PICK1 - PICK1

PICK1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2GZV
Identifikátory
Aliasy	PICK1, PICK, PRKCABP, protein interagující s PRKCA 1
Externí ID	OMIM: 605926 MGI: 894645 HomoloGene: 7470 Genové karty: PICK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	38,075,701 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	79,249,484 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • Vazba komplexu Arp2 / 3; • vazba kovových iontů; • vazba aktinového vlákna; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • vazba enzymu; • aktinová vazba; • vazba na receptory; • Vazba na receptor spojený s G-proteinem; • vazba protein kinázy C.; • vazba fosfolipidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána endocytických váčků; • postsynaptická membrána; • Golgiho aparát; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • membrána; • buněčná membrána; • synapse; • buněčné spojení; • perinukleární oblast cytoplazmy; • neuronová projekce; • cytoskelet; • presynaptická membrána; • mitochondrie; • cytosol; • agresivní; • synaptický váček; • trans-Golgiho síťová membrána; • postsynaptický časný endosom;
Biologický proces	• buněčná odpověď na hladovění glukózy; • vývoj gliových buněk; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • pozitivní regulace internalizace receptoru; • shlukování neuronových iontových kanálů; • regulace nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • transport monoaminů; • shlukování receptorů; • Methylace DNA zapojená do tvorby gamet; • negativní regulace nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • dendritická organizace páteře; • údržba dendritické páteře; • fosforylace bílkovin; • signální dráha receptoru spřaženého s proteinovou kinázou C-aktivujícího G-protein; • dlouhodobá synaptická deprese; • buněčná odpověď na sníženou hladinu kyslíku; • Methylace DNA zapojená do vývoje embrya; • transport intracelulárních proteinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9463
	18693
	ENSG00000100151
	ENSMUSG00000068206
	Q9NRD5
	Q62083
	NM_001039583; NM_001039584; NM_012407
	NM_001045558; NM_008837
NP_001034672; NP_001034673; NP_036539; NP_001034672.1; NP_001034673.1;
	NP_036539.1
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interakce bílkovin s C kinázou - 1 je protein že u lidí je kódován PICK1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem obsahuje doménu PDZ, prostřednictvím které interaguje s proteinkinázou C, alfa (PRKCA ). Tento protein může fungovat jako adaptér, který se váže na a organizuje subcelulární lokalizaci různých membránových proteinů. Bylo prokázáno, že interaguje s více podtypy receptorů glutamátu, monoaminovými plazmovými membránovými transportéry, stejně jako beznapěťovými sodíkovými kanály, a může cílit PRKCA na tyto membránové proteiny, a tak regulovat jejich distribuci a funkci. Bylo také zjištěno, že tento protein působí jako kotvící protein, který specificky cílí PRKCA na mitochondrie způsobem specifickým pro ligand. Pro tento gen byly nalezeny tři varianty transkriptu kódující stejný protein.^[7]

Interakce

PICK1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100151 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068206 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dev KK, Nishimune A, Henley JM, Nakanishi S (červenec 1999). „Protein kináza C alfa vázající protein PICK1 interaguje s alternativními sestřihovými variantami podjednotek receptoru AMPA krátké, ale ne dlouhé formy.“ Neurofarmakologie. 38 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0028-3908 (98) 00230-5. PMID 10340301.
^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
^ „Entrez Gene: PICK1 protein interagující s PRKCA 1“.
^ Leonard AS, Yermolaieva O, Hruska-Hageman A, Askwith CC, Price MP, Wemmie JA, Welsh MJ (únor 2003). „cAMP-dependentní protein kináza fosforylace iontového kanálu-1 snímajícího kyselinu reguluje jeho vazbu na protein interagující s C-kinázou-1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (4): 2029–34. doi:10.1073 / pnas.252782799. PMC 149953. PMID 12578970.
^ ^A ^b Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (únor 2002). „Interakce synaptického proteinu PICK1 (protein interagující s C kinázou 1) s beznapěťovými sodíkovými kanály BNC1 (mozek Na + kanál 1) a ASIC (iontový kanál snímající kyselinu)“. Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. doi:10.1042/0264-6021:3610443. PMC 1222326. PMID 11802773.
^ Torres GE, Yao WD, Mohn AR, Quan H, Kim KM, Levey AI, Staudinger J, Caron MG (duben 2001). „Funkční interakce mezi monoaminovými plazmovými membránovými transportéry a synaptickým proteinem obsahujícím PDZ doménu PICK1“. Neuron. 30 (1): 121–34. doi:10.1016 / s0896-6273 (01) 00267-7. PMID 11343649.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (květen 2002). „Proteiny PDZ PICK1, GRIP a syntenin váží více podtypů receptoru glutamátu. Analýza vazebných motivů PDZ“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074 / jbc.C200112200. PMID 11891216.
^ ^A ^b Hirbec H, Francis JC, Lauri SE, Braithwaite SP, Coussen F, Mulle C, Dev KK, Coutinho V, Meyer G, Isaac JT, Collingridge GL, Henley JM, Couthino V (únor 2003). "Rychlá a diferenciální regulace AMPA a kainátových receptorů na hipokampálních mechových vláknech synapsemi PICK1 a GRIP". Neuron. 37 (4): 625–38. doi:10.1016 / s0896-6273 (02) 01191-1. PMC 3314502. PMID 12597860.
^ Jaulin-Bastard F, Saito H, Le Bivic A, Ollendorff V, Marchetto S, Birnbaum D, Borg JP (květen 2001). „Receptor ERBB2 / HER2 diferenciálně interaguje s proteiny domény ERBIN a PICK1 PSD-95 / DLG / ZO-1“. J. Biol. Chem. 276 (18): 15256–63. doi:10,1074 / jbc.M010032200. PMID 11278603.
^ Dev KK, Nakajima Y, Kitano J, Braithwaite SP, Henley JM, Nakanishi S (říjen 2000). „PICK1 interaguje s a reguluje PKC fosforylaci mGLUR7“. J. Neurosci. 20 (19): 7252–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-19-07252.2000. PMC 6772771. PMID 11007882.

Další čtení

Collingridge GL, Isaac JT (2003). "Funkční role proteinových interakcí s AMPA a kainátovými receptory". Neurosci. Res. 47 (1): 3–15. doi:10.1016 / S0168-0102 (03) 00160-3. PMID 12941441.
Xu J, Xia J (2006). "Struktura a funkce PICK1". Neurosignály. 15 (4): 190–201. doi:10.1159/000098482. PMID 17215589.
Staudinger J, Zhou J, Burgess R, Elledge SJ, Olson EN (1995). „PICK1: perinukleární vazebný protein a substrát pro proteinovou kinázu C izolovaný kvasinkovým dvouhybridním systémem“ (PDF). J. Cell Biol. 128 (3): 263–71. doi:10.1083 / jcb.128.3.263. PMC 2120344. PMID 7844141.
Staudinger J, Lu J, Olson EN (1998). „Specifická interakce proteinu PDZ domény PICK1 s koncem COOH proteinové kinázy C-alfa“. J. Biol. Chem. 272 (51): 32019–24. doi:10.1074 / jbc.272.51.32019. PMID 9405395.
Xia J, Zhang X, Staudinger J, Huganir RL (1999). „Shlukování AMPA receptorů synaptickým proteinem PZ1 obsahujícím doménu PDZ“. Neuron. 22 (1): 179–87. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80689-3. PMID 10027300.
Torres R, Firestein BL, Dong H, Staudinger J, Olson EN, Huganir RL, Bredt DS, Gale NW, Yancopoulos GD (1999). "PDZ proteiny se vážou, shlukují a synapticky kolokalizují s Eph receptory a jejich efrinovými ligandy". Neuron. 21 (6): 1453–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80663-7. PMID 9883737.
Takeya R, Takeshige K, Sumimoto H (2000). "Interakce PDZ domény lidského PICK1 s ADP-ribosylačními faktory třídy I". Biochem. Biophys. Res. Commun. 267 (1): 149–55. doi:10.1006 / bbrc.1999.1932. PMID 10623590.
Cowan CA, Yokoyama N, Bianchi LM, Henkemeyer M, Fritzsch B (2000). "EphB2 vede axony ve středové linii a je nezbytný pro normální vestibulární funkci". Neuron. 26 (2): 417–30. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 81174-5. PMID 10839360.
Dev KK, Nakajima Y, Kitano J, Braithwaite SP, Henley JM, Nakanishi S (2001). „PICK1 interaguje s a reguluje PKC fosforylaci mGLUR7“. J. Neurosci. 20 (19): 7252–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-19-07252.2000. PMID 11007882.
Lin WJ, Chang YF, Wang WL, Huang CY (2001). „Protein TIS21 stimulovaný mitogenem interaguje s proteinem rPICK1 vázajícím se na protein-kinázu-Calpha“. Biochem. J. 354 (Pt 3): 635–43. doi:10.1042/0264-6021:3540635. PMC 1221695. PMID 11237868.
Jaulin-Bastard F, Saito H, Le Bivic A, Ollendorff V, Marchetto S, Birnbaum D, Borg JP (2001). „Receptor ERBB2 / HER2 diferenciálně interaguje s proteiny domény ERBIN a PICK1 PSD-95 / DLG / ZO-1“. J. Biol. Chem. 276 (18): 15256–63. doi:10,1074 / jbc.M010032200. PMID 11278603.
Torres GE, Yao WD, Mohn AR, Quan H, Kim KM, Levey AI, Staudinger J, Caron MG (2001). „Funkční interakce mezi monoaminovými plazmovými membránovými transportéry a synaptickým proteinem obsahujícím PDZ doménu PICK1“. Neuron. 30 (1): 121–34. doi:10.1016 / S0896-6273 (01) 00267-7. PMID 11343649.
Lin SH, Arai AC, Wang Z, Nothacker HP, Civelli O (2001). „Karboxylový konec peptidového receptoru uvolňujícího prolaktin interaguje s proteiny domény PDZ zapojenými do shlukování receptoru kyseliny alfa-amino-3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-propionové“. Mol. Pharmacol. 60 (5): 916–23. doi:10,1124 / mol. 60,5,916. PMID 11641419.
Duggan A, Garcia-Anoveros J, Corey DP (2002). „Protein PDZ domény PICK1 a sodíkový kanál BNaC1 interagují a lokalizují se na mechanosenzorických zakončeních neuronů ganglií hřbetních kořenů a dendritech centrálních neuronů“. J. Biol. Chem. 277 (7): 5203–8. doi:10,1074 / jbc.M104748200. PMID 11739374.
Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (2002). „Interakce synaptického proteinu PICK1 (protein interagující s C kinázou 1) s beznapěťovými sodíkovými kanály BNC1 (mozek Na + kanál 1) a ASIC (iontový kanál snímající kyselinu)“. Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. doi:10.1042/0264-6021:3610443. PMC 1222326. PMID 11802773.
Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (2002). „Proteiny PDZ PICK1, GRIP a syntenin váží více podtypů receptoru glutamátu. Analýza vazebných motivů PDZ“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074 / jbc.C200112200. PMID 11891216.
Perroy J, El Far O, Bertaso F, Pin JP, Betz H, Bockaert J, Fagni L (2002). „PICK1 je vyžadován pro řízení synaptického přenosu metabotropním glutamátovým receptorem 7“. EMBO J.. 21 (12): 2990–9. doi:10.1093 / emboj / cdf313. PMC 126066. PMID 12065412.
Jansen AM, Nässel DR, Madsen KL, Jung AG, Gether U, Kjaerulff O (2009). „Exprese PICK1 v nervové soustavě Drosophila se primárně vyskytuje v nervové soustavě“. J. Comp. Neurol. 517 (3): 313–322. doi:10,1002 / cne.22155. PMID 19757495.

externí odkazy

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100151 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068206 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10340301-5] Dev KK, Nishimune A, Henley JM, Nakanishi S (červenec 1999). „Protein kináza C alfa vázající protein PICK1 interaguje s alternativními sestřihovými variantami podjednotek receptoru AMPA krátké, ale ne dlouhé formy.“ Neurofarmakologie. 38 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0028-3908 (98) 00230-5. PMID 10340301.

[pmid10591208-6] Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

[entrez-7] „Entrez Gene: PICK1 protein interagující s PRKCA 1“.

[pmid12578970-8] Leonard AS, Yermolaieva O, Hruska-Hageman A, Askwith CC, Price MP, Wemmie JA, Welsh MJ (únor 2003). „cAMP-dependentní protein kináza fosforylace iontového kanálu-1 snímajícího kyselinu reguluje jeho vazbu na protein interagující s C-kinázou-1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (4): 2029–34. doi:10.1073 / pnas.252782799. PMC 149953. PMID 12578970.

[pmid11802773-9] A ^b Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (únor 2002). „Interakce synaptického proteinu PICK1 (protein interagující s C kinázou 1) s beznapěťovými sodíkovými kanály BNC1 (mozek Na + kanál 1) a ASIC (iontový kanál snímající kyselinu)“. Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. doi:10.1042/0264-6021:3610443. PMC 1222326. PMID 11802773.

[pmid11343649-10] Torres GE, Yao WD, Mohn AR, Quan H, Kim KM, Levey AI, Staudinger J, Caron MG (duben 2001). „Funkční interakce mezi monoaminovými plazmovými membránovými transportéry a synaptickým proteinem obsahujícím PDZ doménu PICK1“. Neuron. 30 (1): 121–34. doi:10.1016 / s0896-6273 (01) 00267-7. PMID 11343649.

[pmid11891216-11] A ^b ^C ^d ^E Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (květen 2002). „Proteiny PDZ PICK1, GRIP a syntenin váží více podtypů receptoru glutamátu. Analýza vazebných motivů PDZ“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074 / jbc.C200112200. PMID 11891216.

[pmid12597860-12] A ^b Hirbec H, Francis JC, Lauri SE, Braithwaite SP, Coussen F, Mulle C, Dev KK, Coutinho V, Meyer G, Isaac JT, Collingridge GL, Henley JM, Couthino V (únor 2003). "Rychlá a diferenciální regulace AMPA a kainátových receptorů na hipokampálních mechových vláknech synapsemi PICK1 a GRIP". Neuron. 37 (4): 625–38. doi:10.1016 / s0896-6273 (02) 01191-1. PMC 3314502. PMID 12597860.

[pmid11278603-13] Jaulin-Bastard F, Saito H, Le Bivic A, Ollendorff V, Marchetto S, Birnbaum D, Borg JP (květen 2001). „Receptor ERBB2 / HER2 diferenciálně interaguje s proteiny domény ERBIN a PICK1 PSD-95 / DLG / ZO-1“. J. Biol. Chem. 276 (18): 15256–63. doi:10,1074 / jbc.M010032200. PMID 11278603.

[pmid11007882-14] Dev KK, Nakajima Y, Kitano J, Braithwaite SP, Henley JM, Nakanishi S (říjen 2000). „PICK1 interaguje s a reguluje PKC fosforylaci mGLUR7“. J. Neurosci. 20 (19): 7252–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-19-07252.2000. PMC 6772771. PMID 11007882.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]