PPP3R1 - PPP3R1

PPP3R1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1AUI, 1M63, 1MF8, 2P6B, 3LL8, 4F0Z, 4OR9, 4ORA, 4ORC, 4ORB
Identifikátory
Aliasy	PPP3R1, CALNB1, CNB, CNB1, regulační podjednotka proteinové fosfatázy 3, alfa
Externí ID	OMIM: 601302 MGI: 107172 HomoloGene: 68099 Genové karty: PPP3R1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	68,256,237 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	17,200,375 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba kovových iontů; • kalmodulinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita proteinu serin / threonin fosfatáza závislá na vápníku; • vazba cyklosporinu A.; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • vazba fosfatázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • buněčná membrána; • nukleoplazma; • sarcolemma; • komplex kalcineurin; • mitochondrie;
Biologický proces	• Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • defosforylace bílkovin; • Signální dráha Wnt, dráha modulující vápník; • větvení účastnící se morfogeneze krevních cév; • přechod mezi epitelem a mezenchymem; • vývoj srdce; • Vývoj Schwannových buněk; • myelinizace v periferním nervovém systému; • kalcineurin-NFAT signalizační kaskáda; • lokalizace proteinu do jádra; • diferenciace buněk plicního epitelu; • import bílkovin do jádra; • pozitivní regulace inzerce proteinu do mitochondriální membrány zapojené do apoptotické signální dráhy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5534
	19058
	ENSG00000221823
	ENSMUSG00000033953
	P63098
	Q63810
	NM_000945
	NM_024459
	NP_000936
	NP_077779
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kalcineurinová podjednotka typu B 1 také známý jako regulační podjednotka proteinové fosfatázy 2B 1 je protein že u lidí je kódován PPP3R1 gen.^[5]^[6]^[7]

Klinický význam

Přítomnost a polymorfismus jednoho nukleotidu rs1868402 v PPP3R1 Gen silně koreluje s rychlým vývojem Alzheimerova choroba.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000221823 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033953 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wang MG, Yi H, Guerini D, Klee CB, McBride OW (leden 1997). „Kalcineurin A alfa (PPP3CA), kalcineurin A beta (PPP3CB) a kalcineurin B (PPP3R1) jsou lokalizovány na lidských chromozomech 4, 10q21 → q22 a 2p16 → p15“. Cytogenet Cell Genet. 72 (2–3): 236–41. doi:10.1159/000134198. PMID 8978785.
^ Guerini D, Krinks MH, Sikela JM, Hahn WE, Klee CB (březen 1990). „Izolace a sekvence klonu cDNA pro lidský kalcineurin B, podjednotku vázající se na Ca2 + proteinové fosfatázy stimulované Ca2 + / kalmodulinem“. DNA. 8 (9): 675–82. doi:10.1089 / dna.1.1989.8.675. PMID 2558868.
^ "Entrez Gene: PPP3R1 protein fosfatáza 3 (dříve 2B), regulační podjednotka B, alfa izoforma".
^ Cruchaga C, Kauwe JS, Mayo K, Spiegel N, Bertelsen S a kol. (2010). Myers AJ (ed.). „SNP spojené s hladinami fosfo-tau v mozkomíšním moku ovlivňují míru poklesu u Alzheimerovy choroby“. PLOS Genet. 6 (9): e1001101. doi:10.1371 / journal.pgen.1001101. PMC 2940763. PMID 20862329.

Další čtení

Kawamura A, Su MS (1995). "Interakce FKBP12-FK506 s kalcineurinem A v doméně vázající podjednotku B". J. Biol. Chem. 270 (26): 15463–6. doi:10.1074 / jbc.270.26.15463. PMID 7541044.
Kissinger CR, Parge HE, Knighton DR a kol. (1996). "Krystalové struktury lidského kalcineurinu a lidského komplexu FKBP12-FK506-kalcineurin". Příroda. 378 (6557): 641–4. doi:10.1038 / 378641a0. PMID 8524402. S2CID 4337105.
Feng B, Stemmer PM (1999). "Interakce kalcineurinu A, kalcineurinu B a Ca2 +". Biochemie. 38 (38): 12481–9. doi:10.1021 / bi990492w. PMID 10493818.
Stratakis CA, Taymans SE (1999). "Struktura genu kódujícího kalcineurin B (PPP3R1) a mapování na D2S358-D2S1778 (chromozomální oblast 2p15)". DNA sekv. 9 (4): 227–30. doi:10.3109/10425179809105209. PMID 10520753.
Nishio H, Matsui K, Tsuji H a kol. (2000). „Imunolokalizace kalcineurinu a FKBP12, proteinu vázajícího se na FK506, v Hassallových krvinkách lidského brzlíku a epidermis“. Histochem. Cell Biol. 114 (1): 9–14. doi:10,1007 / s004180000168. PMID 10959817. S2CID 21530150.
Sokal I, Li N, Verlinde CL a kol. (2001). "Ca (2 +) - vazebné proteiny v sítnici: od objevu po etiologii onemocnění člověka (1)". Biochim. Biophys. Acta. 1498 (2–3): 233–51. doi:10.1016 / S0167-4889 (00) 00099-9. PMID 11108966.
Graef IA, Chen F, Chen L a kol. (2001). "Signály transdukované Ca (2 +) / kalcineurinem a NFATc3 / c4 charakterizují vyvíjející se vaskulaturu". Buňka. 105 (7): 863–75. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00396-8. PMID 11439183. S2CID 5278706.
Al-Daraji WI, Grant KR, Ryan K a kol. (2002). „Lokalizace kalcineurinu / NFAT v lidské kůži a psoriáze a inhibice aktivace kalcineurinu / NFAT v lidských keratinocytech cyklosporinem A.“. J. Invest. Dermatol. 118 (5): 779–88. doi:10.1046 / j.1523-1747.2002.01709.x. PMID 11982754.
Huai Q, Kim HY, Liu Y a kol. (2002). „Krystalová struktura kalcineurin-cyklofilin-cyklosporin ukazuje běžné, ale odlišné rozpoznávání komplexů imunofilin-lék“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (19): 12037–42. doi:10.1073 / pnas.192206699. PMC 129394. PMID 12218175.
Jin L, Harrison SC (2002). "Krystalová struktura lidského kalcineurinu v komplexu s cyklosporinem A a lidským cyklofilinem". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (21): 13522–6. doi:10.1073 / pnas.212504399. PMC 129706. PMID 12357034.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Bennasser Y, Badou A, Tkaczuk J, Bahraoui E (2003). "Signální dráhy spouštěné HIV-1 Tat v lidských monocytech k indukci TNF-alfa". Virologie. 303 (1): 174–80. doi:10.1006 / viro.2002.1676. PMID 12482669.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Bittinger MA, McWhinnie E, Meltzer J a kol. (2005). "Aktivace genové exprese zprostředkované odezvou cAMP regulovaným jaderným transportem proteinů TORC". Curr. Biol. 14 (23): 2156–61. doi:10.1016 / j.cub.2004.11.002. PMID 15589160. S2CID 5934014.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Winslow MM, Gallo EM, Neilson JR, Crabtree GR (2006). „Komplex kalcineurin-fosfatázy moduluje reakce imunogenních B buněk“. Imunita. 24 (2): 141–52. doi:10.1016 / j.immuni.2005.12.013. PMID 16473827.
Liu Q, Wilkins BJ, Lee YJ a kol. (2006). "Přímá interakce a vzájemná regulace mezi ASK1 a kalcineurin-NFAT kontrolují smrt a růst kardiomyocytů". Mol. Buňka. Biol. 26 (10): 3785–97. doi:10.1128 / MCB.26.10.3785-3797.2006. PMC 1489013. PMID 16648474.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000221823 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033953 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8978785-5] Wang MG, Yi H, Guerini D, Klee CB, McBride OW (leden 1997). „Kalcineurin A alfa (PPP3CA), kalcineurin A beta (PPP3CB) a kalcineurin B (PPP3R1) jsou lokalizovány na lidských chromozomech 4, 10q21 → q22 a 2p16 → p15“. Cytogenet Cell Genet. 72 (2–3): 236–41. doi:10.1159/000134198. PMID 8978785.

[pmid2558868-6] Guerini D, Krinks MH, Sikela JM, Hahn WE, Klee CB (březen 1990). „Izolace a sekvence klonu cDNA pro lidský kalcineurin B, podjednotku vázající se na Ca2 + proteinové fosfatázy stimulované Ca2 + / kalmodulinem“. DNA. 8 (9): 675–82. doi:10.1089 / dna.1.1989.8.675. PMID 2558868.

[entrez-7] "Entrez Gene: PPP3R1 protein fosfatáza 3 (dříve 2B), regulační podjednotka B, alfa izoforma".

[Cruchaga_2010-8] Cruchaga C, Kauwe JS, Mayo K, Spiegel N, Bertelsen S a kol. (2010). Myers AJ (ed.). „SNP spojené s hladinami fosfo-tau v mozkomíšním moku ovlivňují míru poklesu u Alzheimerovy choroby“. PLOS Genet. 6 (9): e1001101. doi:10.1371 / journal.pgen.1001101. PMC 2940763. PMID 20862329.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]