peter; Capel, Blanche; Economou, Androulla; Münsterberg, Andrea; Vivian, Nigel; Goodfellow, Peter; Lovell-Badge, Robin (červenec 1990). „Genové mapování do oblasti určující pohlaví myšího chromozomu Y je členem nové rodiny embryonálně exprimovaných genů“. Příroda. 346 (6281): 245–250. doi:10.1038 / 346245a0. ISSN  0028-0836. PMID  2374589.
  2. ^ Koopman, Peter; Münsterberg, Andrea; Capel, Blanche; Vivian, Nigel; Lovell-Badge, Robin (listopad 1990). "Exprese kandidátského genu určujícího pohlaví během diferenciace myšího varlete". Příroda. 348 (6300): 450–452. doi:10.1038 / 348450a0. ISSN  0028-0836. PMID  2247150.
  3. ^ A b Koopman, Peter; Gubbay, John; Vivian, Nigel; Goodfellow, Peter; Lovell-Badge, Robin (květen 1991). "Mužský vývoj chromozomálně samičích myší transgenních pro Sry". Příroda. 351 (6322): 117–121. doi:10.1038 / 351117a0. ISSN  0028-0836. PMID  2030730.
  4. ^ University of Queensland. „UQ Researchers“.
  5. ^ Koopman, Peter; Gubbay, John; Collignon, Jérôme; Lovell-Badge, Robin (prosinec 1989). „Vzory genové exprese Zfy nejsou kompatibilní s primární rolí při určování pohlaví myší“. Příroda. 342 (6252): 940–942. doi:10.1038 / 342940a0. ISSN  0028-0836. PMID  2480529.
  6. ^ Sinclair, Andrew H .; Berta, Philippe; Palmer, Mark S .; Hawkins, J. Ross; Griffiths, Beatrice L .; Smith, Matthijs J .; Foster, Jamie W .; Frischauf, Anna-Maria; Lovell-Badge, Robin (červenec 1990). „Gen z oblasti určující lidské pohlaví kóduje protein s homologií se zachovaným motivem vázajícím DNA“. Příroda. 346 (6281): 240–244. doi:10.1038 / 346240a0. ISSN  0028-0836. PMID  1695712.
  7. ^ „UQ eSpace“. espace.library.uq.edu.au. Citováno 10. října 2018.
  8. ^ „Institute for Molecular Bioscience - University of Queensland“. Ústav pro molekulární biologii. Citováno 10. října 2018.
  9. ^ Wright, Edwina M .; Snopek, Bernadette; Koopman, Peter (1993). "Sedm nových členů rodiny oxidogenů vyjádřeno během vývoje myši". Výzkum nukleových kyselin. 21 (3): 744. doi:10.1093 / nar / 21.3.744. ISSN  0305-1048. PMC  309180. PMID  8441686.
  10. ^ Koopman P, Bullejos M, Bowles J. (2001). "Regulace mužského sexuálního vývoje Sry a Sox9". Journal of Experimental Zoology. 290 (5): 463–474. doi:10.1002 / jez.1089. PMID  11555853.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  11. ^ Wright, Edwina; Hargrave, Murray R .; Christiansen, Jeffrey; Cooper, Leanne; Kun, Jutta; Evans, Timothy; Gangadharan, Uma; Greenfield, Andy; Koopman, Peter (leden 1995). „Sry-příbuzný gen Sox9 je exprimován během chondrogeneze v myších embryích“. Genetika přírody. 9 (1): 15–20. doi:10.1038 / ng0195-15. ISSN  1061-4036. PMID  7704017.
  12. ^ Foster, Jamie W .; Dominguez-Steglich, Marina A .; Guioli, Silvana; Kwok, Cheni; Weller, Polly A .; Stevanović, Milena; Weissenbach, Jean; Mansour, Sahar; Young, Ian D. (prosinec 1994). „Campomelická dysplázie a autozomální reverze pohlaví způsobená mutacemi genu souvisejícího se SRY“. Příroda. 372 (6506): 525–530. doi:10.1038 / 372525a0. ISSN  0028-0836. PMID  7990924.
  13. ^ Hosking, Brett M .; Muscat, George E.O .; Koopman, Peter A .; Dowhan, Dennis H .; Dunn, Timothy L. (1995). "Transaktivační a DNA vazebné vlastnosti transkripčního faktoru, Sox-18". Výzkum nukleových kyselin. 23 (14): 2626–2628. doi:10.1093 / nar / 23.14.2626. ISSN  0305-1048. PMC  307084. PMID  7651823.
  14. ^ Pennisi, David; Gardner, Jennifer; Chambers, Doreen; Hosking, Brett; Peters, Josephine; Muscat, George; Abbott, Catherine; Koopman, Peter (duben 2000). "Mutace v Sox18 jsou základem kardiovaskulárních a vlasových folikulárních defektů u otrhaných myší". Genetika přírody. 24 (4): 434–437. doi:10.1038/74301. ISSN  1061-4036. PMID  10742113.
  15. ^ François, Mathias; Caprini, Andrea; Hosking, Brett; Orsenigo, Fabrizio; Wilhelm, Dagmar; Browne, Catherine; Paavonen, Karri; Karnezis, Tara; Shayan, Ramin (19. října 2008). "Sox18 indukuje vývoj lymfatické vaskulatury u myší". Příroda. 456 (7222): 643–647. doi:10.1038 / nature07391. ISSN  0028-0836. PMID  18931657.
  16. ^ Irrthum, Alexandre; Devriendt, Koenraad; Chitayat, David; Matthijs, Gert; Glade, Conrad; Steijlen, Peter M .; Fryns, Jean-Pierre; Van Steensel, Maurice A. M .; Vikkula, Miikka (červen 2003). „Mutace v genu transkripčního faktoru SOX18 jsou základem recesivních a dominantních forem hypotrichózy-lymfedému-telangiektázie“. American Journal of Human Genetics. 72 (6): 1470–1478. doi:10.1086/375614. ISSN  0002-9297. PMC  1180307. PMID  12740761.
  17. ^ Overman, Jeroen; Fontaine, Frank; Moustaqil, Mehdi; Mittal, Deepak; Sierecki, Emma; Sacilotto, Natalia; Zuegg, Johannes; Robertson, Avril AB; Holmes, Kelly (31. ledna 2017). „Farmakologické cílení transkripčního faktoru SOX18 zpomaluje rakovinu prsu u myší“. eLife. 6. doi:10,7554 / elife.21221. ISSN  2050-084X. PMC  5283831. PMID  28137359.
  18. ^ Schepers, Goslik E .; Teasdale, Rohan D .; Koopman, Peter (srpen 2002). „Dvacet Soxových párů“. Vývojová buňka. 3 (2): 167–170. doi:10.1016 / s1534-5807 (02) 00223-x. ISSN  1534-5807. PMID  12194848.
  19. ^ Bowles, Josephine; Schepers, Goslik; Koopman, Peter (listopad 2000). "Fylogeneze rodiny SOX vývojových transkripčních faktorů na základě sekvence a strukturálních indikátorů". Vývojová biologie. 227 (2): 239–255. doi:10,1006 / dbio.2000.9883. ISSN  0012-1606. PMID  11071752.
  20. ^ Koopman P. (2016). „Zvědavý svět vývoje gonád u savců“. Aktuální témata ve vývojové biologii. 116: 537–545. doi:10.1016 / bs.ctdb.2015.12.009. ISBN  9780128029565. PMID  26970639.
  21. ^ Bowles, Josephine; Knight, Deon; Smith, Christopher; Wilhelm, Dagmar; Richman, Joy; Mamiya, Satoru; Yashiro, Kenta; Chawengsaksophak, Kallayanee; Wilson, Megan J. (28. dubna 2006). "Signalizace retinoidů určuje osud zárodečných buněk u myší". Věda. 312 (5773): 596–600. doi:10.1126 / science.1125691. ISSN  0036-8075. PMID  16574820.
  22. ^ Spiller, Cassy M .; Feng, Chun-Wei; Jackson, Andrew; Gillis, Ad J. M .; Rolland, Antoine D .; Looijenga, Leendert H. J .; Koopman, Peter; Bowles, Josephine (15. listopadu 2012). „Endogenní uzlová signalizace reguluje účinnost zárodečných buněk během vývoje varlat u savců“. Rozvoj. 139 (22): 4123–4132. doi:10,1242 / dev.083006. ISSN  0950-1991. PMID  23034635.
  23. ^ Spiller, Cassy M .; Bowles, Josephine; Koopman, Peter (2013). „Nodální / Cripto signalizace ve vývoji zárodečných buněk mužského plodu: důsledky pro nádory zárodečných buněk varlat“. International Journal of Developmental Biology. 57 (2–3–4): 211–219. doi:10.1387 / ijdb.130028pk. ISSN  0214-6282. PMID  23784832.
  24. ^ Lee, Peter A .; Nordenström, Anna; Houk, Christopher P .; Ahmed, S. Faisal; Auchus, Richard; Baratz, Arlene; Baratz Dalke, Katharine; Liao, Lih-Mei; Lin-Su, Karen (2016). „Global Disorders of Sex Development Update since 2006: Perceptions, Approach and Care“. Výzkum hormonů v pediatrii. 85 (3): 158–180. doi:10.1159/000442975. ISSN  1663-2818. PMID  26820577.
  25. ^ „Výbor - referenční skupina pro rovnost a rozmanitost | Australská akademie věd“. www.science.org.au. Citováno 10. října 2018.
  26. ^ „Pracovní výbor pro ženy ve zdravotnictví“. Národní rada pro zdraví a lékařský výzkum.
  27. ^ "Ženy ve vědě, technologii, inženýrství a matematice (STEM) dekadický plán | Australská akademie věd". www.science.org.au. Citováno 10. října 2018.
  28. ^ „Výzkumník UQ získal medaili za vynikající výsledky v genovém výzkumu“. Novinky UQ. Citováno 10. října 2018.
  29. ^ "Molekulární genetika sexuálního vývoje savců: Molekulární role SRY a SOX9 - vědci UQ". research.uq.edu.au. Citováno 10. října 2018.
  30. ^ „2002 Amersham Pharmacia Biotech Medalist: Professor Peter Koopman“. Australská společnost pro biochemii a molekulární biologii. Citováno 10. října 2018.
  31. ^ "Prezidentova medaile» ANZSCDB ". www.anzscdb.org. Citováno 10. října 2018.
  32. ^ „Jak Y chromozom dělá muže: Molekulárně genetická analýza klíčových genů určujících pohlaví - vědci UQ“. research.uq.edu.au. Citováno 10. října 2018.
  33. ^ „Členové absolventů | GSK Australia“. Citováno 10. října 2018.
  34. ^ „Profesor Peter Anthony Koopman | Australská akademie věd“. www.science.org.au. Citováno 10. října 2018.
  35. ^ „Peter Koopman - ASBMB“. ASBMB. Citováno 10. října 2018.
  36. ^ ORCID. „Peter Koopman (0000-0001-6939-0914) - ORCID | Propojení výzkumu a výzkumných pracovníků“. orcid.org. Citováno 10. října 2018.