PSPH - PSPH

PSPH
Protein PSPH PDB 1l8l.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPSPH, PSP, PSPHD, fosfoserin fosfatáza
Externí IDOMIM: 172480 MGI: 97788 HomoloGene: 31245 Genové karty: PSPH
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomické umístění pro PSPH
Genomické umístění pro PSPH
Kapela7p11.2Start56,011,051 bp[1]
Konec56,051,604 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PSPH 205048 s na fs.png

PBB GE PSPH 205194 na fs.png

PBB GE PSPH gnf1h09519 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004577

NM_133900

RefSeq (protein)

NP_598661

Místo (UCSC)Chr 7: 56,01 - 56,05 MbChr 5: 129,77 - 129,79 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Fosfoserin fosfatáza je enzym že u lidí je kódován PSPH gen.[5][6][7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem patří do podrodiny fosfotransferázy. Tento kódovaný enzym je zodpovědný za třetí a poslední krok při tvorbě L-serinu. Katalyzuje hydrolýzu L-fosfoserinu závislou na hořčíku a také se účastní výměnné reakce mezi L-serinem a L-fosfoserinem. Má se za to, že nedostatek tohoto proteinu souvisí s Williamsovým syndromem.[7]

Klinický význam

Homozygotní nebo složené heterozygotní mutace v PSPH způsobit Neu-Laxova syndrom[8] a nedostatek fosfoserin fosfatázy.[9][10]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce PSPH. Podmíněný knockout myš linka volala Psphtm1a (EUCOMM) Hmgu byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[12] k určení účinků vypuštění.[13][14][15][16] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[17]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146733 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029446 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Koch GA, Eddy RL, Haley LL, Byers MG, McAvoy M, Shows TB (duben 1983). „Přiřazení genu pro lidskou fosfoserinfosfatázu (PSP) pteru vede k oblasti q22 chromozomu 7“. Cytogenetika a genetika buněk. 35 (1): 67–9. doi:10.1159/000131839. PMID  6297854.
  6. ^ Collet JF, Gerin I, Rider MH, Veiga-da-Cunha M, Van Schaftingen E (květen 1997). "Human L-3-fosfoserin fosfatáza: sekvence, exprese a důkazy pro fosfoenzymový meziprodukt". FEBS Dopisy. 408 (3): 281–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00438-9. PMID  9188776. S2CID  6952728.
  7. ^ A b „Entrez Gene: PSPH fosfoserin fosfatáza“.
  8. ^ Acuna-Hidalgo R, Schanze D, Kariminejad A, Nordgren A, Kariminejad MH, Conner P, Grigelioniene G, Nilsson D, Nordenskjöld M, Wedell A, Freyer C, Wredenberg A, Wieczorek D, Gillessen-Kaesbach G, Kayserili H, Elcioglu N, Ghaderi-Sohi S, Goodarzi P, Setayesh H, van de Vorst M, Steehouwer M, Pfundt R, Krabichler B, Curry C, MacKenzie MG, Boycott KM, Gilissen C, Janecke AR, Hoischen A, Zenker M (září 2014 ). „Neu-Laxova syndrom je heterogenní metabolická porucha způsobená defekty v enzymech dráhy biosyntézy L-serinu“. American Journal of Human Genetics. 95 (3): 285–93. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.07.012. PMC  4157144. PMID  25152457.
  9. ^ Veiga-da-Cunha M, Collet JF, Prieur B, Jaeken J, Peeraer Y, Rabbijns A, Van Schaftingen E (únor 2004). „Mutace odpovědné za nedostatek 3-fosfoserin fosfatázy“. European Journal of Human Genetics. 12 (2): 163–6. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201083. PMID  14673469.
  10. ^ Jaeken J, Detheux M, Fryns JP, Collet JF, Alliet P, Van Schaftingen E (červenec 1997). "Nedostatek fosfoserin fosfatázy u pacienta s Williamsovým syndromem". Journal of Medical Genetics. 34 (7): 594–6. doi:10,1136 / jmg. 34,7,594. PMC  1051004. PMID  9222972.
  11. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
  13. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  17. ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P78330 (Fosfoserin fosfatáza) na PDBe-KB.