Paraburkholderia xenovorans - Paraburkholderia xenovorans
Paraburkholderia xenovorans | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | P. xenovorans |
Binomické jméno | |
Paraburkholderia xenovorans (Goris et al. 2004) Sawana et al. 2015[1] | |
Synonyma | |
Burkholderia xenovorans Goris et al. 2004 |
Paraburkholderia xenovorans je druh Proteobakterie.
Genomika
Genom Paraburkholderia xenovorans (LB400) je jedním z největších bakteriálních genomů, které jsou doposud zcela sekvenovány. Nedávné genomické studie tohoto organismu pomohly rozšířit porozumění bakteriím katabolismus, nekatabolická fyziologická adaptace na organické sloučeniny a vývoj velkých bakterií genomy. The metabolické cesty z fylogeneticky rozmanitých izolátů jsou si velmi podobné z hlediska celkové organizace. Jak bylo původně uvedeno v pseudomonády, velké množství "periferních aromatických" cest trychtýřem řadu přírodních a xenobiotikum sloučeniny do omezeného počtu „centrálních aromatických“ drah. Tyto cesty jsou geneticky organizovány v módě specifické pro rod. Srovnávací genomické studie ukazují, že některé cesty jsou rozšířenější, než se původně myslelo. Funkční genomické studie prokázaly, že i organismy, které obsahují vysoký počet homologních enzymů, zřejmě obsahují několik příkladů skutečné redundance. Analýzy ukázaly, že nedávný genetický tok zřejmě hrál významnější roli ve vývoji některých velkých genomů, jako je Burkholderia xenovorans LB400, než v jiných. Objevuje se však trend, že velké genové repertoáry silných degradátorů znečišťujících látek, jako jsou B. xenovorans LB400 se vyvinuly hlavně starodávnějšími procesy. To, že to platí u takových fylogeneticky rozmanitých druhů, je pozoruhodné a dále naznačuje starodávný původ této katabolické kapacity. Aromatické sloučeniny patří k nejodpornějším organickým znečišťujícím látkám a je velký zájem o jejich používání mikrobiální biodegradace vyčistit kontaminovaná místa.[2]
Reference
- ^ Sawana A, Adeolu M, Gupta RS. (2014). „Molekulární podpisy a fylogenomická analýza rodu Burkholderia: Návrh na rozdělení tohoto rodu do emendovaného rodu Burkholderia obsahující patogenní organismy a nový rod Paraburkholderia gen. listopad. skrývající se v environmentálních druzích “. Přední. Genet. 5: 429. doi:10.3389 / fgene.2014.00429. PMC 4271702. PMID 25566316.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ McLeod MP a Eltis LD (2008). „Genomic Insights Into the Aerobic Pathways for Degradation of Organic Pollutants“. Mikrobiální biodegradace: Genomika a molekulární biologie. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-17-2.
Tento Betaproteobakterie související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |