OCA2 - OCA2

OCA2
Identifikátory
Aliasy	OCA2, BEY, BEY1, BEY2, BOCA, D15S12, EYCL, EYCL2, EYCL3, HCL3, PED, SHEP1, OCA2 melanosomální transmembránový protein, P
Externí ID	OMIM: 611409 MGI: 97454 HomoloGene: 37281 Genové karty: OCA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	28,099,315 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	56,536,518 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transportéru; • Aktivita transmembránového transportéru L-tyrosinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• membrána endoplazmatického retikula; • lysozomální membrána; • endosomová membrána; • membrána; • cytoplazma; • melanosomová membrána; • integrální součást membrány;
Biologický proces	• proces biosyntézy očního pigmentu; • pigmentace; • vývojová pigmentace; • biosyntetický proces melaninu; • buněčná proliferace; • transmembránová doprava; • vývoj spermatidů; • diferenciace melanocytů; • transport tyrosinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4948
	18431
	ENSG00000104044; ENSG00000277361
	ENSMUSG00000030450
	Q04671
	Q62052
	NM_000275; NM_001300984
	NM_021879
	NP_000266; NP_001287913
	NP_068679
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

P protein, také známý jako transportní protein specifický pro melanocyty nebo homolog bílkovinného ředění s růžovými očima, je protein že u lidí je kódován okulokutánní albinismus II (OCA2) gen.^[5] Předpokládá se, že P protein je integrální membránový protein podílí se na transportu malých molekul, konkrétně z tyrosin - předchůdce melanin. Některé mutace v OCA2 vedou k typu 2 okulokutánní albinismus.^[5] OCA2 kóduje lidský homolog myšího genu p (růžové oči ředění).

U člověka je gen OCA2 umístěn na dlouhém (q) rameni chromozom 15 mezi pozicemi 12 a 13.1

Lidský gen OCA2 je umístěn na dlouhém rameni (q) chromozomu 15, konkrétně od páru bází 28 000 020 k páru bází 28 344 457 na chromozomu 15.

Funkce

OCA2 poskytuje pokyny pro přípravu proteinu zvaného P protein, který se nachází v melanocyty což jsou specializované buňky, které produkují melanin, a v buňkách retinální pigmentový epitel. Melanin je zodpovědný za dodávání barvy pokožce, vlasům a očím. Melanin se navíc nachází ve světle citlivé tkáni sítnice oka, která hraje roli v normálním vidění.

Přesná funkce proteinu P není známa, ale bylo zjištěno, že je nezbytná pro normální zbarvení kůže, oči, a vlasy; a pravděpodobně zapojen do melanin Výroba. Tento gen se zdá být hlavním určujícím činitelem barvy očí v závislosti na množství produkce melaninu v duhovka stroma (velké množství, které vede k hnědým očím; málo nebo žádný melanin, který vede k modrým očím).

Klinický význam

Mutace v genu OCA2 způsobují narušení normální produkce melaninu; proto způsobují problémy se zrakem a snižují barvu vlasů, kůže a očí. Okulokutánní albinismus vyvolané mutacemi v genu OCA2 okulokutánní albinismus typu 2. Prevalence OCA typu 2 se odhaduje na 1/38 000–1 / 40 000 u většiny populací po celém světě, s vyšší prevalencí u africké populace 1/3 900–1 / 1 500.^[6] Další nemoci spojené s delecí genu OCA2 jsou Angelmanov syndrom (světlé vlasy a světlá pleť) a Prader-Williho syndrom (neobvykle světlé vlasy a světlá pleť). U obou těchto syndromů se delece často vyskytuje u jedinců s jedním nebo druhým syndromem.^[7]^[8]

Mutace v HERC2 Gen sousedící s OCA2, ovlivňující expresi OCA2 v lidské duhovce, je společný téměř všem lidem s modré oči. Předpokládalo se, že všichni modrookí lidé sdílejí jednoho společného předka, s nímž mutace vznikla.^[9]^[10]^[11]

The His615Arg alela OCA2 se podílí na světlém tónu pleti a odvozená alela je omezena na východní Asii s vysokými frekvencemi, s nejvyššími frekvencemi ve východní východní Asii (49-63%), středními frekvencemi v jihovýchodní Asii a nejnižšími frekvencemi v západní Číně a některé východoevropské populace.^[12]^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000277361 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104044, ENSG00000277361 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030450 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: OCA2 oculocutaneous albinism II (homolog ředění růžových očí, myš)" ". Citováno 2015-03-12.
^ Hayashi, Masahiro; Suzuki, Tamio (duben 2013). „Okulokutánní albinismus typu 2“. Orphanet. Citováno 2014-11-09.
^ „OCA2 - okulokutánní albinismus II“. Genetics Home Reference - Váš průvodce po porozumění genetickým podmínkám. Americká národní lékařská knihovna. Citováno 30. března 2013.
^ „Nedělá ti to hnědé oči modré?“. Pochopení genetiky. Pochopení genetiky. Citováno 30. března 2013.
^ Bryner J (2008-01-31). „Tady jsou ty hnědé oči modré“. Zprávy o zdraví. Zprávy NBC. Citováno 2008-11-06.; Bryner J (2008-01-31). „Jeden společný předek za modrýma očima“. LiveScience. Imaginova Corp. Citováno 2008-11-06.; „Modrookí lidé mají jediného společného předka“. Zprávy. Kodaňská univerzita. 2008-01-30. Citováno 2008-11-06.
^ Eiberg H, Troelsen J, Nielsen M, Mikkelsen A, Mengel-From J, Kjaer KW, Hansen L (2008). „Barva modrého oka u lidí může být způsobena dokonale asociovanou zakladatelskou mutací v regulačním prvku umístěném v genu HERC2, který inhibuje expresi OCA2“. Hučení. Genet. 123 (2): 177–87. doi:10.1007 / s00439-007-0460-x. PMID 18172690. S2CID 9886658.
^ Sturm RA, Duffy DL, Zhao ZZ, Leite FP, Stark MS, Hayward NK, Martin NG, Montgomery GW (2008). „Jediný SNP v evolučně konzervované oblasti v nitru 86 genu HERC2 určuje barvu lidského modrohnědého oka“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 82 (2): 424–31. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.11.005. PMC 2427173. PMID 18252222.
^ Donnelly MP, Paschou P, Grigorenko E, Gurwitz D, Barta C, Lu RB, Zhukova OV, Kim JJ, Siniscalco M, New M, Li H, Kajuna SL, Manolopoulos VG, Speed WC, Pakstis AJ, Kidd JR, Kidd KK (2012). „Globální pohled na oblast a pigmentaci OCA2-HERC2“. Hučení. Genet. 131 (5): 683–96. doi:10.1007 / s00439-011-1110-x. PMC 3325407. PMID 22065085.
^ Edwards M, Bigham A, Tan J, Li S, Gozdzik A, Ross K, Jin L, Parra EJ (2010). „Sdružení polymorfismu OCA2 His615Arg s obsahem melaninu ve východoasijských populacích: další důkazy konvergentního vývoje pigmentace kůže“. PLOS Genet. 6 (3): e1000867. doi:10.1371 / journal.pgen.1000867. PMC 2832666. PMID 20221248.

Další čtení

Vytváření WS, King RA (1999). "Molekulární podstata albinismu: mutace a polymorfismy pigmentačních genů spojených s albinismem". Hučení. Mutat. 13 (2): 99–115. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 13: 2 <99 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-C. PMID 10094567.
Brilantní MH (2001). „Myší p (ředění s růžovými očima) a lidské P geny, okulokutánní albinismus typu 2 (OCA2) a melanosomální pH“. Pigment Cell Res. 14 (2): 86–93. doi:10.1034 / j.1600-0749.2001.140203.x. PMID 11310796.
Ramsay M, Colman MA, Stevens G, Zwane E, Kromberg J, Farrall M, Jenkins T (1992). „Lokus okulokutánního albinismu pozitivní na tyrosinázu se mapuje na chromozom 15q11.2-q12“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 51 (4): 879–84. PMC 1682821. PMID 1415228.
Gardner JM, Nakatsu Y, Gondo Y, Lee S, Lyon MF, King RA, Brilliant MH (1992). "Myší gen s růžovými očima: asociace s lidskými Prader-Williho a Angelmanovými syndromy". Věda. 257 (5073): 1121–4. Bibcode:1992Sci ... 257.1121G. doi:10.1126 / science.257.5073.1121. PMID 1509264. S2CID 5800811.
Ludowese CJ, Thompson KJ, Sekhon GS, Pauli RM (1991). "Absence předvídatelné fenotypové exprese v proximálních 15q duplikacích". Clin. Genet. 40 (3): 194–201. doi:10.1111 / j.1399-0004.1991.tb03076.x. PMID 1773534. S2CID 28419032.
Lee ST, Nicholls RD, Jong MT, Fukai K, Spritz RA (1995). "Organizace a sekvence lidského genu P a identifikace nové rodiny transportních proteinů". Genomika. 26 (2): 354–63. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80220-G. PMID 7601462.
Spritz RA, Fukai K, Holmes SA, Luande J (1995). „Častá intragenní delece genu P u tanzanských pacientů s okulokutánním albinismem typu II (OCA2)“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 56 (6): 1320–3. PMC 1801108. PMID 7762554.
Lee ST, Nicholls RD, Schnur RE, Guida LC, Lu-Kuo J, Spinner NB, Zackai EH, Spritz RA (1994). „Různorodé mutace genu P u afroameričanů s okulokutánním albinismem (OCA2) typu II (pozitivním na tyrosinázu).“ Hučení. Mol. Genet. 3 (11): 2047–51. PMID 7874125.
Durham-Pierre D, Gardner JM, Nakatsu Y, King RA, Francke U, Ching A, Aquaron R, del Marmol V, Brilliant MH (1994). „Africký původ intragenní delece lidského genu P v okulokutánním albinismu pozitivním na tyrosinázu“. Nat. Genet. 7 (2): 176–9. doi:10.1038 / ng0694-176. PMID 7920637. S2CID 6185436.
Lee ST, Nicholls RD, Bundey S, Laxova R, Musarella M, Spritz RA (1994). „Mutace genu P v okulokutánním albinismu, očním albinismu a Prader-Williho syndromu plus albinismus“. N. Engl. J. Med. 330 (8): 529–34. doi:10.1056 / NEJM199402243300803. PMID 8302318.
Rinchik EM, Bultman SJ, Horsthemke B, Lee ST, Strunk KM, Spritz RA, Avidano KM, Jong MT, Nicholls RD (1993). „Gen pro myší ředicí lokus s růžovými očima a pro lidský okulokutánní albinismus typu II“. Příroda. 361 (6407): 72–6. Bibcode:1993Natur.361 ... 72R. doi:10.1038 / 361072a0. PMID 8421497. S2CID 21794972.
Spritz RA, Lee ST, Fukai K, Brondum-Nielsen K, Chitayat D, Lipson MH, Musarella MA, Rosenmann A, Weleber RG (1997). "Nové mutace genu P u okulokutánního albinismu typu II (OCA2)". Hučení. Mutat. 10 (2): 175–7. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1997) 10: 2 <175 :: AID-HUMU12> 3.0.CO; 2-X. PMID 9259203.
Kerr R, Stevens G, Manga P, Salm S, John P, Haw T, Ramsay M (2000). „Identifikace mutací genu P u jedinců s okulokutánním albinismem v subsaharské Africe“. Hučení. Mutat. 15 (2): 166–72. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <166 :: AID-HUMU5> 3.0.CO; 2-Z. PMID 10649493.
Oetting WS, Gardner JM, Fryer JP, Ching A, Durham-Pierre D, King RA, Brilliant MH (1998). „Mutace lidského genu P spojené s okulokutánním albinismem typu II (OCA2). Stručné mutace č. 205. Online.“. Hučení. Mutat. 12 (6): 434. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 12: 6 <434 :: AID-HUMU16> 3.0.CO; 2-7. PMID 10671067.
Passmore LA, Kaesmann-Kellner B, Weber BH (1999). "Nové a rekurentní mutace v genu pro tyrosinázu a P v německé populaci albínů". Hučení. Genet. 105 (3): 200–10. doi:10,1007 / s004390051090. PMID 10987646.
Manga P, Kromberg J, Turner A, Jenkins T, Ramsay M (2001). „V jižní Africe se hnědý okulokutánní albinismus (BOCA) mapuje na lokus OCA2 na chromozomu 15q: byly identifikovány mutace P-genu“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 68 (3): 782–7. doi:10.1086/318800. PMC 1274491. PMID 11179026.
Manga P, Orlow SJ (2001). „Inverzní korelace mezi expresí zřeďovacího proteinu s růžovými očima a indukcí melanogeneze bafilomycinem A1“. Pigment Cell Res. 14 (5): 362–7. doi:10.1034 / j.1600-0749.2001.140508.x. PMID 11601658.
Toyofuku K, Valencia JC, Kushimoto T, Costin GE, Virador VM, Vieira WD, Ferrans VJ, Hearing VJ (2002). „Etiologie okulokutánního albinismu (OCA) typu II: růžový protein moduluje zpracování a transport tyrosinázy“. Pigment Cell Res. 15 (3): 217–24. doi:10.1034 / j.1600-0749.2002.02007.x. PMID 12028586.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW záznam o Okulokutánním albinismu typu 2

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000277361 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104044, ENSG00000277361 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030450 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: OCA2 oculocutaneous albinism II (homolog ředění růžových očí, myš)" ". Citováno 2015-03-12.

[6] Hayashi, Masahiro; Suzuki, Tamio (duben 2013). „Okulokutánní albinismus typu 2“. Orphanet. Citováno 2014-11-09.

[7] „OCA2 - okulokutánní albinismus II“. Genetics Home Reference - Váš průvodce po porozumění genetickým podmínkám. Americká národní lékařská knihovna. Citováno 30. března 2013.

[8] „Nedělá ti to hnědé oči modré?“. Pochopení genetiky. Pochopení genetiky. Citováno 30. března 2013.

[OCA2_blue_eyes_press-9] Bryner J (2008-01-31). „Tady jsou ty hnědé oči modré“. Zprávy o zdraví. Zprávy NBC. Citováno 2008-11-06.; Bryner J (2008-01-31). „Jeden společný předek za modrýma očima“. LiveScience. Imaginova Corp. Citováno 2008-11-06.; „Modrookí lidé mají jediného společného předka“. Zprávy. Kodaňská univerzita. 2008-01-30. Citováno 2008-11-06.

[pmid18172690-10] Eiberg H, Troelsen J, Nielsen M, Mikkelsen A, Mengel-From J, Kjaer KW, Hansen L (2008). „Barva modrého oka u lidí může být způsobena dokonale asociovanou zakladatelskou mutací v regulačním prvku umístěném v genu HERC2, který inhibuje expresi OCA2“. Hučení. Genet. 123 (2): 177–87. doi:10.1007 / s00439-007-0460-x. PMID 18172690. S2CID 9886658.

[pmid18252222-11] Sturm RA, Duffy DL, Zhao ZZ, Leite FP, Stark MS, Hayward NK, Martin NG, Montgomery GW (2008). „Jediný SNP v evolučně konzervované oblasti v nitru 86 genu HERC2 určuje barvu lidského modrohnědého oka“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 82 (2): 424–31. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.11.005. PMC 2427173. PMID 18252222.

[pmid22065085-12] Donnelly MP, Paschou P, Grigorenko E, Gurwitz D, Barta C, Lu RB, Zhukova OV, Kim JJ, Siniscalco M, New M, Li H, Kajuna SL, Manolopoulos VG, Speed WC, Pakstis AJ, Kidd JR, Kidd KK (2012). „Globální pohled na oblast a pigmentaci OCA2-HERC2“. Hučení. Genet. 131 (5): 683–96. doi:10.1007 / s00439-011-1110-x. PMC 3325407. PMID 22065085.

[Edwards_2010-13] Edwards M, Bigham A, Tan J, Li S, Gozdzik A, Ross K, Jin L, Parra EJ (2010). „Sdružení polymorfismu OCA2 His615Arg s obsahem melaninu ve východoasijských populacích: další důkazy konvergentního vývoje pigmentace kůže“. PLOS Genet. 6 (3): e1000867. doi:10.1371 / journal.pgen.1000867. PMC 2832666. PMID 20221248.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]