Methylophaga muralis - Methylophaga muralis

Methylophaga muralis
Vědecká klasifikace Upravit
Doména:Bakterie
Kmen:Proteobakterie
Třída:Gammaproteobakterie
Objednat:Thiotrichales
Rodina:Piscirickettsiaceae
Rod:Methylophaga
Druh:
M. muralis
Binomické jméno
Methylophaga muralis
Doronina et al., 2011[1]
Typ kmene
Kr3
VKM B-2303
NCIMB 13993
Synonyma
  • Methylophaga murata Doronina a kol. 2005[2]

Methylophaga muralis je druh Proteobakterie. Je schopen přežít v solný a zásaditý prostředí a může získávat svůj uhlík z methanolu. Tento druh byl původně objeven v rozpadajícím se mramoru v Moskevský Kreml; bylo také nalezeno v a sodové jezero v Buryatia.

Taxonomická historie a etymologie

Tento druh byl objeven v odřezcích ze zhoršujících se mramorových pomníků v kryptách Moskevský Kreml.[2][3] Původně byl pojmenován M. murata v roce 2005 popis druhu podle Ruská akademie věd mikrobiolog Jurij Alexandrovič Trotsenko [ru ] a kolegové,[2] ale v roce 2011 byla přejmenována na M. muralis.[1][4] The kmen typu, Kr3, byl uložen v Celo Ruská sbírka mikroorganismů (VKM) a Národní sbírka průmyslových a mořských bakterií (NCIMB) kulturní sbírky.[2]

Specifické epiteton muralis je latinské adjektivum s významem „ze zdi nebo ze zdi“.[1][5] Jeho původní specifický epiteton, murata, znamená „obklopen zdmi“.[6]

Rozšíření a stanoviště

Typový kmen Kr3 byl extrahován v Moskvě z mramoru pomocí pH ze dne 9.1.[2] M. muralis je příkladem endolit, být schopen žít na skále.[7] Další kmen, pojmenovaný Bur 1, byl izolován z a sodové jezero v Khilganta [ru ], Buryatia, Rusko.[8][9]

Bakterie rostou při teplotách 0–42 ° C (32–108 ° F), pH 6–11 a chlorid sodný koncentrace 0,05–3 mol na litr; optimálním stanovištěm je teplota 20–32 ° C (68–90 ° F), pH 8–9 a koncentrace chloridu sodného 0,5–1,5 mol / l. Může přežít zahřátí na 70 ° C (158 ° F), zmrazení nebo bytí lyofilizované. Jelikož je tento druh přizpůsoben fyziologickému a alkalickému prostředí, je považován za obojí halofilní a alkalifilní.[2]

Popis a biologie

M. muralis buňky jsou ve tvaru tyče, se šířkou 0,7 µm a délku 1,7–2,0 µm. Každá buňka má a bičík na jednom z jeho pólů.[2]

Tento druh je methylotrofní, což znamená, že může využívat uhlík z molekul s jedním uhlíkem methanolu a methylamin, ačkoli také získává uhlík z trimethylamin, a fruktóza. Je to aerobní organismus; kromě toho, že vyžaduje kyslík, potřebuje také vitamin B12 a sodík ionty rostou. to je gramnegativní, jako všichni Proteobakterie. Reprodukce probíhá prostřednictvím binární dělení; nedělá to výtrusy.[2]

Jeho hlavní mastné kyseliny jsou kyselina palmitová, kyselina palmitolejová, a kyselina oktadekanová. Hlavní fosfolipidy jsou fosfatidylethanolamin, fosfatidylglycerol, a kardiolipin.[2] Ektoin, glutamát, a v menší míře sacharóza chovat se jako osmoprotektory.[2]

Fylogeneze

Plymouth University mikrobiolog Rich Boden pomocí Model Tamura – Nei, argumentoval na základě 16S ribozomální RNA že M. muralis, M. alcalica, a M. lonarensis tvoří a clade s vyloučením ostatních Methylophaga druhy včetně druh druhu rodu, M. marina.[10] V roce 2013, INRS mikrobiolog Richard Villemur a kolegové přidali své nově popsané druhy M. nitratireducenticrescens a M. frappieri k tomuto kladu také na základě analýzy 16S rRNA.[11] Všechny druhy v této kladu jsou alkalifilní.[10][11]

Reference

  1. ^ A b C Euzéby, Jean, ed. (2011). "Validační seznam č. 138: Seznam nových jmen a nových kombinací dříve účinně, ale neplatně, zveřejněn". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (3): 475–476. doi:10.1099 / ijs.0.032003-0.
  2. ^ A b C d E F G h i j Doronina, N. V .; Lee, Ts. D .; Ivanova, E. G .; Trotsenko, Yu. A. (2005). "Methylophaga murata sp. listopad: Haloalkalifilní aerobní methylotrof z kazícího se mramoru “. Mikrobiologie. 74 (4): 440–447. doi:10.1007 / s11021-005-0086-8.
  3. ^ Trotsenko, Yu. A.; Doronina, N. V .; Li, Ts. D .; Reshetnikov, A. S. (2007). "Mírně haloalkalifilní aerobní methylobakterie". Mikrobiologie. 76 (3): 253–265. doi:10.1134 / S0026261707030010.
  4. ^ Boden, Rich (2017). „Redakce: Správcovství - ve chvále za nevděčné úkoly a respektování Wombles“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 364 (5): fnx041. doi:10.1093 / femsle / fnx041.
  5. ^ Lewis, Charlton T .; Krátký, Charles (1879). "mūrālis". Latinský slovník. New York: Harper & Brothers. str. 1177.
  6. ^ Glare, P. G. W .; et al., eds. (1968). "mūrātus". Oxfordský latinský slovník. Oxford University Press. str. 1147.
  7. ^ Banciu, Horia Leonard (2013). „Rozmanitost endolitických prokaryot žijících v kamenných památkách“ (PDF). Studia Universitatis Babeș-Bolyai, Biologia. 58 (1): 104–105. doi:10.5038/1937-8602.58.1. Archivováno (PDF) z původního dne 19. listopadu 2017.
  8. ^ Trotsenko, Yuri A .; Shmareva, Maria N .; Doronina, Nina V .; Tarlachkov, Sergey V .; Mustakhimov, Ildar I .; Vasilenko, Oleg V. (2016). "Návrh sekvence genomu Methylophaga muralis Bur 1, haloalkalifilický (nevyužívající metan) methylotrof izolovaný ze sódového jezera ". Oznámení o genomu. 4 (6): e01227-16. doi:10.1128 / genomA.01227-16.
  9. ^ Shmareva, M. N .; Doronina, N. V .; Tarlachkov, S. V .; Vasilenko, O. V .; Trotsenko, Yu. A. (2018). "Methylophaga muralis Bur 1, haloalkalifilní methylotrof izolovaný od sódového jezera Khilganta (Jižní Transbaikalia, Burjatská republika) ". Mikrobiologie. 87 (1): 33–46. doi:10.1134 / S0026261718010162.
  10. ^ A b Boden, Rich (2011). „Upravený popis rodu Methylophaga Janvier a kol. 1985 ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (7): 1644–1646. doi:10.1099 / ijs.0.033639-0. PMID  21890722.
  11. ^ A b Villeneuve, Céline; Martineau, Christine; Mauffrey, Florian; Villemur, Richard (2013). "Methylophaga nitratireducenticrescens sp. listopad. a Methylophaga frappieri sp. nov., izolovaný z biofilmu methanolového denitrifikačního systému upravujícího mořskou vodu v Montrealském biodomu “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 63 (6): 2216–2222. doi:10.1099 / ijs.0.044545-0.

externí odkazy

Další čtení

  • Doronina, N. V .; Torgonskaya, M. L .; Fedorov, D. N .; Trotsenko, Yu. A. (2015). „Aerobní methylobakterie jako slibné objekty moderní biotechnologie (recenze)“. Aplikovaná biochemie a mikrobiologie. 51 (2): 125–134. doi:10.1134 / S0003683815020052.