OmpA doména - OmpA domain
| OmpA rodina | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura komplexu tolb / pal | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | OmpA | ||||||||
| Pfam | PF00691 | ||||||||
| InterPro | IPR006665 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00819 | ||||||||
| SCOP2 | 1r1m / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.6 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se OmpA doména je konzervovaný proteinová doména s beta / alfa / beta / alfa-beta (2) struktura nalezen v C-terminál oblast mnoha Gramnegativní bakterie proteiny vnější membrány, jako porin -jako integrální membránové proteiny (například ompA), malý lipidově ukotvené proteiny (například kamarád) a MotB protonové kanály.[1][2][3][4] The N-terminál polovina z nich bílkoviny je variabilní, i když některé z proteinů v této skupině mají Transmembránová doména podobná OmpA na N-konci. OmpA z Escherichia coli je požadováno pro patogeneze a může komunikovat s hostitelem receptor molekuly.[5] MotB (a MotA) plní dvě funkce v E-coli, MotA (4) -MotB (2) komplex připojí k buněčná stěna přes MotB k vytvoření stator z bičíkovec motor a komplex MotA-MotB spojuje tok ionty přes buněčná membrána k pohybu rotoru.[4]
Viz také
Reference
- ^ Bouveret E, Benedetti H, Rigal A, Loret E, Lazdunski C (říjen 1999). „Charakterizace interakcí lipoproteinů (PAL) -peptidoglykanů a PAL-TolB souvisejících s peptidoglykanem“. J. Bacteriol. 181 (20): 6306–11. doi:10.1128 / JB.181.20.6306-6311.1999. PMC 103764. PMID 10515919.
- ^ De Mot R, Proost P, Van Damme J, Vanderleyden J (únor 1992). "Homologie kořenového adhesinu z Pseudomonas fluorescens OE 28,3 s porinem F o P. aeruginosa a P. syringae". Mol. Gen. Genet. 231 (3): 489–93. doi:10.1007 / BF00292721. PMID 1538702. S2CID 7518948.
- ^ Freudl R, Klose M, Henning U (červen 1990). "Export a třídění Escherichia coli protein vnější membrány OmpA ". J. Bioenerg. Biomembr. 22 (3): 441–9. doi:10.1007 / BF00763176. PMID 2202726. S2CID 22623025.
- ^ A b Hosking ER, Vogt C, Bakker EP, Manson MD (prosinec 2006). „The Escherichia coli Protonový kanál MotAB odpojen ". J. Mol. Biol. 364 (5): 921–37. doi:10.1016 / j.jmb.2006.09.035. PMID 17052729.
- ^ Selvaraj SK, Periandythevar P, Prasadarao NV (duben 2007). "Vnější membránový protein A z Escherichia coli K1 selektivně zvyšuje expresi mezibuněčné adhezní molekuly-1 v mikrovaskulárních endoteliálních buňkách mozku ". Mikroby jsou infikovány. 9 (5): 547–57. doi:10.1016 / j.micinf.2007.01.020. PMC 1993839. PMID 17368067.