PRASATO - PIGT

PRASATO
Identifikátory
Aliasy	PRASATO, MCAHS3, NDAP, PNH2, CGI-06, biosyntéza kotvy fosfatidylinositol glykanu třída T
Externí ID	OMIM: 610272 MGI: 1926178 HomoloGene: 6134 Genové karty: PRASATO
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	45,456,934 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	164,508,301 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GPI-kotevní transamidázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Komplex GPI-kotva transamidázy; • membrána endoplazmatického retikula; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • membrána; • endoplazmatické retikulum; • cytoplazma; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• připojení kotvy GPI k proteinu; • neuronová diferenciace; • Proces biosyntézy kotvy GPI; • neuronový apoptotický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51604
	78928
	ENSG00000124155
	ENSMUSG00000017721
	Q969N2
	Q8BXQ2
	NM_001184728; NM_001184729; NM_001184730; NM_015937
	NM_133779; NM_001362644; NM_001362645; NM_001378795
	NP_001171657; NP_001171658; NP_001171659; NP_057021
	NP_598540; NP_001349573; NP_001349574; NP_001365724
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

GPI transamidázová složka PIG-T je enzym že u lidí je kódován PRASATO gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje a protein který je zapojen do glykosylfosfatidylinositol (GPI) - biosyntéza ukotvení. Kotva GPI je glykolipid nacházející se v mnoha krevních buňkách a slouží k ukotvení proteinů na buněčný povrch. Tento protein je podstatnou složkou multisubunitního enzymu, GPI transamidáza. GPI transamidáza zprostředkovává ukotvení GPI v endoplazmatické retikulum katalyzováním přenosu plně sestavených jednotek GPI na proteiny.^[6]

Interakce

PIGT bylo prokázáno komunikovat s PRASATKO^[8] a GPAA1.^[7]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124155 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017721 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vainauskas S, Menon AK (duben 2005). "Lokalizace endoplazmatického retikula Gaa1 a PIG-T, podjednotek komplexu glykosylfosfatidylinositol transamidázy". J Biol Chem. 280 (16): 16402–9. doi:10,1074 / jbc.M414253200. PMID 15713669.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PIGT fosfatidylinositol glykánová kotevní biosyntéza, třída T“.
^ ^A ^b Ohishi K, Inoue N, Kinoshita T (srpen 2001). „PIG-S a PIG-T, nezbytné pro připojení kotvy GPI k proteinům, tvoří komplex s GAA1 a GPI8“. EMBO J.. 20 (15): 4088–98. doi:10.1093 / emboj / 20.15.4088. PMC 149153. PMID 11483512.
^ Ohishi, Kazuhito; Nagamune Kisaburo; Maeda Yusuke; Kinoshita Taroh (duben 2003). „Dvě podjednotky glykosylfosfatidylinositol transamidázy, GPI8 a PIG-T, tvoří funkčně důležitý mezimolekulární disulfidový můstek“. J. Biol. Chem. 278 (16): 13959–67. doi:10,1074 / jbc.M300586200. ISSN 0021-9258. PMID 12582175.
^ Vainauskas, Saulius; Maeda Yusuke; Kurniawan Henry; Kinoshita Taroh; Menon Anant K (srpen 2002). „Strukturální požadavky pro nábor Gaa1 do funkčního komplexu glykosylfosfatidylinositol transamidázy“. J. Biol. Chem. 277 (34): 30535–42. doi:10,1074 / jbc.M205402200. ISSN 0021-9258. PMID 12052837.

Další čtení

Eisenhaber B, Maurer-Stroh S, Novatchkova M a kol. (2003). „Enzymy a pomocné faktory pro biosyntézu lipidových kotev GPI a posttranslační přenos na proteiny“. BioEssays. 25 (4): 367–85. doi:10.1002 / bies.10254. PMID 12655644.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Ohishi K, Inoue N, Kinoshita T (2001). „PIG-S a PIG-T, nezbytné pro připojení kotvy GPI k proteinům, tvoří komplex s GAA1 a GPI8“. EMBO J.. 20 (15): 4088–98. doi:10.1093 / emboj / 20.15.4088. PMC 149153. PMID 11483512.
Yu Y, Zhang C, Zhou G a kol. (2001). „Profilování genové exprese v játrech lidského plodu a identifikace genů specifických pro tkáň a vývojovou fázi prostřednictvím kompilovaných profilů exprese a účinného klonování cDNA plné délky“. Genome Res. 11 (8): 1392–403. doi:10,1101 / gr.175501. PMC 311073. PMID 11483580.
Fossey SC, Mychaleckyj JC, Pendleton JK a kol. (2001). „Mapa transkriptu s vysokým rozlišením 6,0 megabáze oblasti citlivosti na diabetes typu 2 na lidském chromozomu 20“. Genomika. 76 (1–3): 45–57. doi:10.1006 / geno.2001.6584. PMID 11549316.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001 Natur.414..865D. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Vainauskas S, Maeda Y, Kurniawan H a kol. (2002). „Strukturální požadavky pro nábor Gaa1 do funkčního komplexu glykosylfosfatidylinositol transamidázy“. J. Biol. Chem. 277 (34): 30535–42. doi:10,1074 / jbc.M205402200. PMID 12052837.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ohishi K, Nagamune K, Maeda Y, Kinoshita T (2003). „Dvě podjednotky glykosylfosfatidylinositol transamidázy, GPI8 a PIG-T, tvoří funkčně důležitý mezimolekulární disulfidový můstek“. J. Biol. Chem. 278 (16): 13959–67. doi:10,1074 / jbc.M300586200. PMID 12582175.
Hong Y, Ohishi K, Kang JY a kol. (2004). „Lidský PIG-U a kvasinky Cdc91p jsou pátou podjednotkou GPI transamidázy, která připojuje GPI kotvy k proteinům“. Mol. Biol. Buňka. 14 (5): 1780–9. doi:10,1091 / mbc.E02-12-0794. PMC 165076. PMID 12802054.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Li HL, Li Z, Qin LY a kol. (2006). „Nový protein vázaný na neurotrofiny regulovaný vývoj neuronů, NDAP, zprostředkovává apoptózu“. FEBS Lett. 580 (7): 1723–8. doi:10.1016 / j.febslet.2006.02.022. PMID 16516892. S2CID 1016691.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124155 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017721 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15713669-5] Vainauskas S, Menon AK (duben 2005). "Lokalizace endoplazmatického retikula Gaa1 a PIG-T, podjednotek komplexu glykosylfosfatidylinositol transamidázy". J Biol Chem. 280 (16): 16402–9. doi:10,1074 / jbc.M414253200. PMID 15713669.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PIGT fosfatidylinositol glykánová kotevní biosyntéza, třída T“.

[pmid11483512-7] A ^b Ohishi K, Inoue N, Kinoshita T (srpen 2001). „PIG-S a PIG-T, nezbytné pro připojení kotvy GPI k proteinům, tvoří komplex s GAA1 a GPI8“. EMBO J.. 20 (15): 4088–98. doi:10.1093 / emboj / 20.15.4088. PMC 149153. PMID 11483512.

[pmid12582175-8] Ohishi, Kazuhito; Nagamune Kisaburo; Maeda Yusuke; Kinoshita Taroh (duben 2003). „Dvě podjednotky glykosylfosfatidylinositol transamidázy, GPI8 a PIG-T, tvoří funkčně důležitý mezimolekulární disulfidový můstek“. J. Biol. Chem. 278 (16): 13959–67. doi:10,1074 / jbc.M300586200. ISSN 0021-9258. PMID 12582175.

[pmid12052837-9] Vainauskas, Saulius; Maeda Yusuke; Kurniawan Henry; Kinoshita Taroh; Menon Anant K (srpen 2002). „Strukturální požadavky pro nábor Gaa1 do funkčního komplexu glykosylfosfatidylinositol transamidázy“. J. Biol. Chem. 277 (34): 30535–42. doi:10,1074 / jbc.M205402200. ISSN 0021-9258. PMID 12052837.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]