2. BŘEZNA - MARCH2

2. BŘEZNA
Identifikátory
Aliasy	2. BŘEZNA, MARCH-II, RNF172, HSPC240, prsten spojený s membránou - prst typu CH 2, MARCH2
Externí ID	OMIM: 613332 MGI: 1925915 HomoloGene: 9539 Genové karty: 2. BŘEZNA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	8,439,017 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	33,718,670 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • lysozomální membrána; • endosom; • lysozom; • endosomová membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • cytoplazmatický váček; • membrána; • endoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• endocytóza; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51257
	224703
	ENSG00000099785
	ENSMUSG00000079557
	Q9P0N8
	Q99M02
NM_001005415; NM_001005416; NM_016496; NM_001369776; NM_001369777;
	NM_001369778; NM_001369779
	NM_001252480; NM_145486
NP_001005415; NP_001005416; NP_057580; NP_001356705; NP_001356706;
	NP_001356707; NP_001356708
	NP_001239409; NP_663461
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza MARCH2 je enzym že u lidí je kódován 2. BŘEZNA gen.^[5]^[6]^[7] Je členem rodiny MARCH E3 ligáz a hraje důležitou roli v obrat z membránové proteiny.^[8]

Chyba názvu genu v aplikaci Excel

Stejně jako ostatní BŘEZEN a septin geny, při analýze genetických dat obsahujících gen MARCH2 v Microsoft Excel.^[9] Je to způsobeno tím, že funkce automatického opravy aplikace Excel zpracovává gen MARCH jako datum a převádí jej na standardní formát data. Původní text nelze v důsledku převodu obnovit. Studie z roku 2016 zjistila, že až 19,6% všech prací ve vybraných časopisech bylo ovlivněno chybou názvu genu.^[10] Tomuto problému lze zabránit použitím aliasového jména, například MARCHF2, předřazením apostrofem (') nebo předformátováním buňky jako textu.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099785 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079557 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ Bartee E, Mansouri M, Hovey Nerenberg BT, Gouveia K, Früh K (únor 2004). "Downregulace hlavního histokompatibilního komplexu třídy I lidskými ubikvitinovými ligázami souvisejícími s virovými imunitními úniky". Journal of Virology. 78 (3): 1109–20. doi:10.1128 / JVI.78.3.1109-1120.2004. PMC 321412. PMID 14722266.
^ „Entrez Gene: MARCH2 membránový prsten (C3HC4) 2“.
^ Zhang Y, Lu J, Liu X (květen 2018). „MARCH2 je při infekci HIV-1 upregulován a inhibuje produkci HIV-1 translokací nebo degradací obalového proteinu“. Virologie. 518: 293–300. doi:10.1016 / j.virol.2018.02.003. PMID 29573664.
^ Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan WM a kol. (Červen 2004). „Chybné identifikátory: Při použití aplikace Excel v bioinformatice mohou být omylem zavedeny chyby genových jmen.“. BMC bioinformatika. 5 (1): 80. doi:10.1186/1471-2105-5-80. PMC 459209. PMID 15214961.
^ Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (srpen 2016). „Chyby ve jménech genů jsou ve vědecké literatuře rozšířené“. Genome Biology. 17 (1): 177. doi:10.1186 / s13059-016-1044-7. PMC 4994289. PMID 27552985.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Nakamura N, Fukuda H, Kato A, Hirose S (duben 2005). „MARCH-II je protein vázající syntaxin-6 podílející se na endosomálním obchodování“. Molekulární biologie buňky. 16 (4): 1696–710. doi:10,1091 / mbc.E04-03-0216. PMC 1073653. PMID 15689499.
Fukuda H, Nakamura N, Hirose S (leden 2006). „MARCH-III je nová složka endozomů s vlastnostmi podobnými vlastnostem z MARCH-II“. Journal of Biochemistry. 139 (1): 137–45. doi:10.1093 / jb / mvj012. PMID 16428329.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099785 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079557 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11042152-5] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

[pmid14722266-6] Bartee E, Mansouri M, Hovey Nerenberg BT, Gouveia K, Früh K (únor 2004). "Downregulace hlavního histokompatibilního komplexu třídy I lidskými ubikvitinovými ligázami souvisejícími s virovými imunitními úniky". Journal of Virology. 78 (3): 1109–20. doi:10.1128 / JVI.78.3.1109-1120.2004. PMC 321412. PMID 14722266.

[entrez-7] „Entrez Gene: MARCH2 membránový prsten (C3HC4) 2“.

[Zhang_2018-8] Zhang Y, Lu J, Liu X (květen 2018). „MARCH2 je při infekci HIV-1 upregulován a inhibuje produkci HIV-1 translokací nebo degradací obalového proteinu“. Virologie. 518: 293–300. doi:10.1016 / j.virol.2018.02.003. PMID 29573664.

[ExcelAteMyDNA-9] Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan WM a kol. (Červen 2004). „Chybné identifikátory: Při použití aplikace Excel v bioinformatice mohou být omylem zavedeny chyby genových jmen.“. BMC bioinformatika. 5 (1): 80. doi:10.1186/1471-2105-5-80. PMC 459209. PMID 15214961.

[10] Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (srpen 2016). „Chyby ve jménech genů jsou ve vědecké literatuře rozšířené“. Genome Biology. 17 (1): 177. doi:10.1186 / s13059-016-1044-7. PMC 4994289. PMID 27552985.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]