PDZD11 - PDZD11

PDZD11

Protein PDZD11 PDB 1wi2.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1WI2

Identifikátory

PDZD11, AIPP1, PDZK11, PISP, PDZ doména obsahující 11

Externí ID

OMIM: 300632 MGI: 1919871 HomoloGene: 9530 Genové karty: PDZD11

Umístění genu (člověk)

Chr.	X chromozom (lidský)^[1]

Kapela	Xq13.1	Start	70,286,595 bp^[1]
Kapela	Xq13.1	Konec	70,290,514 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	X chromozom (myš)^[2]

Kapela	X \| X C3	Start	100,622,883 bp^[2]
Kapela	X \| X C3	Konec	100,626,568 bp^[2]

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na C-konec proteinu • GO: 0001948 vazba na proteiny
Buněčná složka	• cytoplazma • extracelulární oblast • cytosol • synapse • mezibuněčné spojení • presynapse • bazolaterální plazmatická membrána
Biologický proces	• udržování apikální / bazální polarity epiteliálních buněk • lokalizace proteinu na bazolaterální plazmatickou membránu • GO: Sekrece neurotransmiteru 0010554 • biotinový metabolický proces • metabolický proces pantothenátu • antimikrobiální humorální odpověď • iontový transmembránový transport • transmembránová doprava
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


51248


72621


ENSG00000120509


ENSMUSG00000015668


Q5EBL8


Q9CZG9

RefSeq (mRNA)


NM_016484


NM_028303 NM_001356384

RefSeq (protein)

NP_057568 NP_001357103 NP_001357104 NP_001357105 NP_001357106
NP_001357107


NP_082579 NP_001343313

Místo (UCSC)

Chr X: 70,29 - 70,29 Mb

Chr X: 100,62 - 100,63 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující PDZ doménu 11 je protein že u lidí je kódován PDZD11 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120509 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015668 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (listopad 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (říjen 2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
^ „Entrez Gene: PDZD11 PDZ doména obsahující 11“.

Další čtení

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Goellner GM, DeMarco SJ, Strehler EE (2003). "Charakterizace PISP, nového jediného proteinu PDZ, který se váže na všechny varianty b-sestřihu Ca2 + -ATPázy v plazmové membráně". Ann. N. Y. Acad. Sci. 986: 461–71. doi:10.1111 / j.1749-6632.2003.tb07230.x. PMID 12763866.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Stephenson SE, Dubach D, Lim CM a kol. (2005). „Jeden protein domény PDZ interaguje s měděnou ATPázou Menkes, ATP7A. Nový protein zapojený do homeostázy mědi“. J. Biol. Chem. 280 (39): 33270–9. doi:10,1074 / jbc.M505889200. PMID 16051599.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.