Nucleobindin 1 - Nucleobindin 1

NUCB1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1SNL
Identifikátory
Aliasy	NUCB1, CALNUC, NUC, nukleobindin 1
Externí ID	OMIM: 601323 MGI: 97388 HomoloGene: 4507 Genové karty: NUCB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	48,923,372 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	45,510,406 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba alfa-podjednotky G-proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • lumenální strana Golgiho membrány; • hrubé endoplazmatické retikulum; • membrána; • síť cis-Golgi; • Vezikuly spojené s Golgi; • Golgiho cisterna membrána; • extracelulární oblast; • vnější složka Golgiho membrány; • trans-Golgiho síť; • časný endosom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostor; • extracelulární; • Golgiho aparát; • lumen endoplazmatického retikula;
Biologický proces	• regulace cílení na bílkoviny; • reakce na cisplatinu; • posttranslační modifikace; • buněčný proteinový metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4924
	18220
	ENSG00000104805
	ENSMUSG00000030824
	Q02818
	Q02819
	NM_006184
	NM_001163662; NM_008749
	NP_006175
	NP_001157134; NP_032775
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nucleobindin-1 (NUCB1), také známý jako calnuc, je a protein že u lidí je kódován NUCB1 gen.^[5]^[6]

Struktura

Lidský protein calnuc obsahuje 461 aminokyselin a má pí 4,9.^[7]

Protein obsahuje následující oblasti a domén:

Signální peptid^[8]
Leucinový zip^[8] Za jeho dimerizaci může být zodpovědný leucinový zip Calnucu.
aa 347-389 - Signál pro lokalizaci jader
2 místa vázající zinek^[9] s vysokou afinitou (K._d = 20 nM)
karboxypeptidáza podobné motivy: HFREXnH (aa 66) a HFTEXnH (aa 146)
2 EF ruce
Potenciální oblast ukotvení^[7]- 15-aa hydrofobní oblast na jejím konci COOH, která může být dostatečná pro zakotvení membrány

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104805 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030824 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Miura K, Hirai M, Kanai Y, Kurosawa Y (únor 1997). "Organizace lidského genu pro nukleobindin (NUC) a jeho chromozomální přiřazení k 19q13.2-q13.4". Genomika. 34 (2): 181–6. doi:10.1006 / geno.1996.0263. PMID 8661046.
^ „Entrezův gen: NUCB1 nukleobindin 1“.
^ ^A ^b Lin P, Le-Niculescu H, Hofmeister R, McCaffery JM, Jin M, Hennemann H, McQuistan T, De Vries L, Farquhar MG (červen 1998). „Savčí protein vázající vápník, nukleobindin (CALNUC), je Golgiho rezidentním proteinem“. J. Cell Biol. 141 (7): 1515–27. doi:10.1083 / jcb.141.7.1515. PMC 2132997. PMID 9647645.
^ ^A ^b Miura K, Titani K, Kurosawa Y, Kanai Y (srpen 1992). „Molekulární klonování nukleobindinu, nového proteinu vázajícího DNA, který obsahuje signální peptid i strukturu leucinového zipu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 187 (1): 375–80. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 81503-7. PMID 1520323.
^ Kanuru M, Raman R, Aradhyam GK (leden 2013). "Aktivita serinové proteázy u kalnuku: regulace pomocí Zn2 + a G proteinů". J. Biol. Chem. 288 (3): 1762–73. doi:10.1074 / jbc.M112.382846. PMC 3548486. PMID 23195954.

Další čtení

Miura K, Titani K, Kurosawa Y, Kanai Y (1992). „Molekulární klonování nukleobindinu, nového proteinu vázajícího DNA, který obsahuje signální peptid i strukturu leucinového zipu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 187 (1): 375–80. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 81503-7. PMID 1520323.
Mochizuki N, Hibi M, Kanai Y, Insel PA (1995). "Interakce proteinového nukleobindinu s G alfa i2, jak odhalil kvasinkový dvouhybridní systém". FEBS Lett. 373 (2): 155–8. doi:10.1016/0014-5793(95)01031-9. PMID 7589456. S2CID 84629575.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ballif BA, Mincek NV, Barratt JT a kol. (1996). „Interakce cyklooxygenáz s proteinem spojeným s apoptózou a autoimunitou“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (11): 5544–9. doi:10.1073 / pnas.93.11.5544. PMC 39283. PMID 8643612.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kubota T, Miyauchi M, Miura K a kol. (1998). "Upregulace exprese nukleobindinu v lidsky aktivovaných lymfocytech a non-Hodgkinově lymfomu". Pathol. Int. 48 (1): 22–8. doi:10.1111 / j.1440-1827.1998.tb03823.x. PMID 9589460.
Lin P, Le-Niculescu H, Hofmeister R a kol. (1998). „Savčí protein vázající vápník, nukleobindin (CALNUC), je Golgiho rezidentním proteinem“. J. Cell Biol. 141 (7): 1515–27. doi:10.1083 / jcb.141.7.1515. PMC 2132997. PMID 9647645.
Taniguchi N, Taniura H, Niinobe M a kol. (2000). „Postmitotický růstový supresor necdin interaguje s proteinem vázajícím vápník (NEFA) v neuronální cytoplazmě“. J. Biol. Chem. 275 (41): 31674–81. doi:10,1074 / jbc.M005103200. PMID 10915798.
Weiss TS, Chamberlain CE, Takeda T a kol. (2002). „Vazba Galpha i3 na kalkulek na Golgiho membránách v živých buňkách monitorována přenosem fluorescenční rezonanční energie zelených fluorescenčních proteinových fúzních proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (26): 14961–6. doi:10.1073 / pnas.261572098. PMC 64966. PMID 11752444.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
de Alba E, Tjandra N (2004). "Strukturální studie na doméně vázající Ca2 + lidského nukleobindinu (calnuc)". Biochemie. 43 (31): 10039–49. doi:10.1021 / bi049310a. PMID 15287731.
Breuza L, Halbeisen R, Jenö P a kol. (2004). „Proteomika membrán endoplazmatického retikula-Golgiho meziprostoru (ERGIC) z buněk HepG2 ošetřených brefeldinem A identifikuje ERGIC-32, nový cyklický protein, který interaguje s lidským Erv46.“. J. Biol. Chem. 279 (45): 47242–53. doi:10,1074 / jbc.M406644200. PMID 15308636.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Chen Y, Lin P, Qiu S a kol. (2007). „Autoprotilátky proti Ca2 + vázajícímu proteinu Calnuc je potenciálním markerem při detekci rakoviny tlustého střeva“ (PDF). Int. J. Oncol. 30 (5): 1137–44. doi:10,3892 / ijo.30.5.1137. PMID 17390015.
Tsukumo Y, Tomida A, Kitahara O a kol. (2007). „Nucleobindin 1 řídí rozvinutou proteinovou reakci inhibicí aktivace ATF6“. J. Biol. Chem. 282 (40): 29264–72. doi:10,1074 / jbc.M705038200. PMID 17686766.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104805 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030824 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8661046-5] Miura K, Hirai M, Kanai Y, Kurosawa Y (únor 1997). "Organizace lidského genu pro nukleobindin (NUC) a jeho chromozomální přiřazení k 19q13.2-q13.4". Genomika. 34 (2): 181–6. doi:10.1006 / geno.1996.0263. PMID 8661046.

[entrez-6] „Entrezův gen: NUCB1 nukleobindin 1“.

[pmid9647645-7] A ^b Lin P, Le-Niculescu H, Hofmeister R, McCaffery JM, Jin M, Hennemann H, McQuistan T, De Vries L, Farquhar MG (červen 1998). „Savčí protein vázající vápník, nukleobindin (CALNUC), je Golgiho rezidentním proteinem“. J. Cell Biol. 141 (7): 1515–27. doi:10.1083 / jcb.141.7.1515. PMC 2132997. PMID 9647645.

[pmid1520323-8] A ^b Miura K, Titani K, Kurosawa Y, Kanai Y (srpen 1992). „Molekulární klonování nukleobindinu, nového proteinu vázajícího DNA, který obsahuje signální peptid i strukturu leucinového zipu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 187 (1): 375–80. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 81503-7. PMID 1520323.

[pmid23195954-9] Kanuru M, Raman R, Aradhyam GK (leden 2013). "Aktivita serinové proteázy u kalnuku: regulace pomocí Zn2 + a G proteinů". J. Biol. Chem. 288 (3): 1762–73. doi:10.1074 / jbc.M112.382846. PMC 3548486. PMID 23195954.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]