POLDIP3 - POLDIP3

POLDIP3
Identifikátory
Aliasy	POLDIP3, PDIP46, SKAR, protein 3 delta interagující s polymerázou (DNA), protein 3 delta interagující s DNA polymerázou, PDIP3
Externí ID	OMIM: 611520 MGI: 1921076 HomoloGene: 13007 Genové karty: POLDIP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	42,614,962 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	83,149,384 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• komplex spojení exon-exon; • transkripční exportní komplex; • buněčné jádro; • jaderná skvrna; • cytoplazma; • cytosol; • nukleoplazma; • cytoplazmatická ribonukleoproteinová granule;
Biologický proces	• export poly (A) + mRNA z jádra; • transport mRNA; • regulace překladu; • pozitivní regulace překladu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA 3'-end; • Export RNA z jádra; • export mRNA z jádra; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84271
	73826
	ENSG00000100227
	ENSMUSG00000041815
	Q9BY77; Q8WUT1
	Q8BG81
	NM_001278657; NM_032311; NM_178136; NM_001363052
	NM_178627; NM_001347082
	NP_001265586; NP_115687; NP_835237; NP_001349981
	NP_001334011; NP_848742
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein interagující s polymerázou delta 3 je enzym že u lidí je kódován POLDIP3 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje protein, který interaguje s podjednotkou p50 DNA polymerázy. Tento protein je specifickým cílem S6 kinázy 1 a reguluje buněčný růst. Byly identifikovány dvě varianty transkriptu, které kódují různé izoformy proteinu.^[6]

Interakce

POLDIP3 bylo prokázáno komunikovat s Kináza P70-S6 1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100227 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041815 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Liu L, Rodriguez-Belmonte EM, Mazloum N, Xie B, Lee MY (březen 2003). „Identifikace nového proteinu, PDIP38, který interaguje s podjednotkou p50 delta DNA polymerázy a proliferujícím buněčným jaderným antigenem“. J Biol Chem. 278 (12): 10041–7. doi:10,1074 / jbc.M208694200. PMID 12522211.
^ ^A ^b "Entrez Gene: POLDIP3 polymeráza (řízená DNA), delta interagující protein 3".
^ Richardson, Celeste J; Bröenstrup Mark; Fingar Diane C; Jülich Kristina; Ballif Bryan A; Gygi Steven; Blenis John (září 2004). „SKAR je specifickým cílem S6 kinázy 1 při kontrole buněčného růstu“. Curr. Biol. Anglie. 14 (17): 1540–9. doi:10.1016 / j.cub.2004.08.061. ISSN 0960-9822. PMID 15341740.

Další čtení

Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Hirosawa M, Nagase T, Murahashi Y a kol. (2001). "Identifikace nových transkribovaných sekvencí na lidském chromozomu 22 mapováním exprimované sekvenční značky". DNA Res. 8 (1): 1–9. CiteSeerX 10.1.1.321.2497. doi:10.1093 / dnares / 8.1.1. PMID 11258795.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Collins JE, Goward ME, Cole CG a kol. (2003). „Přehodnocení anotace lidského genu: analýza druhé generace chromozomu 22“. Genome Res. 13 (1): 27–36. doi:10,1101 / gr. 695703. PMC 430954. PMID 12529303.
Richardson CJ, Bröenstrup M, Fingar DC a kol. (2005). „SKAR je specifickým cílem S6 kinázy 1 při kontrole buněčného růstu“. Curr. Biol. 14 (17): 1540–9. doi:10.1016 / j.cub.2004.08.061. PMID 15341740.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Smyk A, Szuminska M, Uniewicz KA a kol. (2006). „Lidský enhancer rudimentárního je molekulárním partnerem PDIP46 / SKAR, proteinu interagujícího s delta DNA polymerázy a S6K1 a regulujícího růst buněk.“ FEBS J. 273 (20): 4728–41. doi:10.1111 / j.1742-4658.2006.05477.x. PMID 16984396.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100227 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041815 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12522211-5] Liu L, Rodriguez-Belmonte EM, Mazloum N, Xie B, Lee MY (březen 2003). „Identifikace nového proteinu, PDIP38, který interaguje s podjednotkou p50 delta DNA polymerázy a proliferujícím buněčným jaderným antigenem“. J Biol Chem. 278 (12): 10041–7. doi:10,1074 / jbc.M208694200. PMID 12522211.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: POLDIP3 polymeráza (řízená DNA), delta interagující protein 3".

[pmid15341740-7] Richardson, Celeste J; Bröenstrup Mark; Fingar Diane C; Jülich Kristina; Ballif Bryan A; Gygi Steven; Blenis John (září 2004). „SKAR je specifickým cílem S6 kinázy 1 při kontrole buněčného růstu“. Curr. Biol. Anglie. 14 (17): 1540–9. doi:10.1016 / j.cub.2004.08.061. ISSN 0960-9822. PMID 15341740.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]