PEX14 - PEX14

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Konzervovaná oblast peroxisomálního membránového kotevního proteinu (Pex14p)
Identifikátory
Symbol	Pex14_N
Pfam	PF04695
InterPro	IPR006785
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

PEX14
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2W84, 2W85, 4BXU
Identifikátory
Aliasy	PEX14, NAPP2, PBD13A, Pex14p, dJ734G22.2, peroxisomální biogeneze faktor 14
Externí ID	OMIM: 601791 MGI: 1927868 HomoloGene: 37936 Genové karty: PEX14
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	10,630,758 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	149,099,876 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba N-konce proteinu; • vazba mikrotubulů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu; • vazba na receptory;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • peroxisomální membrána; • peroxisom; • intracelulární; • buněčné jádro; • fibrilární centrum; • komplex peroxisomálního importomeru; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• organizace peroxisomu; • negativní regulace homotetramerizace bílkovin; • transport peroxisomu podél mikrotubulů; • negativní regulace vazby na bílkoviny; • negativní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • ukotvení mikrotubulů; • import bílkovin do peroxisomové matrice; • import bílkovin do peroxisomové matrice, uvolňování substrátu; • transport bílkovin; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • homooligomerizace bílkovin; • import proteinů do peroxisomové matrice, translokace; • doprava; • cílení proteinů na peroxisom; • import bílkovin do peroxisomové matrice, dokování; • ubikvitinace bílkovin; • sestava makromolekulárního komplexu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5195
	56273
	ENSG00000142655
	ENSMUSG00000028975
	O75381
	Q9R0A0
	NM_004565
	NM_019781
	NP_004556
	NP_062755
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Peroxisomální membránový protein PEX14 je protein že u lidí je kódován PEX14 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje podstatnou součást peroxizomálního importního aparátu. Protein je integrován do peroxisomových membrán s jeho C-koncem vystaveným cytosolu a interaguje s cytosolickým receptorem pro proteiny obsahující PTS1 signál zaměřený na peroxisomální cílení. Protein také funguje jako transkripční corepresor a interaguje s histon-deacetylázou. Mutace v tomto genu vede k jedné formě Zellwegerův syndrom.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PEX14 komunikovat s

PEX5,^[7]^[8]^[9]^[10]
PEX7,^[10] a
PEX13.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000142655 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028975 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fransen M, Terlecký SR, Subramani S (červenec 1998). „Identifikace dokovacího proteinu lidského PTS1 receptoru přímo požadovaného pro import peroxisomálního proteinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (14): 8087–92. doi:10.1073 / pnas.95.14.8087. PMC 20933. PMID 9653144.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PEX14 peroxisomální biogeneze faktor 14".
^ ^A ^b Otera H, Setoguchi K, Hamasaki M, Kumashiro T, Shimizu N, Fujiki Y (březen 2002). „Peroxisomální cílový signální receptor Pex5p interaguje s nákladem a importuje strojní součásti prostorově časově diferencovaným způsobem: konzervované motivy Pex5p WXXXF / Y jsou rozhodující pro import proteinů matice“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1639–55. doi:10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002. PMC 135613. PMID 11865044.
^ Okumoto K, Abe I, Fujiki Y (srpen 2000). „Molekulární anatomie peroxinu Pex12p: doména prstového prstu je nezbytná pro funkci Pex12p a interaguje s peroxisomovým signálem typu 1 receptoru Pex5p a kruhovým peroxinem, Pex10p“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (33): 25700–10. doi:10,1074 / jbc.M003303200. PMID 10837480.
^ Shimizu N, Itoh R, Hirono Y, Otera H, Ghaedi K, Tateishi K, Tamura S, Okumoto K, Harano T, Mukai S, Fujiki Y (duben 1999). „Klonování cDNA peroxinu Pex14p. CDNA funkční komplementací na mutantu vaječníků čínského křečka, charakterizace a funkční analýza“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12593–604. doi:10.1074 / jbc.274.18.12593. PMID 10212238.
^ ^A ^b Managadze D, Würtz C, Sichting M, Niehaus G, Veenhuis M, Rottensteiner H (červen 2007). „Peroxin PEX14 Neurospora crassa je nezbytný pro biogenezi glyoxysomů i těl woroninu“ (PDF). Provoz. 8 (6): 687–701. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00560.x. PMID 17461798.

Další čtení

Albertini M, Rehling P, Erdmann R, Girzalsky W, Kiel JA, Veenhuis M, Kunau WH (duben 1997). „Pex14p, peroxizomální membránový protein vázající oba receptory dvou PTS-závislých importních drah“ (PDF). Buňka. 89 (1): 83–92. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80185-3. PMID 9094717.
Huhse B, Rehling P, Albertini M, Blank L, Meller K, Kunau WH (leden 1998). „Pex17p Saccharomyces cerevisiae je nový peroxin a součást translokačního aparátu peroxisomálního proteinu“. The Journal of Cell Biology. 140 (1): 49–60. doi:10.1083 / jcb.140.1.49. PMC 2132588. PMID 9425153.
Will GK, Soukupova M, Hong X, Erdmann KS, Kiel JA, Dodt G, Kunau WH, Erdmann R (březen 1999). "Identifikace a charakterizace lidského ortologu kvasinek Pex14p". Molekulární a buněčná biologie. 19 (3): 2265–77. doi:10,1128 / mcb.19.3.2265. PMC 84019. PMID 10022913.
Girzalsky W, Rehling P, Stein K, Kipper J, Blank L, Kunau WH, Erdmann R (březen 1999). „Zapojení Pex13p do lokalizace Pex14p a peroxisomální cílení signalizuje signál 2 závislý import proteinu do peroxisomů“. The Journal of Cell Biology. 144 (6): 1151–62. doi:10.1083 / jcb.144.6.1151. PMC 2150583. PMID 10087260.
Shimizu N, Itoh R, Hirono Y, Otera H, Ghaedi K, Tateishi K, Tamura S, Okumoto K, Harano T, Mukai S, Fujiki Y (duben 1999). „Klonování cDNA peroxinu Pex14p. CDNA funkční komplementací na mutantu vaječníků čínského křečka, charakterizace a funkční analýza“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12593–604. doi:10.1074 / jbc.274.18.12593. PMID 10212238.
Sacksteder KA, Jones JM, South ST, Li X, Liu Y, Gould SJ (březen 2000). „PEX19 váže více proteinů peroxisomální membrány, je převážně cytoplazmatický a je vyžadován pro syntézu membrán peroxisomu“. The Journal of Cell Biology. 148 (5): 931–44. doi:10.1083 / jcb.148.5.931. PMC 2174547. PMID 10704444.
Gavva NR, Wen SC, Daftari P, Moniwa M, Yang WM, Yang-Feng LP, Seto E, Davie JR, Shen CK (březen 2002). „NAPP2, protein peroxisomální membrány, je také transkripčním corepresorem“. Genomika. 79 (3): 423–31. doi:10.1006 / geno.2002.6714. PMID 11863372.
Otera H, Setoguchi K, Hamasaki M, Kumashiro T, Shimizu N, Fujiki Y (březen 2002). „Peroxisomální cílový signální receptor Pex5p interaguje s nákladem a importuje strojní součásti prostorově časově diferencovaným způsobem: konzervované motivy Pex5p WXXXF / Y jsou rozhodující pro import proteinů matice“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1639–55. doi:10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002. PMC 135613. PMID 11865044.
Alland L, David G, Shen-Li H, Potes J, Muhle R, Lee HC, Hou H, Chen K, DePinho RA (duben 2002). "Identifikace savčího Sds3 jako integrální součásti komplexu sin3 / histon-deacetyláza s jádrovým kompresorem". Molekulární a buněčná biologie. 22 (8): 2743–50. doi:10.1128 / MCB.22.8.2743-2750.2002. PMC 133736. PMID 11909966.
Fransen M, Brees C, Ghys K, Amery L, Mannaerts GP, Ladant D, Van Veldhoven PP (březen 2002). „Analýza savčích peroxinových interakcí pomocí bakteriálního dvouhybridního testu bez transkripce“. Molekulární a buněčná proteomika. 1 (3): 243–52. doi:10,1074 / mcp.M100025-MCP200. PMID 12096124.
Oliveira ME, Reguenga C, Gouveia AM, Guimarães CP, Schliebs W, Kunau WH, Silva MT, Sá-Miranda C, Azevedo JE (prosinec 2002). "Savčí Pex14p: membránová topologie a charakterizace interakce Pex14p-Pex14p". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1567 (1–2): 13–22. doi:10.1016 / s0005-2736 (02) 00635-1. PMID 12488033.
Fransen M, Vastiau I, Brees C, Brys V, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (březen 2004). „Potenciální role Pex19p při sestavování dokovacích komplexů s PTS-receptory“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (13): 12615–24. doi:10,1074 / jbc.M304941200. PMID 14715663.
Shimozawa N, Tsukamoto T, Nagase T, Takemoto Y, Koyama N, Suzuki Y, Komori M, Osumi T, Jeannette G, Wanders RJ, Kondo N (červen 2004). "Identifikace nové komplementační skupiny poruch biogeneze peroxisomu a PEX14 jako mutovaného genu". Lidská mutace. 23 (6): 552–8. doi:10.1002 / humu.20032. PMID 15146459.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Nguyen T, Bjorkman J, Paton BC, Crane DI (únor 2006). „Selhání dělení peroxisomů zprostředkovaného mikrotubuly a obchodování s poruchami se sníženým výskytem peroxisomu“. Journal of Cell Science. 119 (Pt 4): 636–45. doi:10.1242 / jcs.02776. PMID 16449325.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW záznam o poruchách peroxidomové biogeneze, spektrum Zellwegerova syndromu
OMIM entries on Peroxisome Biogenesis Disorders, Zellweger Syndrome Spectrum
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_PEX_1
Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_PEX_2
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O75381 (Peroxisomální membránový protein PEX14) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000142655 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028975 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9653144-5] Fransen M, Terlecký SR, Subramani S (červenec 1998). „Identifikace dokovacího proteinu lidského PTS1 receptoru přímo požadovaného pro import peroxisomálního proteinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (14): 8087–92. doi:10.1073 / pnas.95.14.8087. PMC 20933. PMID 9653144.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: PEX14 peroxisomální biogeneze faktor 14".

[pmid11865044-7] A ^b Otera H, Setoguchi K, Hamasaki M, Kumashiro T, Shimizu N, Fujiki Y (březen 2002). „Peroxisomální cílový signální receptor Pex5p interaguje s nákladem a importuje strojní součásti prostorově časově diferencovaným způsobem: konzervované motivy Pex5p WXXXF / Y jsou rozhodující pro import proteinů matice“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1639–55. doi:10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002. PMC 135613. PMID 11865044.

[pmid10837480-8] Okumoto K, Abe I, Fujiki Y (srpen 2000). „Molekulární anatomie peroxinu Pex12p: doména prstového prstu je nezbytná pro funkci Pex12p a interaguje s peroxisomovým signálem typu 1 receptoru Pex5p a kruhovým peroxinem, Pex10p“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (33): 25700–10. doi:10,1074 / jbc.M003303200. PMID 10837480.

[pmid10212238-9] Shimizu N, Itoh R, Hirono Y, Otera H, Ghaedi K, Tateishi K, Tamura S, Okumoto K, Harano T, Mukai S, Fujiki Y (duben 1999). „Klonování cDNA peroxinu Pex14p. CDNA funkční komplementací na mutantu vaječníků čínského křečka, charakterizace a funkční analýza“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12593–604. doi:10.1074 / jbc.274.18.12593. PMID 10212238.

[pmid17461798-10] A ^b Managadze D, Würtz C, Sichting M, Niehaus G, Veenhuis M, Rottensteiner H (červen 2007). „Peroxin PEX14 Neurospora crassa je nezbytný pro biogenezi glyoxysomů i těl woroninu“ (PDF). Provoz. 8 (6): 687–701. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00560.x. PMID 17461798.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]