Marc Wilkins (genetik) - Marc Wilkins (geneticist)

Marc R. Wilkins
NárodnostAustrálie
Alma materMacquarie University
Známý jakoproteom
Vědecká kariéra
InstituceUniversity of New South Wales
Doktorský poradceKeith Williams
VlivyDenis Hochstrasser,Amos Bairoch

Marc R. Wilkins je australský vědec, který se zasloužil o definici pojmu proteom.[1] Wilkins je profesorem na School of Biotechnology and Biomolecular Sciences at the University of New South Wales, Sydney.

Wilkins vytvořil termín proteom v roce 1994, zatímco rozvíjel koncept jako doktorand na Macquarie University, Sydney, Austrálie, popisující jej jako „doplněk PROTein vyjádřený genomem“. [2] Termín je zevšeobecněním pojmu genom zahrnout soubor všech proteinů, které mohou být produkovány genomem skrz alternativní sestřih a post-transkripční modifikace z messenger RNA.[3]

Kariéra

Wilkins držel postdoktorandské stipendium v ​​letech 1995–1997 na University of Geneva, Švýcarsko, ve spolupráci s profesorem Denisem Hochstrasserem a Dr. Amos Bairoch. Spoluvyvinul mnoho nástrojů pro analýzu proteinů dostupných na internetu EXPASY webový server. Následně působil jako vedoucí postdoktorand v australském Proteome Analysis Facility, který byl založen australskou vládou v roce 1995 jako první specializované výzkumné středisko proteomu na světě.[4]

V roce 1997 spoluautorem první knihy proteomika „Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics“ (Wilkins et al. (Eds), Springer Verlag ), kterých se prodalo více než 4 000 výtisků.[5]

Byl spoluzakladatelem proteomické společnosti Proteome Systems Ltd. Byla založena v lednu 1999 a na australské burze cenných papírů byla uvedena v roce 2004. Dr. Wilkins pracoval v Proteome Systems na plný úvazek po dobu 6 let jako vedoucí jejího bioinformatického výzkumu a Vývojový tým poté jako vedoucí proteomiky. Bylo oceněno IBM „Rookie of the Year Award“ pro společnosti v asijsko-pacifickém regionu v roce 2003. Společnost Proteome Systems byla přejmenována na Tyrian Diagnostics[6] a nakonec se zbavila své IP. V roce 2007 Wilkins spoluzaložil společnost Regeneus pro regenerativní medicínu.[7] Tato společnost vyvinula léčbu osteoartrózy pomocí dospělých kmenových buněk, které jsou nyní v klinických studiích.

Wilkins je v současné době profesorem systémové biologie na University of New South Wales,[8] a je ředitelem iniciativy Systems Biology Initiative[9] a Ramaciottiho centrum pro genomiku.[10] Publikoval více než 200 výzkumných prací a kapitol knih.[11] Jeho současný výzkum se týká role methylace proteinů v eukaryotické buňce, použití síťové hmotnostní spektrometrie (XL-MS) pro analýzu proteinových interakčních sítí v měřítku proteomu ( interakční ) a bioinformatická analýza sekvenčních dat nové generace. Jako součást konsorcia genomu koala provedl jeho tým veškeré sekvenování PacBio s dlouhým čtením a poté sestavu založenou na Falconu, aby vygeneroval nejkompletnější a souvislý genom vačnatce. [12]

V roce 2012 získal Wilkins cenu Beckman Coulter Discovery Science Award od Australské společnosti pro biochemii a molekulární biologii.[13] Tato cena se uděluje členovi za významné příspěvky v oblasti biochemie a molekulární biologie. University of New South Wales udělila Wilkinsovi v roce 2018 doktor věd (D. Sc.).

Reference

  1. ^ Wilkins, Marc R .; Sanchez, Jean-Charles; Gooley, Andrew A .; Appel, Ron D .; Humphery-Smith, Ian; Hochstrasser, Denis F .; Williams, Keith L. (1996). „Pokrok v proteinových projektech: Proč by měly být identifikovány všechny proteiny exprimované genomem a jak na to“. Recenze biotechnologií a genetického inženýrství. 13 (1): 19–50. doi:10.1080/02648725.1996.10647923.
  2. ^ Wilkins, Marc R .; Pasquali, Christian; Appel, Ron D .; Ou, Keli; Golaz, Olivier; Sanchez, Jean-Charles; Yan, červen X .; Gooley, Andrew. A.; Hughes, Graham; Humphery-Smith, Ian; Williams, Keith L .; Hochstrasser, Denis F. (1. ledna 1996). „Od proteinů k proteinům: identifikace proteinů ve velkém měřítku pomocí dvourozměrné elektroforézy a analýzy aminokyselin“. Přírodní biotechnologie. 14 (1): 61–65. doi:10.1038 / nbt0196-61. PMID  9636313.
  3. ^ Wasinger a kol. Pokrok v mapování genových produktů Mollicutes: Mycoplasma genitalium
  4. ^ APAF - Australian Proteome Research Facility
  5. ^ Wilkins a kol. (Eds.) Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics
  6. ^ "Tyrian Diagnostics Pty Ltd. "
  7. ^ Regeneus Pty Ltd.
  8. ^ Marc Wilkins - profil výzkumného pracovníka UNSW
  9. ^ Systémová biologická iniciativa
  10. ^ Ramaciottiho centrum pro genomiku
  11. ^ Marc Wilkins - seznam publikací UNSW
  12. ^ Johnson, RN; O'Meally, D; Chen, Z; Etherington, GJ; Ho, SYW; Nash, WJ; Grueber, CE; Cheng, Y; Whittington, CM; Dennison, S; Peel, E; Haerty, W; O'Neill, RJ; Colgan, D; Russell, TL; Alquezar-Planas, DE; Attenbrow, V; Bragg, JG; Brandies, PA; Chong, AY; Deakin, JE; Di Palma, F; Duda, Z; Eldridge, MDB; Ewart, KM; Hogg, CJ; Frankham, GJ; Georges, A; Gillett, AK; Govendir, M; Greenwood, AD; Hayakawa, T; Helgen, KM; Hobbs, M; Holleley, CE; Heider, TN; Jones, EA; King, A; Madden, D; Graves, JAM; Morris, KM; Neaves, LE; Patel, HR; Polkinghorne, A; Renfree, MB; Robin, C; Salinas, R; Tsangaras, K; Waters, PD; Waters, SA; Wright, B; Wilkins, MR; Timms, P; Belov, K (2018). „Adaptační a konzervační poznatky z genomu koaly“. Nat Genet. 50 (8): 1102–1111. doi:10.1038 / s41588-018-0153-5. PMC  6197426. PMID  29967444.
  13. ^ Ocenění ASBMB

externí odkazy