NDN (gen) - NDN (gene) - Wikipedia

NDN
Identifikátory
Aliasy	NDN, HsT16328, PWCR, necdin, člen rodiny MAGE
Externí ID	OMIM: 602117 MGI: 97290 HomoloGene: 20559 Genové karty: NDN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	23,687,305 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba gama-tubulinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perikaryon; • centrosome; • buněčná projekce; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• proces dýchacího systému; • genetický otisk; • signální dráha receptoru neurotrofinu TRK; • regulace transkripce, DNA-šablony; • axonogeneze; • vývoj neuronů; • migrace neuronů; • mnohobuněčná homeostáza organismu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • post-embryonální vývoj; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • respirační plynná výměna; • vývoj centrálního nervového systému; • prodloužení axonu; • nocicepce; • regulace růstu; • axonální fasciculace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace buněčné proliferace; • migrace gliových buněk; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4692
	17984
	ENSG00000182636
	ENSMUSG00000033585
	Q99608
	P25233
	NM_002487
	NM_010882
	NP_002478
	NP_035012
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Necdin je protein že u lidí je kódován NDN gen.^[4]^[5]

Funkce

Tento intronless gen se nachází v Prader-Williho syndrom (PWS) oblast odstranění. Je to otisknutý gen a je exprimován výhradně z otcovské alely. Studie na myších naznačují, že protein kódovaný tímto genem může potlačovat růst v postmitotických neuronech.^[5]

Necdin se používá ke stimulaci regulace růstu a regulace transkripce závislé na DNA.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že NDN (gen) komunikovat s:

E2F1,^[7]^[8]
HNRNPU,^[9]
IL1A,^[10]
Receptor nervového růstového faktoru s nízkou afinitou,^[8]^[11]^[12]
NUCB2,^[13] a
P53^[14]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182636 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ MacDonald HR, Wevrick R (leden 1998). „Gen necdin je odstraněn u Prader-Williho syndromu a je potištěn u člověka a myši“. Hum Mol Genet. 6 (11): 1873–8. doi:10,1093 / hmg / 6.11.1873. PMID 9302265.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NDN necdin homolog (myš)“.
^ Uniprot
^ Taniura H, Taniguchi N, Hara M, Yoshikawa K (leden 1998). „Necdin, postmitotický neuronový růstový supresor, interaguje s virovými transformujícími proteiny a buněčným transkripčním faktorem E2F1“. J. Biol. Chem. 273 (2): 720–8. doi:10.1074 / jbc.273.2.720. PMID 9422723.
^ ^A ^b Kuwako K, Taniura H, Yoshikawa K (leden 2004). „Proteiny MAGE související s necdinem rozdílně interagují s transkripčním faktorem E2F1 a neurotropinovým receptorem p75“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1703–12. doi:10,1074 / jbc.M308454200. PMID 14593116.
^ Taniura H, Yoshikawa K (2002). "Necdin interaguje s ribonukleoproteinem hnRNP U v jaderné matrici". J. Cell. Biochem. 84 (3): 545–55. doi:10.1002 / jcb.10047. PMID 11813259.
^ Hu B, Wang S, Zhang Y, Feghali CA, Dingman JR, Wright TM (srpen 2003). „Jaderný cíl pro interleukin-1alfa: interakce s necdinem potlačujícím růst moduluje proliferaci a expresi kolagenu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (17): 10008–13. Bibcode:2003PNAS..10010008H. doi:10.1073 / pnas.1737765100. PMC 187743. PMID 12913118.
^ Bronfman FC, Tcherpakov M, Jovin TM, Fainzilber M (duben 2003). „Ligandem indukovaná internalizace neurotrofinového receptoru p75: pomalá cesta k signálnímu endosomu“. J. Neurosci. 23 (8): 3209–20. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-08-03209.2003. PMC 6742322. PMID 12716928.
^ Tcherpakov M, Bronfman FC, Conticello SG, Vaskovsky A, Levy Z, Niinobe M, Yoshikawa K, Arenas E, Fainzilber M (prosinec 2002). „Neurotropinový receptor p75 interaguje s více proteiny MAGE“. J. Biol. Chem. 277 (51): 49101–4. doi:10.1074 / jbc.C200533200. PMID 12414813.
^ Taniguchi N, Taniura H, Niinobe M, Takayama C, Tominaga-Yoshino K, Ogura A, Yoshikawa K (říjen 2000). „Postmitotický růstový supresor necdin interaguje s proteinem vázajícím vápník (NEFA) v neuronální cytoplazmě“. J. Biol. Chem. 275 (41): 31674–81. doi:10,1074 / jbc.M005103200. PMID 10915798.
^ Taniura H, Matsumoto K, Yoshikawa K (červen 1999). "Fyzické a funkční interakce neuronového růstově potlačujícího necdinu s p53". J. Biol. Chem. 274 (23): 16242–8. doi:10.1074 / jbc.274.23.16242. PMID 10347180.

Další čtení

Aizawa T, Marujama K, Kondo H, Yoshikawa K (1992). "Exprese necdinu, embryonálního karcinomu odvozeného jaderného proteinu, při vývoji myšího mozku". Brain Res. Dev. Brain Res. 68 (2): 265–74. doi:10.1016/0165-3806(92)90069-9. PMID 1394972.
Jay P, Rougeulle C, Massacrier A, Moncla A, Mattei MG, Malzac P, Roëckel N, Taviaux S, Lefranc JL, Cau P, Berta P, Lalande M, Muscatelli F (1997). „Lidský necdinový gen, NDN, je mateřsky otisknut a nachází se v chromozomální oblasti Prader-Williho syndromu“. Nat. Genet. 17 (3): 357–61. doi:10.1038 / ng1197-357. PMID 9354807.
Taniura H, Taniguchi N, Hara M, Yoshikawa K (1998). „Necdin, postmitotický neuronový růstový supresor, interaguje s virovými transformujícími proteiny a buněčným transkripčním faktorem E2F1“. J. Biol. Chem. 273 (2): 720–8. doi:10.1074 / jbc.273.2.720. PMID 9422723.
Nakada Y, Taniura H, Uetsuki T, Inazawa J, Yoshikawa K (1998). „Lidský chromozomální gen pro necdin, potlačující růst neuronů, v oblasti delece Prader-Williho syndromu“. Gen. 213 (1–2): 65–72. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00206-6. PMID 9630521.
Taniura H, Matsumoto K, Yoshikawa K (1999). "Fyzické a funkční interakce neuronového růstově potlačujícího necdinu s p53". J. Biol. Chem. 274 (23): 16242–8. doi:10.1074 / jbc.274.23.16242. PMID 10347180.
Taniguchi N, Taniura H, Niinobe M, Takayama C, Tominaga-Yoshino K, Ogura A, Yoshikawa K (2000). „Postmitotický růstový supresor necdin interaguje s proteinem vázajícím vápník (NEFA) v neuronální cytoplazmě“. J. Biol. Chem. 275 (41): 31674–81. doi:10,1074 / jbc.M005103200. PMID 10915798.
Niinobe M, Koyama K, Yoshikawa K (2000). "Buněčná a subcelulární lokalizace necdinu ve fetálním a dospělém myším mozku". Dev. Neurosci. 22 (4): 310–9. doi:10.1159/000017455. PMID 10965153.
Taniura H, Yoshikawa K (2002). "Necdin interaguje s ribonukleoproteinem hnRNP U v jaderné matrici". J. Cell. Biochem. 84 (3): 545–55. doi:10.1002 / jcb.10047. PMID 11813259.
Sasaki A, Masuda Y, Iwai K, Ikeda K, Watanabe K (2002). „Prstový prsten RING Praja1 reguluje transkripci závislou na Dlx5 prostřednictvím své aktivity ubikvitinové ligázy pro protein rodiny MAGE / Necdin interagující s Dlx / Msx, Dlxin-1“. J. Biol. Chem. 277 (25): 22541–6. doi:10,1074 / jbc.M109728200. PMID 11959851.
Kobayashi M, Taniura H, Yoshikawa K (2003). „Ektopická exprese necdinu indukuje diferenciaci buněk myšího neuroblastomu“. J. Biol. Chem. 277 (44): 42128–35. doi:10,1074 / jbc.M205024200. PMID 12198120.
Tcherpakov M, Bronfman FC, Conticello SG, Vaskovsky A, Levy Z, Niinobe M, Yoshikawa K, Arenas E, Fainzilber M (2003). „Neurotropinový receptor p75 interaguje s více proteiny MAGE“. J. Biol. Chem. 277 (51): 49101–4. doi:10.1074 / jbc.C200533200. PMID 12414813.
Bronfman FC, Tcherpakov M, Jovin TM, Fainzilber M (2003). „Ligandem indukovaná internalizace neurotrofinového receptoru p75: pomalá cesta k signálnímu endosomu“. J. Neurosci. 23 (8): 3209–20. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-08-03209.2003. PMID 12716928.
Hu B, Wang S, Zhang Y, Feghali CA, Dingman JR, Wright TM (2003). „Jaderný cíl pro interleukin-1alfa: interakce s necdinem potlačujícím růst moduluje proliferaci a expresi kolagenu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (17): 10008–13. Bibcode:2003PNAS..10010008H. doi:10.1073 / pnas.1737765100. PMC 187743. PMID 12913118.
Kuwako K, Taniura H, Yoshikawa K (2004). „Proteiny MAGE související s necdinem rozdílně interagují s transkripčním faktorem E2F1 a neurotropinovým receptorem p75“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1703–12. doi:10,1074 / jbc.M308454200. PMID 14593116.
Lau JC, Hanel ML, Wevrick R (2004). "Tkáňově specifické a potištěné epigenetické modifikace lidského genu NDN". Nucleic Acids Res. 32 (11): 3376–82. doi:10.1093 / nar / gkh671. PMC 443546. PMID 15247330.
Moon HE, Ahn MY, Park JA, Min KJ, Kwon YW, Kim KW (2005). "Negativní regulace hypoxií indukovatelného faktoru-1alfa necdinem". FEBS Lett. 579 (17): 3797–801. doi:10.1016 / j.febslet.2005.05.072. PMID 15978586.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182636 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9302265-4] MacDonald HR, Wevrick R (leden 1998). „Gen necdin je odstraněn u Prader-Williho syndromu a je potištěn u člověka a myši“. Hum Mol Genet. 6 (11): 1873–8. doi:10,1093 / hmg / 6.11.1873. PMID 9302265.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: NDN necdin homolog (myš)“.

[6] Uniprot

[pmid9422723-7] Taniura H, Taniguchi N, Hara M, Yoshikawa K (leden 1998). „Necdin, postmitotický neuronový růstový supresor, interaguje s virovými transformujícími proteiny a buněčným transkripčním faktorem E2F1“. J. Biol. Chem. 273 (2): 720–8. doi:10.1074 / jbc.273.2.720. PMID 9422723.

[pmid14593116-8] A ^b Kuwako K, Taniura H, Yoshikawa K (leden 2004). „Proteiny MAGE související s necdinem rozdílně interagují s transkripčním faktorem E2F1 a neurotropinovým receptorem p75“. J. Biol. Chem. 279 (3): 1703–12. doi:10,1074 / jbc.M308454200. PMID 14593116.

[pmid11813259-9] Taniura H, Yoshikawa K (2002). "Necdin interaguje s ribonukleoproteinem hnRNP U v jaderné matrici". J. Cell. Biochem. 84 (3): 545–55. doi:10.1002 / jcb.10047. PMID 11813259.

[pmid12913118-10] Hu B, Wang S, Zhang Y, Feghali CA, Dingman JR, Wright TM (srpen 2003). „Jaderný cíl pro interleukin-1alfa: interakce s necdinem potlačujícím růst moduluje proliferaci a expresi kolagenu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (17): 10008–13. Bibcode:2003PNAS..10010008H. doi:10.1073 / pnas.1737765100. PMC 187743. PMID 12913118.

[pmid12716928-11] Bronfman FC, Tcherpakov M, Jovin TM, Fainzilber M (duben 2003). „Ligandem indukovaná internalizace neurotrofinového receptoru p75: pomalá cesta k signálnímu endosomu“. J. Neurosci. 23 (8): 3209–20. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-08-03209.2003. PMC 6742322. PMID 12716928.

[pmid12414813-12] Tcherpakov M, Bronfman FC, Conticello SG, Vaskovsky A, Levy Z, Niinobe M, Yoshikawa K, Arenas E, Fainzilber M (prosinec 2002). „Neurotropinový receptor p75 interaguje s více proteiny MAGE“. J. Biol. Chem. 277 (51): 49101–4. doi:10.1074 / jbc.C200533200. PMID 12414813.

[pmid10915798-13] Taniguchi N, Taniura H, Niinobe M, Takayama C, Tominaga-Yoshino K, Ogura A, Yoshikawa K (říjen 2000). „Postmitotický růstový supresor necdin interaguje s proteinem vázajícím vápník (NEFA) v neuronální cytoplazmě“. J. Biol. Chem. 275 (41): 31674–81. doi:10,1074 / jbc.M005103200. PMID 10915798.

[pmid10347180-14] Taniura H, Matsumoto K, Yoshikawa K (červen 1999). "Fyzické a funkční interakce neuronového růstově potlačujícího necdinu s p53". J. Biol. Chem. 274 (23): 16242–8. doi:10.1074 / jbc.274.23.16242. PMID 10347180.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]