Tekutá biopsie - Liquid biopsy
Tekutá biopsie | |
---|---|
Synonyma | Biopsie tekutin |
Účel | analýza nepevné biologické tkáně |
A kapalná biopsie, také známý jako biopsie tekutin nebo biopsie v tekuté fázi, je především odběr a analýza nepevné biologické tkáně krev.[1] Jako tradiční biopsie tento typ techniky se používá hlavně jako diagnostický a monitorovací nástroj pro nemoci, jako je rakovina, s výhodou, že je do značné míry neinvazivní. Proto jej lze také provádět častěji, což může po delší dobu lépe sledovat nádory a mutace. Může být také použit k ověření účinnosti léku na léčbu rakoviny odebráním několika vzorků tekuté biopsie v rozmezí několika týdnů. Tato technologie se také může ukázat jako prospěšná pro sledování pacientů po léčbě relaps.[2]
I když jen Vyhledávání buněk metoda pro výčet cirkulující nádorové buňky u metastatického karcinomu prsu, metastatického tračníku a metastatického karcinomu prostaty byla validována a schválena FDA jako užitečná prognostická metoda,[3] jeho klinická implementace ještě není rozšířená.[4]
Typy
Existuje několik typů metod kapalné biopsie; výběr metody závisí na studovaném stavu.
- Ve studiích rakoviny cirkulující nádorové buňky (CTC) a / nebo cirkulující nádorová DNA (ctDNA) jsou shromažďovány.[5][6]
- V diagnostice infarktu cirkulující endoteliální buňky (CEC) jsou vzorkovány.
- v prenatální diagnostika, bezbuněčná fetální DNA (cffDNA) je extrahována z mateřské krve. Plodová voda lze také extrahovat a analyzovat.
Široká škála biomarkery mohou být studovány za účelem detekce nebo sledování jiných chorob. Například izolace protoporfyrin IX ze vzorků krve lze použít jako diagnostický nástroj pro ateroskleróza.[7] Při studiu centrálního nervového systému mozkomíšní mok mohou být odebrány vzorky místo krve.[8][9]
Jak to funguje
Když nádorové buňky zemřou, uvolní se ctDNA do krve.[10] Mutace rakoviny v ctDNA odrážejí mutace nalezené v tradičních biopsiích nádorů, což umožňuje jejich použití jako molekulárních biomarkerů ke sledování onemocnění.[11] Vědci mohou čistit a poté analyzovat ctDNA pomocí sekvenování nové generace (NGS) nebo metody založené na PCR, jako je digitální PCR.[12] Metody založené na NGS poskytují komplexní pohled na genetickou výbavu rakoviny a jsou obzvláště užitečné při diagnostice, zatímco digitální PCR nabízí cílenější přístup, zvláště vhodný pro detekci minimálního reziduálního onemocnění a pro sledování odpovědi na léčbu a progrese onemocnění.[13][14] Nedávný pokrok v epigenetice rozšířil použití kapalné biopsie k detekci rakoviny v časném stadiu, včetně přístupů, jako je Pravděpodobnost rakoviny v plazmě (CLiP).[15]
Kapalné biopsie mohou detekovat změny v nádorové zátěži měsíce nebo roky před konvenčními zobrazovacími testy, což je činí vhodnými pro včasnou detekci nádoru, monitorování a detekci mutací rezistence.[16][17][18]
Viz také
Reference
- ^ Crowley, Emily; Di Nicolantonio, Federica; Loupakis, Fotios; Bardelli, Alberto (9. července 2013). „Tekutá biopsie: sledování genetiky rakoviny v krvi“. Recenze přírody Klinická onkologie. 10 (8): 472–484. doi:10.1038 / nrclinonc.2013.110. PMID 23836314.
- ^ „Pochopení nepoddajného původu rakoviny pomáhá včasné diagnostice“. Ekonom. Citováno 2017-09-29.
- ^ Karachaliou, N; Mayo-de-Las-Casas, C; Molina-Vila, MA; Rosell, R (březen 2015). „Tekuté biopsie v reálném čase se stávají realitou v léčbě rakoviny“. Annals of Translational Medicine. 3 (3): 36. doi:10.3978 / j.issn.2305-5839.2015.01.16. PMC 4356857. PMID 25815297.
- ^ Gingras, Isabelle; Salgado, Roberto; Ignatiadis, Michail (listopad 2015). „Tekutá biopsie: bude to„ magický nástroj “pro monitorování reakce solidních nádorů na protinádorové terapie?“. Aktuální názor na onkologii. 27 (6): 560–567. doi:10.1097 / CCO.0000000000000223. PMID 26335664.
- ^ Heitzer, E .; Ulz, P .; Geigl, J. B. (11. listopadu 2014). „Cirkulující nádorová DNA jako kapalná biopsie pro rakovinu“. Klinická chemie. 61 (1): 112–123. doi:10.1373 / clinchem.2014.222679. PMID 25388429.
- ^ Wan, Jonathan C. M .; Massie, Charles; Garcia-Corbacho, Javier; Mouliere, Florent; Brenton, James D .; Caldas, Carlos; Pacey, Simon; Baird, Richard; Rosenfeld, Nitzan (24. února 2017). „Tekuté biopsie dospívají: k implementaci cirkulující nádorové DNA“. Nature Reviews Cancer. 17 (4): 223–238. doi:10.1038 / nrc.2017.7. PMID 28233803.
- ^ Nascimento da Silva, Monica; Sicchieri, Letícia Bonfante; Rodrigues de Oliveira Silva, Flávia; Andrade, Maira Franco; Courrol, Lilia Coronato (2014). "Kapalná biopsie aterosklerózy s použitím protoporfyrinu IX jako biomarkeru". Analytik. 139 (6): 1383–8. Bibcode:2014Ana ... 139.1383N. doi:10.1039 / c3an01945d. PMID 24432352.
- ^ Pyykkö, Okko T .; Lumela, Miikka; Rummukainen, Jaana; Nerg, Ossi; Seppälä, Toni T .; Herukka, Sanna-Kaisa; Koivisto, Anne M .; Alafuzoff, Irina; Puli, Lakshman; Savolainen, Sakari; Soininen, Hilkka; Jääskeläinen, Juha E .; Hiltunen, Mikko; Zetterberg, Henrik; Leinonen, Ville; Fiandaca, Massimo S. (17. března 2014). "Biomarker mozkomíšního moku a nálezy mozkové biopsie u idiopatického normálního tlaku hydrocefalu". PLOS ONE. 9 (3): e91974. Bibcode:2014PLoSO ... 991974P. doi:10.1371 / journal.pone.0091974. PMC 3956805. PMID 24638077.
- ^ Mouliere F, Mair R, Chandrananda D, Marass F, Smith CG, Su J, Morris J, Watts C, Brindle KM, Rosenfeld N (2018). „Detekce fragmentace DNA bez buněk a změna počtu kopií v mozkomíšním moku od pacientů s gliomem“. EMBO Mol Med. 10 (12): e9323. doi:10,15252 / emmm.201809323. PMC 6284385. PMID 30401727.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ „Co je to cirkulující nádorová DNA a jak se používá k diagnostice a léčbě rakoviny?“. Národní referenční ústavy pro genetiku zdraví. 5. března 2019. Citováno 12. března 2019.
- ^ „Tekuté biopsie vykazují vysokou korelaci s tkáňovou biopsií pro genetické mutace“. Řízení onkologické praxe. Červenec 2016. Citováno 12. března 2019.
- ^ Picher, Andy.„Liquid Biopsy, Key for Precision Medicine“. Novinky z genetického inženýrství a biotechnologie. 23. července 2018. Citováno 12. března 2019.
- ^ „Liquid Biopsy: Differences Between Technologies“. OncLive. 17. září 2017. Citováno 12. března 2019.
- ^ Ellis, Jen.„dPCR: Vznik digitálního věku“. Biocompare. 7. května 2018. Citováno 12. března 2019.
- ^ van der Pol Y, Mouliere F (2019). „Směrem k včasnému odhalení rakoviny dekódováním epigenetických a environmentálních otisků bezbuněčné DNA“. Rakovinová buňka. 36 (4): 350–368. doi:10.1016 / j.ccell.2019.09.003. PMID 31614115.
- ^ McDowell, Sandy.„Tekuté biopsie: minulost, současnost a budoucnost“. Americká rakovinová společnost. 12. února 2018. Citováno 12. března 2019.
- ^ „Liquid Biopsy: Using DNA in Blood to Detect, Track, and Treat Cancer“. Národní onkologický institut. 8. listopadu 2017. Citováno 12. března 2019.
- ^ Olsson, Eleonor; Winter, Christof (2015). „Sériové monitorování cirkulující nádorové DNA u pacientek s primárním karcinomem prsu za účelem detekce okultního metastatického onemocnění“. EMBO Molekulární medicína. 7 (8): 1034–1047. doi:10,15252 / emmm.201404913. PMC 4551342. PMID 25987569.