PRAME - PRAME

PRAME
Identifikátory
AliasyPRAME, CT130, MAPE, OIP-4, OIP4, přednostně exprimovaný antigen v melanomu, transkripční regulátor nukleárních receptorů PRAME
Externí IDOMIM: 606021 HomoloGene: 48404 Genové karty: PRAME
Umístění genu (člověk)
Chromozom 22 (lidský)
Chr.Chromozom 22 (lidský)[1]
Chromozom 22 (lidský)
Genomická poloha pro PRAME
Genomická poloha pro PRAME
Kapela22q11.22Start22,547,701 bp[1]
Konec22,559,361 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PRAME 204086 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

n / a

RefSeq (protein)

n / a

Místo (UCSC)Chr 22: 22,55 - 22,56 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2]n / a
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Antigen melanomu je přednostně exprimován v nádorech je protein že u lidí je kódován PRAME gen.[3][4][5] U tohoto genu bylo pozorováno pět alternativně sestřižených variant transkriptu kódujících stejný protein.[5]

Funkce

Tento gen kóduje antigen, který je převážně exprimován v člověku melanomy a to je rozpoznáno cytolytiky T lymfocyty. Není exprimován v normálních tkáních, kromě varlat. Tento expresní vzorec je podobný jako u jiných CT antigenů, jako je KOUZELNÍK, BAGE a GAGE. Avšak na rozdíl od těchto ostatních CT antigenů je tento gen také exprimován v akutní formě leukémie. Nadměrná exprese PRAME v nádorových tkáních a relativně nízké hladiny v normálních somatických tkáních z něj činí atraktivní cíl pro léčbu rakoviny. V posledních letech se imunoterapie postavila do čela nové éry léčby rakoviny, která vyústila ve vývoj mnoha nových antigenově specifických imunoterapeutických přístupů. Studie imunoterapie specifické pro PRAME zahrnují primárně vakcíny a buněčné imunoterapie.[6]

PRAME může bránit kyselina retinová signalizace a zprostředkována kyselina retinová diferenciace a apoptóza.[7] Bylo také zjištěno, že nadměrná exprese PRAME u trojnásobně negativního karcinomu prsu podporuje motilitu rakovinných buněk indukcí přechodu z epitelu na mezenchym. [8].

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce PRAME. Podmíněný knockout myš linka volala Prametm1a (KOMP) Wtsi byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[9] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[10] k určení účinků vypuštění.[11][12][13][14] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[15]

Reference

  1. ^ A b C ENSG00000275013 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185686, ENSG00000275013 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ Ikeda H, Lethé B, Lehmann F, van Baren N, Baurain JF, de Smet C, Chambost H, Vitale M, Moretta A, Boon T, Coulie PG (únor 1997). "Charakterizace antigenu, který je rozpoznáván na melanomu, vykazující částečnou ztrátu HLA CTL exprimujícím NK inhibiční receptor". Imunita. 6 (2): 199–208. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80426-4. PMID  9047241.
  4. ^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID  10591208.
  5. ^ A b „Entrez Gene: PRAME preferenčně exprimovaný antigen v melanomu“.
  6. ^ Al-Khadairi G, Decock J (červenec 2019). „Antigeny rakoviny varlat a imunoterapie: Kde stojíme v cílení PRAME?“. Rakoviny. 11 (7): 984. doi:10,3390 / rakoviny11070984. PMC  6678383. PMID  31311081.
  7. ^ Epping MT, Wang L, Edel MJ, Carlée L, Hernandez M, Bernards R (září 2005). „Lidský nádorový antigen PRAME je dominantním represorem signalizace receptoru kyseliny retinové“. Buňka. 122 (6): 835–47. doi:10.1016 / j.cell.2005.07.003. hdl:1874/17819. PMID  16179254. S2CID  18144920.
  8. ^ Al-Khadairi G, Naik A, Thomas R, Al-Sulaiti B, Rizly S, Decock J (leden 2019). „PRAME podporuje přechod epitelu na mezenchym u trojitě negativního karcinomu prsu“. Journal of Translational Medicine. 17 (1): 9. doi:10.1186 / s12967-018-1757-3. PMC  6317205. PMID  30602372.
  9. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
  11. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  12. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  13. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  14. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  15. ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.

Další čtení