Laboratoř PSF - PSF Lab

Laboratoř PSF
PSF Lab ve Windows 7
PSF Lab ve Windows 7
VývojářiMichael J. Nasse, Jörg C. Woehl
Stabilní uvolnění
3.0 / 24. září 2010; před 10ti lety (2010-09-24)
Operační systémOkna, Operační Systém Mac
TypPočítačový simulační software
LicenceFreeware pro akademické a nekomerční použití
webová stránkaonemolekula.chem.uwm.edu/software

Laboratoř PSF je softwarový program, který umožňuje výpočet osvětlení funkce rozložení bodů (PSF) společnosti a konfokální mikroskop za různých zobrazovacích podmínek. Výpočet vektorů elektrického pole je založen na pečlivém vektorovém modelu, který trvá polarizace efekty v oblasti blízkého zaostření a vysoké numerická clona mikroskopické cíle v úvahu.[1]

Polarizace vstupního paprsku (předpokládá se kolimoval a jednobarevný ) lze zvolit libovolně (lineární, kruhové nebo eliptické). Dále konstantní nebo Gaussian Lze předpokládat tvar profilu intenzity vstupního paprsku. Na cestě z objektivní do soustředit se, osvětlovací světlo prochází až třemi stratifikovanými optickými vrstvami, což umožňuje simulaci ponorný olej / objektiv vzduchu (vrstva 1), který zaostřuje světlo skrz krycí sklíčko (vrstva 2) do vzorku (vrstva 3). Každá vrstva se vyznačuje svou (konstantní) index lomu a tloušťka. Laboratoř PSF může také simulovat mikroskopické cíle které jsou opraveny pro určité indexy lomu a tloušťky krycího skluzu (konstrukční parametry). Proto jsou řádně zohledněny jakékoli odchylky od ideálních zobrazovacích podmínek, pro které byl objekt navržen.

Lze zvolit následující optické parametry:[2]

  • Vstupní paprsek
    • Vlnová délka
    • Parametr plnění Gaussova profilu (0 = konstantní profil)
    • Polarizace (lineární, kruhová, eliptická)
  • Výstupy
    • Jednotlivé komponenty pole
    • Komponenty čtvercového pole
    • Intenzita
  • Objektiv mikroskopu
    • Numerická clona
  • Optická média
    • Index lomu (návrh a skutečný)
    • Tloušťka (návrh a skutečná)
    • Hloubka (poloha zaostření na médiu 3)

Program počítá pouze 2D část PSF, ale lze získat několik výpočtů (s programem třetí strany), aby se získal plný 3D PSF. Výpočty jsou uspořádány do „sad“, z nichž každá má vlastní sadu parametrů. Smyčky lze nastavit tak, že laboratoř PSF vypočítá jednu nebo několik sad, čímž se zvýší rozlišení vypočítaných obrázků v každé nové iteraci. Výsledný obrázek se zobrazí v laboratoři PSF v lineárním nebo logaritmický barevná škála s uživatelem volitelnou barevnou mapou a intenzitu, jednotlivé komponenty pole nebo distribuce komponent čtvercového pole lze exportovat do různých formátů (datové formáty: .mat, .h5 (HDF5), .txt (ASCII); formáty obrázků: .fig, .ai, .bmp, .emf, .eps, .jpg, .pcx, .pdf, .png, .tif).

Viz také

Reference

  1. ^ Nasse M. J., Woehl J. C. (2010). "Realistické modelování funkce šíření bodu osvětlení v konfokální skenovací optické mikroskopii". J. Opt. Soc. Dopoledne. A. 27 (2): 295–302. Bibcode:2010JOSAA..27..295N. doi:10.1364 / JOSAA.27.000295. PMID  20126241.
  2. ^ Příručka Začínáme s laboratoří PSF

externí odkazy