NDRG2 - NDRG2

NDRG2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XMQ, 2XMR, 2XMS
Identifikátory
Aliasy	NDRG2, SYLD, člen rodiny NDRG 2
Externí ID	OMIM: 605272 MGI: 1352498 HomoloGene: 22785 Genové karty: NDRG2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	21,070,872 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	51,913,488 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• růstový kužel; • buněčné jádro; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • cytosol; • extracelulární exosom; • cytoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace proliferace buněk hladkého svalstva; • regulace produkce vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • negativní regulace produkce cytokinů; • vývoj nervového systému; • vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk; • vývoj substantia nigra; • Wnt signální cesta; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • regulace produkce růstového faktoru odvozeného z krevních destiček; • signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57447
	29811
	ENSG00000165795
	ENSMUSG00000004558
	Q9UN36
	Q9QYG0
NM_001282211; NM_001282212; NM_001282213; NM_001282214; NM_001282215;
	NM_001282216; NM_016250; NM_201535; NM_201536; NM_201537; NM_201538; NM_201539; NM_201540; NM_201541; NM_001320329; NM_001354559; NM_001354562; NM_001354566; NM_001354567; NM_001354568; NM_001354569; NM_001354570; NM_001354558; NM_001354560; NM_001354561; NM_001354564; NM_001354565
	NM_001145959; NM_013864
NP_001269140; NP_001269141; NP_001269142; NP_001269143; NP_001269144;
	NP_001269145; NP_001307258; NP_057334; NP_963293; NP_963294; NP_963831; NP_963832; NP_963833; NP_963834; NP_963835; NP_001341488; NP_001341491; NP_001341495; NP_001341496; NP_001341497; NP_001341498; NP_001341499; NP_001341487; NP_001341489; NP_001341490; NP_001341493; NP_001341494
NP_001139431; NP_038892; NP_001347193; NP_001347194; NP_001347195;
	NP_001347196; NP_001347197; NP_001347198; NP_001347199; NP_001347200; NP_001347201; NP_001347202; NP_001347203; NP_001347205
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein NDRG2 je protein že u lidí je kódován NDRG2 gen (NMYC downstream regulovaný gen 2).^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je členem N-myc downregulovaná genová rodina, která patří do alfa / beta hydroláza nadčeleď. Protein kódovaný tímto genem je a cytoplazmatický protein, který může hrát roli v neurit růst. Tento gen může být součástí glioblastom a agresivní meningiom karcinogeneze (prostřednictvím buněčné proliferace^[7]).^[8] Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu tohoto genu, ale povaha celé délky některých z těchto variant nebyla stanovena.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165795 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004558 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kalaydjieva L, Gresham D, Gooding R, Heather L, Baas F, de Jonge R, Blechschmidt K, Angelicheva D, Chandler D, Worsley P, Rosenthal A, King RH, Thomas PK (srpen 2000). "N-myc downstream regulovaný gen 1 je mutován v dědičné motorické a senzorické neuropatii-Lom". Jsem J Hum Genet. 67 (1): 47–58. doi:10.1086/302978. PMC 1287101. PMID 10831399.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NDRG2 NDRG family member 2“.
^ Deng Y, Yao L, Chau L, Ng SS, Peng Y, Liu X, Au WS, Wang J, Li F, Ji S, Han H, Nie X, Li Q, Kung HF, Leung SY, Lin MC (září 2003 ). „N-Myc downstream-regulovaný gen 2 (NDRG2) inhibuje proliferaci glioblastomových buněk“. Int. J. Cancer. 106 (3): 342–7. doi:10.1002 / ijc.11228. PMID 12845671.
^ Lusis EA, Watson MA, Chicoine MR, Lyman M, Roerig P, Reifenberger G, Gutmann DH, Perry A (srpen 2005). „Integrativní genomová analýza identifikuje NDRG2 jako kandidátský tumor supresorový gen často inaktivovaný v klinicky agresivním meningiomu“. Cancer Res. 65 (16): 7121–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0043. PMID 16103061.

Další čtení

Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (5): 337–45. doi:10.1093 / dnares / 6.5.337. PMID 10574462.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Zhou RH, Kokame K, Tsukamoto Y a kol. (2001). „Charakterizace rodiny lidských genů NDRG: nově identifikovaný člen, NDRG4, je specificky exprimován v mozku a srdci“. Genomika. 73 (1): 86–97. doi:10,1006 / geno.2000.6496. PMID 11352569.
Qu X, Zhai Y, Wei H a kol. (2002). „Charakterizace a exprese tří nových genů souvisejících s diferenciací patří do rodiny genů lidských NDRG.“ Mol. Buňka. Biochem. 229 (1–2): 35–44. doi:10.1023 / A: 1017934810825. PMID 11936845.
Ohki T, Hongo S, Nakada N a kol. (2002). „Inhibice růstu neuritů sníženou hladinou NDRG4 proteinu v antisense transfekovaných buňkách PC12“. Brain Res. Dev. Brain Res. 135 (1–2): 55–63. doi:10.1016 / S0165-3806 (02) 00300-0. PMID 11978393.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Deng Y, Yao L, Chau L a kol. (2003). „N-Myc downstream-regulovaný gen 2 (NDRG2) inhibuje proliferaci glioblastomových buněk“. Int. J. Cancer. 106 (3): 342–7. doi:10.1002 / ijc.11228. PMID 12845671.
Choi SC, Kim KD, Kim JT a kol. (2003). "Exprese a regulace NDRG2 (N-myc downstream regulovaný gen 2) během diferenciace dendritických buněk". FEBS Lett. 553 (3): 413–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 01030-5. PMID 14572661.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Devroe E, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Silver PA (2004). „Lidské proteiny Mob regulují serin-threonin kinázy NDR1 a NDR2“. J. Biol. Chem. 279 (23): 24444–51. doi:10,1074 / jbc.M401999200. PMID 15067004.
Mitchelmore C, Büchmann-Møller S, Rask L a kol. (2004). „NDRG2: nový protein spojený s Alzheimerovou chorobou“. Neurobiol. Dis. 16 (1): 48–58. doi:10.1016 / j.nbd.2004.01.003. PMID 15207261.
Murray JT, Campbell DG, Morrice N a kol. (2005). „Využití KESTRELU k identifikaci členů rodiny NDRG jako fyziologických substrátů pro SGK1 a GSK3“. Biochem. J. 384 (Pt 3): 477–88. doi:10.1042 / BJ20041057. PMC 1134133. PMID 15461589.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Hu XL, Liu XP, Lin SX a kol. (2005). „Exprese a mutace NDRG2 u lidských nádorů jater a pankreatu“. Svět J. Gastroenterol. 10 (23): 3518–21. doi:10,3748 / wjg.v10.i23.3518. PMC 4576239. PMID 15526377.
Devroe E, Silver PA, Engelman A (2005). „HIV-1 zahrnuje a proteolyticky zpracovává lidské NDR1 a NDR2 serin-threoninkinázy“. Virologie. 331 (1): 181–9. doi:10.1016 / j.virol.2004.10.023. PMID 15582665.
Amente S, Napolitano G, Licciardo P a kol. (2005). „Identifikace proteinů interagujících s RNAPII FCP1 fosfatázou: FCP1 tvoří komplex s argininmethyltransferázou PRMT5 a je substrátem pro methylaci zprostředkovanou PRMT5“. FEBS Lett. 579 (3): 683–9. doi:10.1016 / j.febslet.2004.12.045. PMID 15670829.
Lusis EA, Watson MA, Chicoine MR a kol. (2005). „Integrativní genomová analýza identifikuje NDRG2 jako kandidátský tumor supresorový gen často inaktivovaný v klinicky agresivním meningiomu“. Cancer Res. 65 (16): 7121–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0043. PMID 16103061.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165795 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004558 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10831399-5] Kalaydjieva L, Gresham D, Gooding R, Heather L, Baas F, de Jonge R, Blechschmidt K, Angelicheva D, Chandler D, Worsley P, Rosenthal A, King RH, Thomas PK (srpen 2000). "N-myc downstream regulovaný gen 1 je mutován v dědičné motorické a senzorické neuropatii-Lom". Jsem J Hum Genet. 67 (1): 47–58. doi:10.1086/302978. PMC 1287101. PMID 10831399.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: NDRG2 NDRG family member 2“.

[pmid12845671-7] Deng Y, Yao L, Chau L, Ng SS, Peng Y, Liu X, Au WS, Wang J, Li F, Ji S, Han H, Nie X, Li Q, Kung HF, Leung SY, Lin MC (září 2003 ). „N-Myc downstream-regulovaný gen 2 (NDRG2) inhibuje proliferaci glioblastomových buněk“. Int. J. Cancer. 106 (3): 342–7. doi:10.1002 / ijc.11228. PMID 12845671.

[pmid16103061-8] Lusis EA, Watson MA, Chicoine MR, Lyman M, Roerig P, Reifenberger G, Gutmann DH, Perry A (srpen 2005). „Integrativní genomová analýza identifikuje NDRG2 jako kandidátský tumor supresorový gen často inaktivovaný v klinicky agresivním meningiomu“. Cancer Res. 65 (16): 7121–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0043. PMID 16103061.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]