MRPS18B - MRPS18B

MRPS18B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3J9M
Identifikátory
Aliasy	MRPS18B, C6orf14, HSPC183, HumanS18a, MRP-S18-2, MRPS18-2, PTD017, S18amt, mitochondriální ribozomální protein S18B
Externí ID	OMIM: 611982 MGI: 1914223 HomoloGene: 32205 Genové karty: MRPS18B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	30,626,395 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	35,916,389 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka ribozomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• buněčné spojení; • ribozom; • nukleoplazma; • intracelulární; • mitochondriální vnitřní membrána; • mitochondriální malá ribozomální podjednotka; • mitochondrie;
Biologický proces	• mitochondriální translační prodloužení; • biosyntéza bílkovin; • mitochondriální translační ukončení; • mitochondriální překlad;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	28973
	66973
ENSG00000229861; ENSG00000226111; ENSG00000204568; ENSG00000203624; ENSG00000227420;
	ENSG00000233813; ENSG00000223775
	ENSMUSG00000024436
	Q9Y676
	Q99N84
	NM_014046
	NM_025878; NM_001347380; NM_001361453; NM_001361454; NM_001361455
	NP_054765
	NP_001334309; NP_080154; NP_001348382; NP_001348383; NP_001348384
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

28S ribozomální protein S18b, mitochondriální je protein že u lidí je kódován MRPS18B gen.^[5]^[6]

Savčí mitochondriální ribozomální proteiny jsou kódovány jadernými geny a pomáhají při syntéze proteinů uvnitř mitochondrie. Mitochondriální ribozomy (mitoribosomy ) se skládají z malé podjednotky 28S a velké podjednotky 39S. Podle odhadů mají 75% bílkovin rRNA složení ve srovnání s prokaryotický ribozomy, kde je tento poměr obrácen.

Další rozdíl mezi savčími mitoribozomy a prokaryotickými ribozomy je to, že tyto obsahují 5S rRNA. Mezi různými druhy se proteiny obsahující mitoribozom velmi liší v sekvenci a někdy v biochemických vlastnostech, což brání snadnému rozpoznání sekvencí homologie. Tento gen kóduje protein 28S podjednotky, který patří do rodiny ribosomálních proteinů S18P. Kódovaný protein je jedním ze tří, který má významnou sekvenční podobnost s bakteriální Proteiny S18. Primární sekvence tří lidských mitochondriálních proteinů S18 nejsou navzájem více příbuzné, než jsou prokaryotické proteiny S18. Pseudogeny odpovídající tomuto genu se nacházejí na chromozomy 1q a 2q.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000226111, ENSG00000204568, ENSG00000203624, ENSG00000227420, ENSG00000233813, ENSG00000223775 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000229861, ENSG00000226111, ENSG00000204568, ENGG00000204568, ENSG00, ENS00 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024436 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (květen 2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace úplného doplňku přítomných ribozomálních proteinů“. J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MRPS18B mitochondriální ribozomální protein S18B“.

Další čtení

Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Shiina T, Ota M, Shimizu S a kol. (2006). „Rychlá evoluce hlavních genů histokompatibilního komplexu třídy I u primátů generuje u lidí stopovou rozmanitost nových alel onemocnění“. Genetika. 173 (3): 1555–70. doi:10.1534 / genetika.106.057034. PMC 1526686. PMID 16702430.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Zhang Z, Gerstein M (2003). "Identifikace a charakterizace více než 100 mitochondriálních ribozomálních proteinových pseudogenů v lidském genomu". Genomika. 81 (5): 468–80. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID 12706105.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Suzuki T, Terasaki M, Takemoto-Hori C a kol. (2001). „Proteomická analýza mitochondriálního ribosomu savců. Identifikace proteinových složek v malé podjednotce 28 S.“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. doi:10,1074 / jbc.M103236200. PMID 11402041.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000226111, ENSG00000204568, ENSG00000203624, ENSG00000227420, ENSG00000233813, ENSG00000223775 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000229861, ENSG00000226111, ENSG00000204568, ENGG00000204568, ENSG00, ENS00 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024436 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11279123-5] Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (květen 2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace úplného doplňku přítomných ribozomálních proteinů“. J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: MRPS18B mitochondriální ribozomální protein S18B“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]