Lachancea kluyveri - Lachancea kluyveri
| Lachancea kluyveri | |
|---|---|
Vědecká klasifikace  | |
| Království: | Houby |
| Divize: | Ascomycota |
| Třída: | Saccharomycetes |
| Objednat: | Saccharomycetales |
| Rodina: | Saccharomycetaceae |
| Rod: | Lachancea |
| Druh: | L. kluyveri |
| Binomické jméno | |
| Lachancea kluyveri (Phaff, M.W. Mill. & Shifrine) Kurtzman (2003) | |
| Synonyma | |
| |
Lachancea kluyveri je nekompromisní droždí spojené s ovocnými muškami, slizové toky, půdy a potravin.
Místo výskytu
Stanoviště L. kluyveri není dobře známo, protože bylo zaznamenáno pouze asi 30 izolátů. Předpokládá se však, že je rozšířená z hlediska životního prostředí. Nejprve popsáno jako Saccharomyces kluyveri v roce 1956 od ovocné mušky v Kalifornie,[1] tento druh byl izolován z toků slizu na stromech, půdách v Severní Americe a Evropě,[2][3] a sýry.[4] Rovněž byl označen jako agent šíření mykóza u pacienta s HIV / AIDS.[5]
Biologie
Lachancea kluyveri je nadějné droždí související s Saccharomyces cerevisiae nebo pekařské droždí modelový organismus intenzivně využíván v biochemii, genetice a buněčné biologii. V roce 2003 byl převeden z rodu Saccharomyces do rodu Lachancea pojmenovaný pro kanadského mykologa a biologa kvasinek Marc-André Lachance.[6] Saccharomyces cerevisiae a L. kluyveri mají několik zásadních rozdílů, které vyžadují genomová srovnání. Zaprvé, jako většina typů buněk, L. kluyveri se uchýlí k kvašení (degradující cukry v nepřítomnosti kyslíku) pouze tehdy, když je kyslík omezující. S. cerevisiaena druhé straně upřednostňuje fermentaci i za přítomnosti kyslíku. Tohle znamená tamto L. kluyveri efektivněji využívá glukózu k výrobě energie. Proto, L. kluyveri poskytuje kontrastní model k jedné z nejvíce neobvyklých vlastností S. cerevisiae. Druhý, L. kluyveri má jednodušší genomovou organizaci než S. cerevisiae: zdá se, že se stal druhem před duplikací celého genomu, ke které došlo v linii Saccharomyces. Výsledkem je, že jeho genom je menší (asi 9,5 milionu) základní páry ) než to S. cerevisiae s méně duplikovanými geny. Dodatečně, L. kluyveri se stále více používá jako modelový organismus a pro průmyslové aplikace, jako je produkce bílkovin, protože jeho výtěžek biomasy je vyšší než u S. cerevisiae díky efektivnějšímu využití glukózy.[7]
Informace o sekvenování
| NCBI ID genomu | 69 |
|---|---|
| Ploidy | diploidní |
| Velikost genomu | 12,6 Mb |
| Počet chromozomy | 8 párů |
| Rok dokončení | 2002 |
The L. kluyveri genom byl původně sekvenován v roce 2002 na přibližně 3,5násobné pokrytí brokovnicí celého genomu (WGS).[7]
Reference
- ^ Phaff, H. J .; Miller, M. W .; Shifrine, M. (1956). "Taxonomie kvasinek izolovaných z Drosophila v Yosemitské oblasti Kalifornie “. Antonie van Leeuwenhoek. 22 (2): 145–61. doi:10.1007 / BF02538322. PMID 13340701.
- ^ Miller, M. W .; Phaff, H. J .; Snyder, H. E. (1962). "O výskytu různých druhů kvasinek v přírodě". Mycopathologia et Mycologia Applicata. 16: 1. doi:10.1007 / BF02136176.
- ^ Capriotti, Augusto (1958). "Saccharomyces smittii listopad. Spec. Nový kvas izolovaný z holandské, italské a švédské půdy “. Antonie van Leeuwenhoek. 24: 215. doi:10.1007 / BF02548448.
- ^ Wojtatowicz, M; Chrzanowska, J; Juszczyk, P; Skiba, A; Gdula, A (2001). "Identifikace a biochemické vlastnosti kvasinkové mikroflóry sýru Rokpol". International Journal of Food Microbiology. 69 (1–2): 135–40. doi:10.1016 / S0168-1605 (01) 00582-7. PMID 11589552.
- ^ Pynka, M; Wnuk, A; Bander, D; Syczewska, M; Boroń, A; Prost, B; Wrzecion, S (1998). "Šíření infekce Saccharomyces kluyveri u pacienta s AIDS ". Infekce. 26 (3): 184–6. doi:10.1007 / bf02771850. PMID 9646114.
- ^ Kurtzman, CP (2003). "Fylogenetický popis Saccharomyces, Kluyveromyces a další členové Saccharomycetaceae a návrh nových rodů Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma a Zygotorulaspora". Výzkum kvasinek FEMS. 4 (3): 233–45. doi:10.1016 / S1567-1356 (03) 00175-2. PMID 14654427.
- ^ A b Projekt sekvenování genomu S.kluyveri