PRAME - PRAME
Antigen melanomu je přednostně exprimován v nádorech je protein že u lidí je kódován PRAME gen.[3][4][5] U tohoto genu bylo pozorováno pět alternativně sestřižených variant transkriptu kódujících stejný protein.[5]
Funkce
Tento gen kóduje antigen, který je převážně exprimován v člověku melanomy a to je rozpoznáno cytolytiky T lymfocyty. Není exprimován v normálních tkáních, kromě varlat. Tento expresní vzorec je podobný jako u jiných CT antigenů, jako je KOUZELNÍK, BAGE a GAGE. Avšak na rozdíl od těchto ostatních CT antigenů je tento gen také exprimován v akutní formě leukémie. Nadměrná exprese PRAME v nádorových tkáních a relativně nízké hladiny v normálních somatických tkáních z něj činí atraktivní cíl pro léčbu rakoviny. V posledních letech se imunoterapie postavila do čela nové éry léčby rakoviny, která vyústila ve vývoj mnoha nových antigenově specifických imunoterapeutických přístupů. Studie imunoterapie specifické pro PRAME zahrnují primárně vakcíny a buněčné imunoterapie.[6]
PRAME může bránit kyselina retinová signalizace a zprostředkována kyselina retinová diferenciace a apoptóza.[7] Bylo také zjištěno, že nadměrná exprese PRAME u trojnásobně negativního karcinomu prsu podporuje motilitu rakovinných buněk indukcí přechodu z epitelu na mezenchym. [8].
Modelové organismy
Modelové organismy byly použity při studiu funkce PRAME. Podmíněný knockout myš linka volala Prametm1a (KOMP) Wtsi byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[9] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[10] k určení účinků vypuštění.[11][12][13][14] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[15]
| Charakteristický | Fenotyp |
|---|---|
| Veškerá data jsou k dispozici na.[10][15] | |
| Inzulín | Normální |
| Homozygotní životaschopnost na P14 | Normální |
| Homozygotní plodnost | Normální |
| Tělesná hmotnost | Normální |
| Neurologické hodnocení | Normální |
| Síla úchopu | Normální |
| Dysmorfologie | Normální |
| Nepřímá kalorimetrie | Normální |
| Zkouška tolerance glukózy | Normální |
| Sluchová odezva mozkového kmene | Normální |
| DEXA | Normální |
| Radiografie | Normální |
| Morfologie očí | Normální |
| Klinická chemie | Normální |
| Hematologie 16 týdnů | Normální |
| Leukocyty v periferní krvi 16 týdnů | Normální |
| Salmonella infekce | Normální |
| Imunofenotypizace sleziny | Normální |
| Imunofenotypizace mezenterických lymfatických uzlin | Normální |
| Epidermální imunitní složení | Abnormální |
Reference
- ^ A b C ENSG00000275013 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185686, ENSG00000275013 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ikeda H, Lethé B, Lehmann F, van Baren N, Baurain JF, de Smet C, Chambost H, Vitale M, Moretta A, Boon T, Coulie PG (únor 1997). "Charakterizace antigenu, který je rozpoznáván na melanomu, vykazující částečnou ztrátu HLA CTL exprimujícím NK inhibiční receptor". Imunita. 6 (2): 199–208. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80426-4. PMID 9047241.
- ^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- ^ A b „Entrez Gene: PRAME preferenčně exprimovaný antigen v melanomu“.
- ^ Al-Khadairi G, Decock J (červenec 2019). „Antigeny rakoviny varlat a imunoterapie: Kde stojíme v cílení PRAME?“. Rakoviny. 11 (7): 984. doi:10,3390 / rakoviny11070984. PMC 6678383. PMID 31311081.
- ^ Epping MT, Wang L, Edel MJ, Carlée L, Hernandez M, Bernards R (září 2005). „Lidský nádorový antigen PRAME je dominantním represorem signalizace receptoru kyseliny retinové“. Buňka. 122 (6): 835–47. doi:10.1016 / j.cell.2005.07.003. hdl:1874/17819. PMID 16179254. S2CID 18144920.
- ^ Al-Khadairi G, Naik A, Thomas R, Al-Sulaiti B, Rizly S, Decock J (leden 2019). „PRAME podporuje přechod epitelu na mezenchym u trojitě negativního karcinomu prsu“. Journal of Translational Medicine. 17 (1): 9. doi:10.1186 / s12967-018-1757-3. PMC 6317205. PMID 30602372.
- ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
- ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.
Další čtení
- Al-Khadairi G, Decock J (červenec 2019). „Antigeny rakoviny varlat a imunoterapie: Kde stojíme v cílení PRAME?“. Rakoviny. 11 (7): 984. doi:10,3390 / rakoviny11070984. PMC 6678383. PMID 31311081.
- Al-Khadairi G, Naik A, Thomas R, Al-Sulaiti B, Rizly S, Decock J (leden 2019). „PRAME podporuje přechod epitelu na mezenchym u trojitě negativního karcinomu prsu“. Journal of Translational Medicine. 17 (1): 9. doi:10.1186 / s12967-018-1757-3. PMC 6317205. PMID 30602372.
- Kirkin AF, Dzhandzhugazyan K, Zeuthen J (1998). "Imunogenní vlastnosti antigenů asociovaných s melanomem rozpoznávaných cytotoxickými T lymfocyty". Experimentální a klinická imunogenetika. 15 (1): 19–32. doi:10.1159/000019050. PMID 9619397. S2CID 25993773.
- Matsushita M, Yamazaki R, Ikeda H, Kawakami Y (březen 2003). "Přednostně exprimovaný antigen melanomu (PRAME) při vývoji diagnostických a terapeutických metod pro hematologické malignity". Leukémie a lymfom. 44 (3): 439–44. doi:10.1080/1042819021000035725. PMID 12688312. S2CID 29064098.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Williams JM, Chen GC, Zhu L, Rest RF (leden 1998). „Použití kvasinkového dvouhybridního systému k identifikaci proteinů lidských epiteliálních buněk, které vážou gonokokové proteiny Opa: intracelulární gonokoky váží pyruvátkinázu prostřednictvím svých proteinů Opa a pro růst vyžadují hostitelský pyruvát.“ Molekulární mikrobiologie. 27 (1): 171–86. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID 9466265.
- Neumann E, Engelsberg A, Decker J, Störkel S, Jaeger E, Huber C, Seliger B (září 1998). „Heterogenní exprese nádorově asociovaných antigenů RAGE-1, PRAME a glykoproteinu 75 v karcinomu lidských ledvinových buněk: kandidáti na imunoterapie založené na T-buňkách?“. Výzkum rakoviny. 58 (18): 4090–5. PMID 9751617.
- van Baren N, Chambost H, Ferrant A, Michaux L, Ikeda H, Millard I, Olive D, Boon T, Coulie PG (září 1998). „PRAME, gen kódující antigen rozpoznávaný na lidském melanomu cytolytickými T buňkami, je exprimován v buňkách akutní leukémie“. British Journal of Hematology. 102 (5): 1376–9. doi:10.1046 / j.1365-2141.1998.00982.x. PMID 9753074. S2CID 2896384.
- Watari K, Tojo A, Nagamura-Inoue T, Nagamura F, Takeshita A, Fukushima T, Motoji T, Tani K, Asano S (leden 2000). "Identifikace antigenu melanomu, PRAME, jako genu indukovatelného BCR / ABL". FEBS Dopisy. 466 (2–3): 367–71. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01112-1. PMID 10682862. S2CID 26778464.
- Pellat-Deceunynck C, Mellerin MP, Labarrière N, Jego G, Moreau-Aubry A, Harousseau JL, Jotereau F, Bataille R (březen 2000). „Geny zárodečné linie rakoviny MAGE-1, MAGE-3 a PRAME jsou běžně exprimovány buňkami lidského myelomu“. European Journal of Immunology. 30 (3): 803–9. doi:10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <803 :: AID-IMMU803> 3.0.CO; 2-P. PMID 10741395.
- Matsushita M, Ikeda H, Kizaki M, Okamoto S, Ogasawara M, Ikeda Y, Kawakami Y (březen 2001). "Kvantitativní monitorování genu PRAME pro detekci minimálního reziduálního onemocnění u leukémie". British Journal of Hematology. 112 (4): 916–26. doi:10.1046 / j.1365-2141.2001.02670.x. PMID 11298586. S2CID 22217905.
- Steinbach D, Hermann J, Viehmann S, Zintl F, Gruhn B (březen 2002). "Klinické důsledky exprese genu PRAME v dětské akutní myeloidní leukémii". Genetika a cytogenetika rakoviny. 133 (2): 118–23. doi:10.1016 / S0165-4608 (01) 00570-2. PMID 11943337.
- Steinbach D, Viehmann S, Zintl F, Gruhn B (říjen 2002). "Exprese genu PRAME v dětské akutní lymfoblastické leukémii". Genetika a cytogenetika rakoviny. 138 (1): 89–91. doi:10.1016 / S0165-4608 (02) 00582-4. PMID 12419593.
- Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
- Oberthuer A, Hero B, Spitz R, Berthold F, Fischer M (červenec 2004). „Antigen spojený s nádorem PRAME je všeobecně exprimován ve vysokém stádiu neuroblastomu a je spojen se špatným výsledkem“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (13): 4307–13. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0813. PMID 15240516.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.