PPM1B - PPM1B

PPM1B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2P8E
Identifikátory
Aliasy	PPM1B, PP2C-beta, PP2C-beta-X, PP2CB, PP2CBETA, PPC2BETAX, proteinová fosfatáza, závislá na Mg2 + / Mn2 + 1B
Externí ID	OMIM: 603770 MGI: 101841 HomoloGene: 2027 Genové karty: PPM1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	44,244,384 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	85,023,991 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba iontů hořčíku; • vazba manganových iontů; • aktivita protein serin / threonin fosfatáza; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • katalytická aktivita; • kationtová vazba; • aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • aktivita serin / threonin fosfatázy závislá na hořčíku;
Buněčná složka	• membrána; • cytoplazma; • jádro; • cytosol; • buněčné jádro;
Biologický proces	• defosforylace bílkovin; • negativní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • negativní regulace obranné reakce na virus; • N-koncová myristoylace proteinu; • defosforylace peptidyl-threoninu; • negativní regulace produkce interferonu-beta; • negativní regulace signalizace NIK / NF-kappaB;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5495
	19043
	ENSG00000138032
	ENSMUSG00000061130
	O75688
	P36993
	NM_001033556; NM_001033557; NM_002706; NM_177968; NM_177969
	NM_001159496; NM_001159497; NM_001159498; NM_011151
	NP_001028729; NP_002697; NP_808907; NP_808908
	NP_001152968; NP_001152969; NP_001152970; NP_035281
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein fosfatáza 1B je enzym že u lidí je kódován PPM1B gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny PP2C Ser / Thr proteinu fosfatázy. Je známo, že členové rodiny PP2C jsou negativními regulátory drah reakce buněčného stresu. Ukázalo se, že tato fosfatáza defosforyluje cyklin-dependentní kinázy (CDK), a proto mohou být zapojeni do buněčný cyklus řízení. Je známo, že nadměrná exprese této fosfatázy způsobuje zastavení buněčného růstu nebo smrt buňky. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy. Byly popsány další varianty transkriptu, ale v současné době nepředstavují sekvence plné délky.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PPM1B komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138032 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061130 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marley AE, Kline A, Crabtree G, Sullivan JE, Beri RK (srpen 1998). "Klonovací exprese a tkáňová distribuce lidského PP2Cbeta". FEBS Lett. 431 (1): 121–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00708-X. PMID 9684878. S2CID 84075989.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PPM1B protein fosfatáza 1B (dříve 2C), závislá na hořčíku, beta izoforma“.
^ ^A ^b Cheng A, Kaldis P, Solomon MJ (listopad 2000). „Defosforylace lidských cyklin-dependentních kináz proteinovými fosfatázami typu 2C alfa a beta 2 izoformy“. J. Biol. Chem. 275 (44): 34744–9. doi:10,1074 / jbc.M006210200. PMID 10934208.
^ ^A ^b ^C Prajapati S, Verma U, Yamamoto Y, Kwak YT, Gaynor RB (leden 2004). „Asociace proteinfosfatázy 2Cbeta s komplexem kinázy IkappaB se podílí na regulaci aktivity NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1739–46. doi:10,1074 / jbc.M306273200. PMID 14585847.
^ Hanada M, Ninomiya-Tsuji J, Komaki K, Ohnishi M, Katsura K, Kanamaru R, Matsumoto K, Tamura S (únor 2001). „Regulace signální dráhy TAK1 proteinovou fosfatázou 2C“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5753–9. doi:10,1074 / jbc.M007773200. PMID 11104763.
^ Tasdelen I, van Beekum O, Gorbenko O, Fleskens V, van den Broek NJ, Koppen A, Hamers N, Berger R, Coffer PJ, Brenkman AB, Kalkhoven E (2013). "Serin / threonin fosfatáza PPM1B (PP2Cp) selektivně moduluje aktivitu PPARy". Biochem. J. 451 (1): 45–53. doi:10.1042 / BJ20121113. PMID 23320500.

Další čtení

Hishiya A, Ohnishi M, Tamura S, Nakamura F (1999). „Protein fosfatáza 2C inaktivuje vazbu F-aktinu na lidský destičkový moesin“. J. Biol. Chem. 274 (38): 26705–12. doi:10.1074 / jbc.274.38.26705. PMID 10480873.
Cheng A, Ross KE, Kaldis P, Solomon MJ (2000). „Defosforylace cyklin-dependentních kináz proteinovými fosfatázami typu 2C“. Genes Dev. 13 (22): 2946–57. doi:10,1101 / gad.13.22.2946. PMC 317162. PMID 10580002.
Cheng A, Kaldis P, Solomon MJ (2000). „Defosforylace lidských cyklin-dependentních kináz proteinovými fosfatázami typu 2C alfa a beta 2 izoformy“. J. Biol. Chem. 275 (44): 34744–9. doi:10,1074 / jbc.M006210200. PMID 10934208.
Hanada M, Ninomiya-Tsuji J, Komaki K, Ohnishi M, Katsura K, Kanamaru R, Matsumoto K, Tamura S (2001). „Regulace signální dráhy TAK1 proteinovou fosfatázou 2C“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5753–9. doi:10,1074 / jbc.M007773200. PMID 11104763.
Parvari R, Brodyansky I, Elpeleg O, Moses S, Landau D, Hershkovitz E (2001). „Recesivní souvislá genová delece chromozomu 2p16 spojená s cystinurií a mitochondriálním onemocněním“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 69 (4): 869–75. doi:10.1086/323624. PMC 1226072. PMID 11524703.
Seroussi E, Shani N, Ben-Meir D, Chajut A, Divinski I, Faier S, Gery S, Karby S, Kariv-Inbal Z, Sella O, Smorodinsky NI, Lavi S (2001). „Jedinečně konzervované nepřekládané oblasti se podílejí na tvorbě dvou hlavních transkriptů proteinové fosfatázy 2Cbeta.“ J. Mol. Biol. 312 (3): 439–51. doi:10.1006 / jmbi.2001.4967. PMID 11563908.
Prajapati S, Verma U, Yamamoto Y, Kwak YT, Gaynor RB (2004). „Asociace proteinfosfatázy 2Cbeta s komplexem kinázy IkappaB se podílí na regulaci aktivity NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1739–46. doi:10,1074 / jbc.M306273200. PMID 14585847.
Parvari R, Gonen Y, Alshafee I, Buriakovsky S, Regev K, Hershkovitz E (2005). "Syndrom 2p21 delece: charakterizace obsahu transkripce". Genomika. 86 (2): 195–211. doi:10.1016 / j.ygeno.2005.04.001. PMID 15913950.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138032 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061130 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9684878-5] Marley AE, Kline A, Crabtree G, Sullivan JE, Beri RK (srpen 1998). "Klonovací exprese a tkáňová distribuce lidského PP2Cbeta". FEBS Lett. 431 (1): 121–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00708-X. PMID 9684878. S2CID 84075989.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PPM1B protein fosfatáza 1B (dříve 2C), závislá na hořčíku, beta izoforma“.

[pmid10934208-7] A ^b Cheng A, Kaldis P, Solomon MJ (listopad 2000). „Defosforylace lidských cyklin-dependentních kináz proteinovými fosfatázami typu 2C alfa a beta 2 izoformy“. J. Biol. Chem. 275 (44): 34744–9. doi:10,1074 / jbc.M006210200. PMID 10934208.

[pmid14585847-8] A ^b ^C Prajapati S, Verma U, Yamamoto Y, Kwak YT, Gaynor RB (leden 2004). „Asociace proteinfosfatázy 2Cbeta s komplexem kinázy IkappaB se podílí na regulaci aktivity NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1739–46. doi:10,1074 / jbc.M306273200. PMID 14585847.

[pmid11104763-9] Hanada M, Ninomiya-Tsuji J, Komaki K, Ohnishi M, Katsura K, Kanamaru R, Matsumoto K, Tamura S (únor 2001). „Regulace signální dráhy TAK1 proteinovou fosfatázou 2C“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5753–9. doi:10,1074 / jbc.M007773200. PMID 11104763.

[pmid23320500-10] Tasdelen I, van Beekum O, Gorbenko O, Fleskens V, van den Broek NJ, Koppen A, Hamers N, Berger R, Coffer PJ, Brenkman AB, Kalkhoven E (2013). "Serin / threonin fosfatáza PPM1B (PP2Cp) selektivně moduluje aktivitu PPARy". Biochem. J. 451 (1): 45–53. doi:10.1042 / BJ20121113. PMID 23320500.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]