LZTR1 - LZTR1
| LZTR1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | LZTR1, BTBD29, LZTR-1, SWNTS2, NS10, regulátor transkripce podobný leucinovému zipu 1, leucinový zip jako regulátor transkripce 1, NS2 | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | OMIM: 600574 MGI: 1914113 HomoloGene: 4925 Genové karty: LZTR1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr 22: 20,98 - 21 Mb | Chr 16: 17,51 - 17,53 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Regulátor transkripce podobný leucinovému zipu 1 je protein že u lidí je kódován LZTR1 gen.[5][6][7]
Gen LZTR1 poskytuje pokyny pro výrobu proteinu ve třídě nadčeledi širokého komplexu, tamtrack & brick-a-bac / poxvirus a zinkového prstu (BTB / POZ). Nadrodina proteinů má širokou škálu funkcí, včetně kondenzace chromatinu během konformace buněčného cyklu. Jiné názvy spojené s genem LZTR jsou: BTBD29, LZTR-1, NS10, NS2, SWNTS2. Tento gen kóduje člena BTB -Kelch nadčeleď. Zpočátku popsán jako domnělý transkripční regulátor založený na slabé homologii k členům základní leucinový zip - podobně jako u rodiny se ukázalo, že kódovaný protein se následně lokalizuje výhradně do sítě Golgi, kde může pomoci stabilizovat golgiho komplex.[7]
Funkce
Na základě své role v několika typech nádorů se předpokládá, že protein LZTR1 působí jako tumor supresor. Supresory nádoru jsou proteiny, které zabraňují příliš rychlému nebo nekontrolovanému růstu a dělení buněk. LZTR1 je nespecifický protein, který se nachází ve všech buňkách uvnitř těla. Předpokládá se, že jde o transkripční regulátor, který je typicky degradován na apoptotických buňkách. Protein bude fosforylován na svých tyrosinových receptorech, které ho zacílí na degradaci. Intracelulárně se proteiny LZTR nacházejí v Golgiho aparátu. Studie naznačují, že protein LZTR1 může pomoci stabilizovat tuto strukturu. Protein LTZR1 by mohl být pravděpodobně spojen s komplexem ubikvitin ligázy CUL3 (ubikvitinová ligáza 3 na bázi Cullin), který pomáhá funkci ničit nepotřebné proteiny v buňce. Bylo také pozorováno, že protein LZTR bude inhibovat signalizaci Ras v membráně snížením afinity k Ras na membránu. Ras patří do rodiny GTPasy které se podílejí na regulaci transkripce a aktivaci enzymů Raf. Molekuly Raf budou kaskádově fosforylovat další molekuly v těle, aby měly široký dopad na buňku. Ke zjištění funkce genu LZTR byly použity studie využívající imunoprecipitaci endogenního LZTR1 následované Western blotem. Zachycením komplexů LZTR1 z intaktních savčích buněk Steklov et al. (2018) identifikovali guanosin trifosfatázu RAS jako substrát pro komplex LZTR1-CUL3.[8]
Gen
Gen LZTR 1 se nachází na chromozomu 22: konkrétněji na dlouhém rameni v 22q11.21. Gen je dlouhý přibližně 16 768 párů bází.
Mutace
Studie zjistily, že mutace v genu LZTR1 byly nalezeny v maligních rakovinných buňkách v nádorech pacientů s glioblastomem. Bylo zjištěno, že tyto mutace jsou somatické, obvykle způsobené faktory prostředí, a ztráta genu LZTR1 je vidět v buňkách, které jsou nekontrolovatelně rozděleny.
DiGeorgeův syndrom
DiGeorgeův syndrom.[7] (známá jako delece 22q11.2) způsobená delecí ve 22. chromozomu. Mezi typické příznaky spojené s DiGeorgeovým syndromem patří specifická struktura obličeje, vrozené srdeční choroby a zpoždění vývoje. Důsledky mutací LTZR1 byly poprvé diagnostikovány u pacientů s DiGeorge. Studie prokázaly, že delece nebo mutace LZTR1 jsou identifikovány u většiny pacientů s diagnostikovaným DiGeorgeovým syndromem. Schopnosti transkripční regulace genu LZTR1 mohou hrát důležitou roli v embryogenezi a jsou pozorovány v několika fetálních orgánech.[9]
Noonanův syndrom
Noonanův syndrom je autosomálně dominantní multisystémová porucha charakterizovaná širokým fenotypovým spektrem zahrnujícím výrazný dysmorfismus obličeje, retardaci postnatálního růstu, nízký vzrůst, ektodermální a skeletální vady, vrozené anomálie srdce, anomálie ledvin, lymfatické malformace, obtíže s krvácením a variabilní kognitivní deficity.
Studie prokázaly, že u 29 genů bylo u pacientů trpících Noonanovým syndromem 163 variant. Ve studii používám V Silco software, byla nejvíce patogenní heterozygotní missense mutace genu LZTR1 na exonu 4.[10] Tato missense mutace povede k substituci alaninu za valin v primární struktuře aminokyseliny pro protein LZTR.
Schwannomatóza
U pacientů se schwannomatózou bylo pozorováno více než padesát různých mutací v genu LZTR1.[11] Samotné tyto mutace nejsou dostatečné k tomu, aby poruchu způsobily, ale jsou s ní obvykle spojeny. Somatické změny faktorů prostředí se projevují také u pacientů se schwannomatózou. Když je gen změněn, protein LTZR nemůže správně fungovat, aby reguloval buněčný cyklus řízením dělení růstu. Tento neregulovaný růst povede k rakovinnému růstu podél Schwannových buněk.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099949 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022761 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Kurahashi H, Akagi K, Inazawa J, Ohta T, Niikawa N, Kayatani F, Sano T, Okada S, Nishisho I (září 1995). "Izolace a charakterizace nového genu odstraněného u DiGeorgeova syndromu". Hum Mol Genet. 4 (4): 541–9. doi:10,1093 / hmg / 4,4,541. PMID 7633402.
- ^ Nacak TG, Leptien K, Fellner D, Augustin HG, Kroll J (únor 2006). „Protein BTB-kelch LZTR-1 je nový protein Golgi, který je degradován indukcí apoptózy“. J Biol Chem. 281 (8): 5065–71. doi:10,1074 / jbc.M509073200. PMID 16356934.
- ^ A b C „Entrez Gene: LZTR1 regulátor transkripce podobný leucinovému zipu 1“.
- ^ „OMIM Entry - * 600574 - LEUCINE ZIPPER-LIKE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR 1; LZTR1“. www.omim.org. Citováno 2019-04-18.
- ^ Kurahashi, H .; Akagi, K .; Inazawa, J .; Ohta, T .; Niikawa, N .; Kayatani, F .; Sano, T .; Okada, S .; Nishisho, I. (duben 1995). "Izolace a charakterizace nového genu odstraněného u DiGeorgeova syndromu". Lidská molekulární genetika. 4 (4): 541–549. doi:10,1093 / hmg / 4,4,541. ISSN 0964-6906. PMID 7633402.
- ^ Reference, Genetics Home. „Noonanův syndrom“. Genetická domácí reference. Citováno 2019-04-18.
- ^ Piotrowski A, Xie J, Liu YF, Poplawski AB, Gomes AR, Madanecki P, Fu C, Crowley MR, Crossman DK, Armstrong L, Babovic-Vuksanovic D, Bergner A, Blakeley JO, Blumenthal AL, Daniels MS, Feit H, Gardner K, Hurst S, Kobelka C, Lee C, Nagy R, Rauen KA, Slopis JM, Suwannarat P, Westman JA, Zanko A, Korf BR, Messiaen LM (prosinec 2013). „Mutace zániku funkce zárodečné linie v LZTR1 predisponují k dědičné poruše více schwannomů“. Nat Genet. 46 (2): 182–7. doi:10,1038 / ng.2855. PMC 4352302. PMID 24362817.
Další čtení
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.