PEG10 - PEG10

PEG10
Identifikátory
Aliasy	PEG10, EDR, HB-1, MEF3L, Mar2, Mart2, RGAG3, otcovsky vyjádřeno 10, SIRH1, RTL2
Externí ID	OMIM: 609810 MGI: 2157785 HomoloGene: 116067 Genové karty: PEG10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	94,669,695 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	4,760,517 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • apoptotický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23089
	170676
	ENSG00000242265
	ENSMUSG00000092035
	Q86TG7
	Q7TN75
NM_015068; NM_001040152; NM_001172437; NM_001172438; NM_001184961;
	NM_001184962
	NM_001040611; NM_130877
NP_001035242; NP_001165908; NP_001165909; NP_001171890; NP_001171891;
	NP_055883
	NP_001035701; NP_570947
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein PEG10 odvozený od retrotransposonu je protein že u lidí je kódován PEG10 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Tento gen zahrnuje dva překrývající se čtecí rámce stejného transkriptu kódujícího odlišné izoformy. Kratší izoforma má motiv zinkového prstu typu CCHC obsahující sekvenci charakteristickou pro gag proteiny většiny retrovirů a některých retrotranspozonů a funguje částečně při interakci s členy rodiny receptorů TGF-beta. Delší izoforma má konsensuální sekvenci DSG v aktivním místě proteázové domény pol proteinů. Delší izoforma je výsledkem -1 posunu posunu snímků, který je také vidět u některých retrovirů. Exprese těchto dvou izoforem pochází pouze z otcovské alely kvůli otisku. Zvýšená genová exprese (jak je pozorováno zvýšením hladin mRNA) je spojena s hepatocelulárními karcinomy.^[8]

PEG10 je otcovsky exprimovaný otisknutý gen, který je exprimován v dospělých a embryonálních tkáních.^[9] Nejpozoruhodnější výraz se vyskytuje v placentě. Tento gen je vysoce konzervovaný napříč druhy savců a zachovává heptanukleotid (GGGAAAC). Uvádí se, že tento gen hraje roli v buněčné proliferaci, diferenciaci a apoptóze. Nadměrná exprese tohoto genu byla spojena s několika malignitami, jako je hepatocelulární karcinom a B-buněčná lymfocytární leukémie. Vyřazené myši bez tohoto genu vykazovaly časnou embryonální letalitu s placentárními defekty, což naznačuje důležitost tohoto genu pro embryonální vývoj. V preeklampsii placentární tkáni bylo prokázáno, že PEG10 je downregulován^[10] a upregulovaný^[11] implikovat to jako možnou kauzální roli ve výskytu preeklampsie.

Interakce

Ukázalo se, že PEG10 komunikovat s SIAH2^[12] a SIAH1.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000242265 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000092035 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ono R, Kobayashi S, Wagatsuma H, Aisaka K, Kohda T, Kaneko-Ishino T, Ishino F (duben 2001). „Gen odvozený od retrotransposonu, PEG10, je nový otištěný gen lokalizovaný na lidském chromozomu 7q21“. Genomika. 73 (2): 232–7. doi:10.1006 / geno.2001.6494. PMID 11318613.
^ Brandt J, Schrauth S, Veith AM, Froschauer A, Haneke T, Schultheis C, Gessler M, Leimeister C, Volff JN (leden 2005). "Transponovatelné prvky jako zdroj genetické inovace: exprese a vývoj rodiny retrotransposonů odvozených neogenů u savců". Gen. 345 (1): 101–11. doi:10.1016 / j.gene.2004.11.022. PMID 15716091.
^ Brandt J, Veith AM, Volff JN (srpen 2005). "Rodina neofunkcionalizovaných genů Ty3 / gypsy retrotransposon v genomech savců". Cytogenetický a genomový výzkum. 110 (1–4): 307–17. doi:10.1159/000084963. PMID 16093683. S2CID 38398479.
^ ^A ^b „Entrezův gen: PEG10 otcovsky vyjádřeno 10“.
^ „PEG10 otcovsky vyjádřeno 10 [Homo sapiens (člověk)]“ “. Pubmed. Citováno 14. dubna 2015.
^ Liang XY, Chen X, Jin YZ, Chen XO, Chen QZ (18. prosince 2014). "Exprese a význam otiskovaného genu PEG10 v placentě pacientů s preeklampsií". Genetika a molekulární výzkum. 13 (4): 10607–14. doi:10.4238 / 2014.December.18.2. PMID 25526181.
^ Chen H, Sun M, Zhao G, Liu J, Gao W, Si S, Meng T (říjen 2012). "Zvýšená exprese PEG10 v lidských placentách z preeklamptických těhotenství". Acta Histochemica. 114 (6): 589–93. doi:10.1016 / j.acthis.2011.11.003. PMID 22137777.
^ ^A ^b Okabe H, Satoh S, Furukawa Y, Kato T, Hasegawa S, Nakajima Y, Yamaoka Y, Nakamura Y (červen 2003). "Zapojení PEG10 do lidské hepatocelulární karcinogeneze prostřednictvím interakce s SIAH1". Výzkum rakoviny. 63 (12): 3043–8. PMID 12810624.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červen 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
Volff J, Körting C, Schartl M (únor 2001). „Fosílie Ty3 / Gypsy retrotransposonů v genomech savců: vyvinuly se do nových buněčných funkcí?“. Molekulární biologie a evoluce. 18 (2): 266–70. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a003801. PMID 11158386.
Shigemoto K, Brennan J, Walls E, Watson CJ, Stott D, Rigby PW, Reith AD (říjen 2001). „Identifikace a charakterizace vývojově regulovaného savčího genu, který využívá -1 naprogramovaný posun ribozomálních rámců“. Výzkum nukleových kyselin. 29 (19): 4079–88. doi:10.1093 / nar / 29.19.4079. PMC 60235. PMID 11574691.
Smallwood A, Papageorghiou A, Nicolaides K, Alley MK, Jim A, Nargund G, Ojha K, Campbell S, Banerjee S (červenec 2003). „Časová regulace exprese syncytinu (HERV-W), mateřsky potištěný PEG10 a SGCE v lidské placentě“. Biologie reprodukce. 69 (1): 286–93. doi:10.1095 / biolreprod.102.013078. PMID 12620933.
Okabe H, Satoh S, Furukawa Y, Kato T, Hasegawa S, Nakajima Y, Yamaoka Y, Nakamura Y (červen 2003). "Zapojení PEG10 do lidské hepatocelulární karcinogeneze prostřednictvím interakce s SIAH1". Výzkum rakoviny. 63 (12): 3043–8. PMID 12810624.
Tsou AP, Chuang YC, Su JY, Yang CW, Liao YL, Liu WK, Chiu JH, Chou CK (2004). „Nadměrná exprese nového potištěného genu, PEG10, v lidském hepatocelulárním karcinomu a v regenerujících myších játrech“. Journal of Biomedical Science. 10 (6 Pt 1): 625–35. doi:10.1159/000073528. PMID 14576465. S2CID 202655065.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Lux A, Beil C, Majety M, Barron S, Gallione CJ, Kuhn HM, Berg JN, Kioschis P, Marchuk DA, Hafner M (březen 2005). „Lidské retrovirové proteiny podobné gag a gag-pol interagují s kinázou 1 podobnou receptoru aktivujícího receptor pro růstový faktor-beta.“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (9): 8482–93. doi:10,1074 / jbc.M409197200. PMID 15611116.
Manktelow E, Shigemoto K, Brierley I (2005). "Charakterizace signálu posunu rámců Edr, příklad savce naprogramovaného -1 posunu ribozomálních rámců". Výzkum nukleových kyselin. 33 (5): 1553–63. doi:10.1093 / nar / gki299. PMC 1065257. PMID 15767280.
He H, Olesnanik K, Nagy R, Liyanarachchi S, Prasad ML, Stratakis CA, Kloos RT, de la Chapelle A (červenec 2005). "Alelická variace v genové expresi ve tkáni štítné žlázy". Štítná žláza. 15 (7): 660–7. doi:10.1089 / tv. 2005.15.660. PMID 16053381.
Hu C, Xiong J, Zhang L, Huang B, Zhang Q, Li Q, Yang M, Wu Y, Wu Q, Shen Q, Gao Q, Zhang K, Sun Z, Liu J, Jin Y, Tan J (srpen 2004 ). „Aktivace PEG10 ko-stimulací CXCR5 a CCR7 v zásadě přispívá k rezistenci na apoptózu v CD19 + CD34 + B buňkách od pacientů s akutní a chronickou lymfocytární leukemií B buněčné linie“. Buněčná a molekulární imunologie. 1 (4): 280–94. PMID 16225771.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Li CM, Margolin AA, Salas M, Memeo L, Mansukhani M, Hibshoosh H, Szabolcs M, Klinakis A, Tycko B (leden 2006). „PEG10 je cílový gen c-MYC v rakovinných buňkách“. Výzkum rakoviny. 66 (2): 665–72. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1553. PMID 16423995.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000242265 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000092035 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11318613-5] Ono R, Kobayashi S, Wagatsuma H, Aisaka K, Kohda T, Kaneko-Ishino T, Ishino F (duben 2001). „Gen odvozený od retrotransposonu, PEG10, je nový otištěný gen lokalizovaný na lidském chromozomu 7q21“. Genomika. 73 (2): 232–7. doi:10.1006 / geno.2001.6494. PMID 11318613.

[pmid15716091-6] Brandt J, Schrauth S, Veith AM, Froschauer A, Haneke T, Schultheis C, Gessler M, Leimeister C, Volff JN (leden 2005). "Transponovatelné prvky jako zdroj genetické inovace: exprese a vývoj rodiny retrotransposonů odvozených neogenů u savců". Gen. 345 (1): 101–11. doi:10.1016 / j.gene.2004.11.022. PMID 15716091.

[pmid16093683-7] Brandt J, Veith AM, Volff JN (srpen 2005). "Rodina neofunkcionalizovaných genů Ty3 / gypsy retrotransposon v genomech savců". Cytogenetický a genomový výzkum. 110 (1–4): 307–17. doi:10.1159/000084963. PMID 16093683. S2CID 38398479.

[entrez-8] A ^b „Entrezův gen: PEG10 otcovsky vyjádřeno 10“.

[9] „PEG10 otcovsky vyjádřeno 10 [Homo sapiens (člověk)]“ “. Pubmed. Citováno 14. dubna 2015.

[10] Liang XY, Chen X, Jin YZ, Chen XO, Chen QZ (18. prosince 2014). "Exprese a význam otiskovaného genu PEG10 v placentě pacientů s preeklampsií". Genetika a molekulární výzkum. 13 (4): 10607–14. doi:10.4238 / 2014.December.18.2. PMID 25526181.

[11] Chen H, Sun M, Zhao G, Liu J, Gao W, Si S, Meng T (říjen 2012). "Zvýšená exprese PEG10 v lidských placentách z preeklamptických těhotenství". Acta Histochemica. 114 (6): 589–93. doi:10.1016 / j.acthis.2011.11.003. PMID 22137777.

[pmid12810624-12] A ^b Okabe H, Satoh S, Furukawa Y, Kato T, Hasegawa S, Nakajima Y, Yamaoka Y, Nakamura Y (červen 2003). "Zapojení PEG10 do lidské hepatocelulární karcinogeneze prostřednictvím interakce s SIAH1". Výzkum rakoviny. 63 (12): 3043–8. PMID 12810624.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]