ODC1 - ODC1

ODC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2OO0, 4ZGY, 5BWA, 1D7K, 2ON3
Identifikátory
Aliasy	ODC1, ODC, ornithin dekarboxyláza 1
Externí ID	OMIM: 165640 MGI: 97402 HomoloGene: 1906 Genové karty: ODC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	10,448,327 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	17,551,505 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ornithin dekarboxylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita karboxy-lyázy; • katalytická aktivita; • aktivita lyázy;
Buněčná složka	• perinukleární oblast cytoplazmy; • cytosol; • cytoplazma; • buněčná složka;
Biologický proces	• proces biosyntézy putrescinu; • polyaminový biosyntetický proces; • reakce na virus; • polyaminový metabolický proces; • regulace buněčného metabolismu aminokyselin; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • vývoj ledvin; • regulace proteinového katabolického procesu; • biosyntetický proces putrescinu z ornitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4953
	18263
	ENSG00000115758
	ENSMUSG00000011179
	P11926
	P00860
	NM_002539; NM_001287188; NM_001287189; NM_001287190
	NM_013614
	NP_001274117; NP_001274118; NP_001274119; NP_002530
	NP_038642
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ornithin dekarboxyláza je enzym že u lidí je kódován ODC1 gen.

Tento gen kóduje enzym omezující rychlost polyamin biosyntetická dráha, která katalyzuje ornitin na putrescine. Úroveň aktivity enzymu se mění v reakci na stimuly podporující růst a vykazuje vysokou míru obratu ve srovnání s jinými savci bílkoviny. Gen původně kódující tento enzym byl původně lokalizován na obou chromozomech 2 a 7 a bylo zjištěno, že je lokalizován na 2p25 s pseudogen umístěný na 7q31-qter.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115758 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011179 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ODC1 ornithine dekarboxyláza 1“.

Další čtení

Pegg AE (květen 2006). „Regulace ornithin dekarboxylázy“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (21): 14529–32. doi:10,1074 / jbc.R500031200. PMID 16459331.
Yoshida M, Hayashi H, Taira M, Isono K (prosinec 1992). "Zvýšená exprese genu pro ornithin dekarboxylázu u lidské rakoviny jícnu". Výzkum rakoviny. 52 (23): 6671–5. PMID 1423312.
Moshier JA, Osborne DL, Skunca M, Dosescu J, Gilbert JD, Fitzgerald MC a kol. (Květen 1992). "Více elementů promotoru řídí expresi genu lidské ornithin dekarboxylázy v buňkách karcinomu tlustého střeva". Výzkum nukleových kyselin. 20 (10): 2581–90. doi:10.1093 / nar / 20.10.2581. PMC 312396. PMID 1598217.
Hickok NJ, Wahlfors J, Crozat A, Halmekytö M, Alhonen L, Jänne J, Jänne OA (září 1990). "Lidská ornithin dekarboxyláza kódující lokusy: nukleotidová sekvence exprimovaného genu a charakterizace pseudogenu". Gen. 93 (2): 257–63. doi:10.1016 / 0378-1119 (90) 90233-H. PMID 2227439.
Hsieh JT, Denning MF, Heidel SM, Verma AK (duben 1990). „Exprese lidského genu ornithin dekarboxylázy chromozomu 2 v ovariálních buňkách čínského křečka s nedostatkem ornithin dekarboxylázy“. Výzkum rakoviny. 50 (8): 2239–44. PMID 2317811.
Moshier JA, Gilbert JD, Skunca M, Dosescu J, Almodovar KM, Luk GD (březen 1990). "Izolace a exprese lidského genu pro ornithin dekarboxylázu". The Journal of Biological Chemistry. 265 (9): 4884–92. PMID 2318872.
Verrando P, Juhlin L, Lacour JP, Ortonne JP (duben 1987). "Imunohistochemická lokalizace ornithin dekarboxylázy v lidské kůži". The Journal of Dermatology. 14 (2): 112–7. doi:10.1111 / j.1346-8138.1987.tb03542.x. PMID 2440930. S2CID 39626267.
van Steeg H, van Oostrom CT, Martens JW, van Kreyl C, Schepens J, Wieringa B (listopad 1989). "Nukleotidová sekvence lidského genu pro ornithin dekarboxylázu". Výzkum nukleových kyselin. 17 (21): 8855–6. doi:10.1093 / nar / 17.21.8855. PMC 335049. PMID 2587220.
Fitzgerald MC, Flanagan MA (listopad 1989). "Charakterizace a sekvenční analýza lidského genu pro ornithin dekarboxylázu". Dna. 8 (9): 623–34. doi:10.1089 / dna.1.1989.8.623. PMID 2693021.
Alhonen-Hongisto L, Leinonen P, Sinervirta R, Laine R, Winqvist R, Alitalo K a kol. (Únor 1987). „Myší a lidské ornithin dekarboxylázové geny. Methylační polymorfismus a amplifikace“. The Biochemical Journal. 242 (1): 205–10. doi:10.1042 / bj2420205. PMC 1147684. PMID 3036086.
Kaczmarek L, Calabretta B, Ferrari S, de Riel JK (září 1987). "Exprese lidské ornithin dekarboxylázy závislá na buněčném cyklu". Journal of Cellular Physiology. 132 (3): 545–51. doi:10.1002 / jcp.1041320318. PMID 3308908. S2CID 45689962.
Hickok NJ, Seppänen PJ, Gunsalus GL, Jänne OA (červen 1987). "Kompletní aminokyselinová sekvence lidské ornithin dekarboxylázy odvozená z komplementární DNA". Dna. 6 (3): 179–87. doi:10.1089 / dna.1987.6.179. PMID 3595418.
Winqvist R, Mäkelä TP, Seppänen P, Jänne OA, Alhonen-Hongisto L, Jänne J a kol. (1986). „Lidské ornithin dekarboxylázové sekvence se mapují na oblasti chromozomu 2pter ---- p23 a 7cen ---- qter, ale nejsou společně zesíleny onkogenem NMYC“. Cytogenetika a buněčná genetika. 42 (3): 133–40. doi:10.1159/000132266. PMID 3755388.
Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N a kol. (Prosinec 1994). "Konstrukce lidské plné cDNA banky". Gen. 150 (2): 243–50. doi:10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
Kim YJ, Pan H, Verma AK (červenec 1994). „Non-AP-1 promotor nádoru 12-0-tetradekanoylforbol-13-acetátové sekvence reagující v genu lidské ornithin dekarboxylázy“. Molekulární karcinogeneze. 10 (3): 169–79. doi:10,1002 / mc. 2940100308. PMID 8043198. S2CID 12159876.
Müller M, Pajunen AE, Järvinen M, Poeggel G, Bernstein HG (1994). "Imunohistochemická demonstrace proteinu enzymu L-ornithin dekarboxylázy v různých oblastech vyvíjejícího se lidského mozku". Vývojová neurověda. 15 (2): 87–93. doi:10.1159/000111320. PMID 8168440.
Ichiba T, Matsufuji S, Miyazaki Y, Murakami Y, Tanaka K, Ichihara A, Hayashi S (květen 1994). "Funkční oblasti antizymu ornithin dekarboxylázy". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 200 (3): 1721–7. doi:10.1006 / bbrc.1994.1651. PMID 8185631.
Wright PS, Cooper JR, Cross-Doersen DE, Miller JA, Chmielewski PA, Wagner RL a kol. (Září 1995). „Regulace hladin mRNA ornithin dekarboxylázy v lidských buňkách rakoviny prsu: vzor exprese a zapojení prvku promotoru jádra enhancer“. Růst a diferenciace buněk. 6 (9): 1097–102. PMID 8519686.
Heiskala M, Zhang J, Hayashi S, Hölttä E, Andersson LC (březen 1999). „Translokace ornithin dekarboxylázy na povrchovou membránu během aktivace a transformace buněk“. Časopis EMBO. 18 (5): 1214–22. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1214. PMC 1171212. PMID 10064588.
Pomidor MM, Cimildoro R, Lazatin B, Zheng P, Gurr JA, Leigh IM a kol. (Prosinec 1999). „Fosforylovaný lidský keratinocyt ornithin dekarboxyláza je přednostně asociován s nerozpustnými buněčnými proteiny“. Molekulární biologie buňky. 10 (12): 4299–310. doi:10,1091 / mbc. 10.12.4299. PMC 25759. PMID 10588659.
Symes AJ, Eilertsen M, Millar M, Nariculam J, Freeman A, Notara M a kol. (2013). „Kvantitativní analýza nadměrné exprese proteinů BTF3, HINT1, NDRG1 a ODC1 v lidské tkáni rakoviny prostaty“. PLOS One. 8 (12): e84295. doi:10.1371 / journal.pone.0084295. PMC 3874000. PMID 24386364.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115758 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011179 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: ODC1 ornithine dekarboxyláza 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]